大白菜GID1家族基因鉴定及表达模式分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 宋晴晴
作者: 宋晴晴;张慧敏;张烨;张一卉;李景娟;李化银;贺立龙;王凤德;高建伟
作者机构:
关键词: 大白菜;GID1基因;生物信息学分析;表达模式分析
期刊名称: 山东农业科学
ISSN: 1001-4942
年卷期: 2020 年 03 期
页码: 1-7
摘要: GID1蛋白是赤霉素信号转导过程中的重要受体,在调控植物生长发育过程中发挥重要作用。本研究采用生物信息学分析方法对大白菜基因组中GID1家族基因进行鉴定,并对该基因结构、染色体分布、系统进化以及表达模式等进行分析。结果表明,大白菜基因组中含有5个GID1家族成员,分别位于4、5、6、7、9号染色体上,各成员都只含有1个内含子。系统进化结果显示,单子叶和双子叶植物的GID1蛋白明显处于两个不同分支,大白菜GID1家族成员与拟南芥GID1具有更近的亲缘关系。通过表达模式以及启动子顺式响应元件分析发现,大白菜GID1基因不仅参与生长发育调控还可能参与对不同环境因子的响应过程。
分类号: S634.1
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