红麻基因组WRKY家族成员的鉴定及其在镉胁迫下的表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 李辉

作者： 李辉;陈安国;唐慧娟;栾明宝

作者机构：

关键词： 红麻;镉胁迫;WRKY基因家族

期刊名称： 农业生物技术学报

ISSN： 1674-7968

年卷期： 2024 年 32 卷 010 期

页码： 2243-2254

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 重金属镉污染农田的修复是世界性的难题.红麻(Hibiscus cannabinus)耐逆性强,可用于镉污染农田的修复.为了探索红麻WRKY家族成员对镉胁迫的响应模式,本研究利用HMMER和BLAST软件在红麻基因组中鉴定获得HcWRKY家族成员,并通过ExPasy在线网站获得了HcWRKY家族成员的分子信息,同时利用TBtools v1.6软件将家族成员全部定位到相应染色体上.结果表明,33个HcWRKY家族成员不均匀地分布在12条染色体上,其理化性质,如氨基酸数量、蛋白质分子量和理论等电点各不相同.除HcWRKY4-2位于细胞质外,其他HcWRKY成员均定位于细胞核内.系统发育分析表明,33个HcWRKY蛋白分为4组:其中第Ⅱ组和第Ⅳ组仅含HcWRKY家族成员;第Ⅰ组和Ⅲ组同时含有HcWRKY和AtWRKY家族成员.实时荧光定量PCR分析表明,受镉胁迫诱导表达的HcWRKY家族成员有24个.在红麻响应镉胁迫反应过程中22个HcWRKY家族成员基因表达量上调,2个HcWRKY家族成员基因表达量下调.这可能是红麻耐镉能力强的一个重要因素.本研究结果为进一步探索HcWRKY基因家族在红麻响应镉胁迫过程中的生物学功能提供了基础资料.

分类号： S563.5

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