基于D-loop序列和SSR的从江田鱼与6个鲤群体的遗传分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 张显波

作者: 张显波;傅建军;胡锦丽;朱文彬;闵倩雯;赵飞;吴俣学;董在杰

作者机构:

关键词: 从江田鱼;群体;线粒体D-loop;微卫星;遗传多样性

期刊名称: 贵州农业科学

ISSN: 1001-3601

年卷期: 2021 年 012 期

页码: 76-85

收录情况: 北大核心

摘要: 【目的】探明从江田鱼的遗传背景及其多样性水平,为进一步开展系统选育提供数据参考。【方法】采用D-loop序列和11个SSR标记开展从江田鱼(CJTY)与清水江鲤(QSJ)、太湖鲤(THL)、黄河鲤(HHL)、黑龙江鲤(HLJ)、福瑞鲤(FRL)及松浦镜鲤(SPL)等6个鲤群体的遗传分析。【结果】长度为932 bp的D-loop片段上有46个多态性位点,共定义41个单倍型,其中CJTY有16个单倍型;CJTY的核苷酸遗传多样性π值为0.005,单倍型多样性Hd为0.829,高于FRL和SPL,但低于其余4个鲤群体,CJTY的多态信息含量(PIC)为0.82,高于FRL(0.73)和SPL(0.50),但低于其他4个鲤群体,CJTY的期望杂合度(He)为0.90,低于QSJ(0.93)和THL(0.92),高于其他4个鲤群体;遗传分化指数(FST值)显示CJTY与QSJ、THL、HHL、HLJ的分化程度较低,与FRL呈中度遗传分化,与SPL呈高度遗传分化,FRL和SPL各为1个亚群,其余5个群体为1个亚群;群体间遗传距离分析结果与FST结果相符。【结论】从江田鱼的遗传多样性水平高于2个人工选育群体(FRL和SPL),低于4个野生群体(QSJ、THL、HHL和HLJ);从江田鱼具有相对独立的地理分布区域和特定养殖模式等特点,受到一定程度自然选择或人工选择压力,但未经系统选育实践,尚保留较高遗传多样性水平,具有进一步遗传改良的潜力。

分类号: S917.4

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