基于RNA-seq的香蕉枯萎病菌Cat1基因敲除突变体分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈亚

作者： 陈亚;郑玉华;彭明;李春强

作者机构：

关键词： 过氧化氢酶;敲除突变体;转录组测序;尖孢镰刀菌古巴专化型;基因表达

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 007 期

页码： 2161-2173

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究通过RNA-seq技术对Δcat1突变体菌株和Foc4野生型菌株的转录组进行了比较分析。为探明Cat1基因敲除后对香蕉枯萎病菌转录组的影响。预测到新转录本2 354个，其中能够预测到基因功能的有1 095个。Cat1基因敲除后，敲除突变体的基因表达相较于野生型菌株发生很大变化。差异表达基因GO功能富集发现，差异基因表达主要体现在蛋白复合物、细胞质组分、细胞蛋白代谢过程、ATP结合和转运活性等相关方面。KEGG分析发现，敲除突变体与野生型菌株的差异表达基因主要集中在核糖体合成、RNA转运，香蕉处理后差异表达基因集中在抗生素生物合成、次生代谢物生物合成等通路。Cat1基因敲除后，一些能量转运酶、加氧酶、氨基酸转移酶活动加强，一些激酶、氧化酶、蛋白酶受香蕉诱导活性增加。Cat1的敲除导致多种糖转运蛋白的大幅下调表达，且大大影响锌脂蛋白和细胞周期蛋白等表达，从而对菌株生命活动和致病力产生影响。Cat1敲除后，其他过氧化氢酶类的表达量补偿性增加，但催化生成过氧化氢的SOD表达也增加，可能是敲除突变体致病力减弱的原因之一。本研究为进一步揭示香蕉枯萎病菌的致病机理提供理论依据。

分类号： S436.68

  • 相关文献

[1]钙对苹果果实超氧化物歧化酶,过氧化氢酶活性及其基因表达的影响. 梁国庆,孙静文,周卫,王秀斌. 2011

[2]镉对玉米幼苗活性氧代谢、超氧化物歧化酶和过氧化氢酶活性及其基因表达的影响. 赵士诚,孙静文,马有志,汪洪,梁国庆. 2008

[3]生防菌sf628对梨叶片苯丙氨酸解氨酶和过氧化物酶活性的影响. 刘邮洲,张磊,钱国良,杜艳,陈志谊,常有宏. 2014

[4]阴沟肠杆菌过氧化氢酶基因的重组表达及酶学性质研究. 周利伟,张艳丽,左冬阳,张伟,张宇宏. 2013

[5]急性盐度胁迫对克氏双锯鱼幼鱼过氧化氢酶的影响. 胡静,吴开畅,叶乐,王雨. 2015

[6]钙对苹果果实超氧化物歧化酶、过氧化氢酶活性及其基因表达的影响. 梁国庆,孙静文,周卫,王秀斌. 2011

[7]水稻白叶枯病菌过氧化氢酶基因表达的定量分析. 胡俊,齐放军,吴茂森,何晨阳. 2006

[8]猕猴桃过氧化氢酶基因家族全基因组鉴定与表达分析. 赖瑞联,冯新,高敏霞,路喻丹,刘晓驰,吴如健,陈义挺. 2023

[9]水分胁迫下水稻对褐飞虱转录组的影响. 谭椰,徐文彦,周文武,鹿东东,商晗武,祝增荣. 2017

[10]四唑虫酰胺对大型溞的急性毒性和毒理. 黄宁,杨旭,张翼飞,金鑫,王秀国,刘通. 2024

[11]家蚕丝腺响应高低温胁迫的转录组分析. 段惠元,卿卓,叶占峰,任晓晓,杨万军,孙运朋,罗泽虎,邢丹,罗朝斌,凡迪. 2023

[12]基于转录组测序的茄子萼下果色光敏相关基因表达分析. 乔军,王利英,刘婧,李素文. 2022

[13]尖镰孢古巴专化型1号生理小种致病相关基因敲除突变体△Focr1-328的生物学特性. 唐改娟,曾涛,曾会才,林妃,郭刚,彭明. 2012

[14]香蕉枯萎病病原菌的研究进展. 李斌,盛鸥,李春雨,魏岳荣,左存武,胡春华,易干军,罗充. 2013

[15]不同抗性香蕉品种根系分泌差异酚酸对尖孢镰刀菌的抑制. 翟子翔,李得铭,邓涛,邓大豪,杨腊英,周游,郭立佳,黄俊生. 2020

[16]拮抗香蕉枯萎病镰刀菌木霉菌株的分离筛选. 吴琳,黄华平,杨腊英,景晓辉,冉长城,韦康,朱利林,张俊芳,黄俊生. 2010

[17]抗感枯萎病香蕉的细胞结构抗性研究. 邝瑞彬,李春雨,杨静,魏岳荣,杨乔松,胡春华,盛鸥,易干军. 2013

[18]香蕉枯萎病菌4号生理小种cat1基因敲除与表型分析. 王小琳,李春强,杨景豪,李文彬,孙建波,彭明. 2017

[19]香蕉枯萎病菌生理小种鉴定及其SCAR标记. 刘景梅,陈霞,王璧生,何自福,彭埃天,蔡曼珊. 2006

[20]含氨基酸水溶肥料对2株芽孢杆菌的激活作用. 郭立佳,汪军,杨腊英,梁昌聪,周游,刘磊,黄俊生. 2020

作者其他论文 更多>>

微信小程序