不同遗传背景猪群体黏病毒耐药蛋白1基因多态性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 张立春

作者： 张立春;李兆华;李梦姝;孙福亮;曹阳;朴庆林;金海国;张树敏

作者机构：

关键词： 黏病毒耐药蛋白1基因;民猪;大白猪;野杂猪;基因多态性

期刊名称： 中国畜牧兽医

ISSN： 1671-7236

年卷期： 2017 年 44 卷 04 期

页码： 1046-1053

收录情况： 北大核心

摘要： 为探讨不同遗传背景猪黏病毒耐药蛋白1(myxovirus resistance,Mx1)基因的遗传多态性,本试验采用RT-PCR方法扩增克隆出猪Mx1基因并进行生物信息学分析,采用高分辨率熔解曲线法(HRM)对民猪、长白山野猪与民猪杂交猪(简称野杂猪)和大白猪3个群体Mx1基因外显子2区多态性进行分析。结果显示,从民猪及野杂猪中成功克隆出4条Mx1基因mRNA序列。该序列含有1个1 992bp的完整开放阅读框(ORF),编码663个氨基酸。比较发现4条Mx1基因序列中共含有30个SNPs位点,其中17个SNPs位点引起了氨基酸序列的变异。功能结构域分析发现,大部分氨基酸突变位点位于Mx1基因功能结构域两侧。HRM多态性分析显示,Mx1基因外显子2区DD基因型作为优势基因型在3个群体中具有最高的基因型频率,其中大白猪中DD基因型频率为100%,野杂猪为62.5%,民猪为56.2%。基因多态性分析还发现该区域存在更多的核苷酸及氨基酸突变位点,表明民猪和野杂猪Mx1基因存在更丰富的基因多态性。

分类号： S828

  • 相关文献

[1]不同遗传背景猪TNF-α基因启动子区多态性与其血清含量的关联分析. 李梦姝,孙福亮,柳俭强,曹阳,李兆华,金海国,张立春. 2019

[2]不同遗传背景猪PBD-110基因多态性及表达谱分析. 刘艳光,罗新惠,柳俭强,贾琪,肖成,曹阳,金海国,张立春. 2021

[3]不同品种猪PBD-119基因的克隆与差异表达研究. 刘艳光,张珈溯,罗新惠,柳检强,金海国,夏广军,曹阳,张立春. 2020

[4]不同品种猪 PBD-124基因多态性及差异表达研究. 高倍瑶,刘艳光,贾琪,柳俭强,罗新惠,张立春. 2022

[5]寒冷季节热休克蛋白70、90在不同遗传背景猪群体中差异分析. 张立春,魏天,李兆华,曹阳,张全,丁德,金鑫,张树敏,金海国. 2016

[6]黑龙江省规模化猪场ESR基因多态性检测分析. 张冬杰,曹越,汪亮,刘娣. 2017

[7]不同粗纤维饲喂水平对民猪、大白猪部分血液生化指标影响研究. 王文涛. 2015

[8]寒冷条件下民猪耐寒表现的比较研究. 刘自广,刘娣,王文涛,彭福刚,郭镇华,汪亮,田明,付博,崔野,张多,钟荣珍,房义,胡娟,肖龑,何鑫淼. 2019

[9]长白山野杂猪、民猪和大白猪血常规及免疫学指标比较分析. 张立春,李兆华,孙福亮,曹阳,张全,丁德,金鑫,金海国,张树敏. 2018

[10]利用WGCNA方法分析猪胚胎期骨骼肌发育相关共表达网络的研究. 岳静伟,崔雪霞,王立贤,张龙超. 2022

[11]低温对猪肌肉和肝脏组织线粒体数量的影响. 张冬杰,李忠秋,汪亮,王文涛,何鑫淼,刘娣. 2018

[12]猪脊椎数性状全基因组关联研究及候选基因分析. 张龙超,王立刚,刘欣,岳静伟,颜华,赵克斌,梁晶,蒲蕾,张跃博,王立贤. 2015

[13]基于重测序的民猪与大白猪SLAⅠ类基因多态性及抗病潜能差异分析. 李婧娜,疏泽,吴俊超,程锋,王立刚,王立贤. 2021

[14]民猪与大白猪肠道菌群的比较研究. 张冬杰,张跃灵,王文涛,刘娣. 2018

[15]民猪和大白猪不同肌球蛋白重链表达差异. 李忠秋,刘春龙,马红,张冬杰,孙金艳,付博,汪亮,彭福刚,郭镇华,吴赛辉,刘娣. 2019

[16]低温环境对猪不同肌肉组织线粒体的影响. 张冬杰,汪亮,李忠秋,王文涛,何鑫淼,吴赛辉,刘娣. 2017

[17]黑龙江省规模化猪场种猪RYRⅠ基因多态性检测分析. 张冬杰,曹越,何鑫淼,汪亮,刘娣. 2016

[18]民猪与大白猪胴体和肉质性状的比较研究. 李忠秋,刘春龙,吴赛辉,何鑫淼,王文涛,张海峰,刘自广,田明,亓美玉,何海娟,陈赫书,张冬杰,刘娣. 2024

[19]民猪FoxN1基因的表达规律及对低温应答反应. 张冬杰,李苓,王鑫鑫,汪亮,杨国伟,刘娣. 2017

[20]民猪与大白猪背最长肌能量代谢关键酶活性研究. 李忠秋,刘春龙,吴赛辉,张冬杰,王文涛,何鑫淼,田明,亓美玉,何海娟,刘娣. 2022

作者其他论文 更多>>

微信小程序