谷子eIF5A基因家族鉴定与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张杰伟

作者： 张杰伟;秦新月;陈亚娟;刘婧;崔进荣;姚磊;魏建华

作者机构：

关键词： 谷子;eIF5A;基因家族;进化分析

期刊名称： 西南农业学报

ISSN： 1001-4829

年卷期： 2018 年 07 期

页码： 1333-1337

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】本文系统分析了谷子e IF5A基因家族在谷子中如何发挥作用。【方法】利用谷子基因组数据库,运用生物信息学方法,鉴定谷子e IF5A基因家族的基因结构、染色体定位、编码蛋白和磷酸化位点预测,通过序列比对进行进化和分类分析。【结果】谷子含有4个e IF5A基因,均含有4个内显子,分布于谷子的3条染色体上。MEME保守基序分析显示,谷子e IF5A蛋白均含有1个保守的DNA结合寡核苷酸结合结构域(PF01287)。磷酸化位点预测分析表明谷子e IF5A蛋白均含有大量潜在磷酸化位点。【结论】以上结果将为今后揭示谷子e IF5A蛋白功能提供重要的线索。

分类号： S515

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