澳洲坚果实时荧光定量PCR分析中内参基因的筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨倩

作者： 杨倩;杨子平;周娅丽;陈东泉;刘恒

作者机构：

关键词： 澳洲坚果;内参基因;实时荧光定量PCR;稳定性分析

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2020 年 008 期

页码： 1505-1512

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 澳洲坚果是重要的热区经济作物,目前国内外尚无关于澳洲坚果实时荧光定量PCR分析内参基因的报道.选择合适的内参基因是提高实时荧光定量PCR分析准确性的先决条件.为筛选澳洲坚果实时定量PCR最适内参基因,以澳洲坚果的根、茎、叶、果皮、果仁为材料,利用实时荧光定量PCR技术,对18S rRNA,Actin,CYP,EF1a,EF1b,GAPDH,MDH,TUBa,TUBb,UBQ,UBC等11个常用的内参基因在澳洲坚果不同组织中的表达稳定性进行了分析.geNorm软件分析的最适内参基因数目为2,最稳定内参组合为MDH和EF1b,TUBa基因的稳定性最差.BestKeeper分析结果认为,MDH基因表达最稳定,EF1b次之,与geNorm结果一致.NormFinder软件稳定性分析显示,GAPDH最稳定,其次是CYP基因;TUBa基因表达最不稳定.ΔCt算法结果表明,18S基因表达最稳定,其次是GAPDH基因,MDH和EF1b排第3和第4.RefFinder综合排序为:MDH>18S>GADPH>EF1b>CYP>UBC>EF1a>Actin>TUBb>UBQ>TUBa.因此,MDH基因在澳洲坚果不同组织中表达最稳定,初步确认可以作为实时荧光定量PCR分析的校正内参基因,在澳洲坚果的基因表达模式分析中具有重要意义.

分类号： S664.9

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