甘蔗Δ~1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(ScP5CS)基因分离及其分析(英文)
文献类型: 中文期刊
第一作者: 黄诚梅
作者: 黄诚梅;杨丽涛;李杨瑞;邓智年;魏源文;潘有强
作者机构: 广西作物遗传改良生物技术重点开实验室;广西作物遗传改良生物技术重点开实验室;中国农业科学院甘蔗研究中心;广西大学农学院
关键词: 甘蔗;P5CS基因;分离与分析;脯氨酸
期刊名称: 广西农业科学
ISSN: 1002-8161
年卷期: 2009 年 40 卷 02 期
页码: 113-119
摘要: 以甘蔗品种ROC22为材料,待甘蔗生长至4~5叶期直接以25%PEG6000淋灌根部模拟水分胁迫。采用同源克隆与RT-PCR法从甘蔗叶片中得到甘蔗Δ1-吡咯啉-5-羧酸合成酶(Saccharum officinarum L.Δ1-pyrroline-5-carboxy-late synthetase,ScP5CS)基因的编码区cDNA序列,其长度为2151 bp,为一个完整的ORF,编码716个氨基酸,GenBank注册号为EU005373。核苷酸序列与前人已注册的甘蔗P5CS(EF155655)相比,同源率达到98%,但推断编码的氨基酸同源率仅为92%。该基因具有P5CS共有的结构域与结合位点:Putative ATP-binding site;Putative leucine domains;Glu-5-kinase domain;Putative NADPH-binding domain;Conserved GSA-DH domain保守区,脯氨酸反馈抑制作用位点。与前人已注册的甘蔗P5CS基因氨基酸序列(ABM30223)比较,在γ-GK保守域(Glu-5-kinase domain)内氨基酸变化较大,而与水稻、小麦的相比,其变化较小。因此,推断为甘蔗P5CS基因家族中的一个新成员。
分类号: S566.1
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