南海野生斑节对虾的线粒体16S rRNA基因序列单倍型分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 周发林

作者： 周发林;江世贵;姜永杰;黄建华

作者机构：

关键词： mtDNA;16S rRNA;斑节对虾;单倍型

期刊名称： 生态学杂志

ISSN： 1000-4890

年卷期： 2008 年 27 卷 11 期

页码： 1955-1959

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用聚合酶链式反应(PCR)技术对我国南海海域5个地点(三亚、深圳、阳江、湛江、北海)的野生斑节对虾100个个体的mtDNA16S rRNA序列进行扩增,扩增产物经纯化后进行测序。用Clustal_X排序软件对所得的100个mtDNA16S rRNA序列进行比对。通过ARLEQUIN软件对所得100个mtDNA16S rRNA序列进行比较分析,共检测出28个变异位点,19种单倍型。19单倍型序列的碱基组成显示出较高的A+T比例(69.0%)。19种单倍型序列的遗传距离在0.002~0.033。根据构建的单倍型进化关系网,5个地点群体中的单倍型呈现一种混杂的分布格局。此外,根据单倍型在5个地点群体出现的频率和单倍型进化关系网,单倍型7是最为原始的单倍型,其他18种单倍型均起源于单倍型7。

分类号： S917.4

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