基于RNA-seq的香蕉枯萎病菌Cat1基因敲除突变体分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 陈亚

作者： 陈亚;郑玉华;彭明;李春强

作者机构：

关键词： 过氧化氢酶;敲除突变体;转录组测序;尖孢镰刀菌古巴专化型;基因表达

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2023 年 007 期

页码： 2161-2173

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究通过RNA-seq技术对Δcat1突变体菌株和Foc4野生型菌株的转录组进行了比较分析。为探明Cat1基因敲除后对香蕉枯萎病菌转录组的影响。预测到新转录本2 354个，其中能够预测到基因功能的有1 095个。Cat1基因敲除后，敲除突变体的基因表达相较于野生型菌株发生很大变化。差异表达基因GO功能富集发现，差异基因表达主要体现在蛋白复合物、细胞质组分、细胞蛋白代谢过程、ATP结合和转运活性等相关方面。KEGG分析发现，敲除突变体与野生型菌株的差异表达基因主要集中在核糖体合成、RNA转运，香蕉处理后差异表达基因集中在抗生素生物合成、次生代谢物生物合成等通路。Cat1基因敲除后，一些能量转运酶、加氧酶、氨基酸转移酶活动加强，一些激酶、氧化酶、蛋白酶受香蕉诱导活性增加。Cat1的敲除导致多种糖转运蛋白的大幅下调表达，且大大影响锌脂蛋白和细胞周期蛋白等表达，从而对菌株生命活动和致病力产生影响。Cat1敲除后，其他过氧化氢酶类的表达量补偿性增加，但催化生成过氧化氢的SOD表达也增加，可能是敲除突变体致病力减弱的原因之一。本研究为进一步揭示香蕉枯萎病菌的致病机理提供理论依据。

分类号： S436.68

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