出生后小鼠心肌组织生长发育的转录组分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 朱晓聪
作者: 朱晓聪;王圣楠;蒋琳;刘书琴
作者机构:
关键词: 小鼠;心肌组织;生长发育;转录组分析
期刊名称: 遗传
ISSN: 0253-9772
年卷期: 2025 年 47 卷 010 期
页码: 1132-1145
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 哺乳动物出生后的心脏功能与心肌细胞增殖和肥大密切相关,但涉及调控心肌细胞增殖和肥大的分子机制尚未完全阐明。为此,本研究对7日龄(P7)和3月龄(3m)的C57BL/6雌性小鼠心肌组织进行了表型测定和转录组测序分析,以探究小鼠心肌组织生长发育过程中心肌细胞的变化规律,并筛选影响心肌组织生长发育的关键候选基因。与7日龄相比,3月龄小鼠心脏重量和心肌细胞横截面积均显著增加(P<0.001)。通过转录组测序共鉴定到3,858个差异表达基因(differentially expressed genes,DEGs),其中差异表达上调基因2,021个,差异表达下调基因1,837个。GO功能注释分析结果显示,差异表达基因显著富集于细胞周期、细胞分裂、心脏发育、细胞增殖等条目中。KEGG富集分析结果表明,差异表达基因显著富集于DNA复制、ECM-受体相互作用、细胞周期、代谢途径等信号通路。此外,通过定位筛选到Hey2、Foxm1、Igf1、Xirp2、Sfrp2、Egf、Fgfr2、Tbx20、Fgf1和Igf2等是与小鼠心肌组织生长发育相关的关键候选基因。qRT-PCR验证结果显示,与心肌组织生长发育相关的10个候选基因的表达趋势与RNA-seq结果相一致,说明测序结果的可靠性。本研究结果为进一步揭示小鼠心肌组织生长发育的分子机制提供了新的见解。
分类号: Q344
- 相关文献
[1]ZBED6基因对巴马香猪脾发育的作用机制分析. 王圣楠,王丹丹,田文杰,浦亚斌,潘登科,邢向阳,马月辉,蒋琳. 2021
[2]中国实验小型猪冠心病模型的心肌组织蛋白质组学研究. 苗兰,刘建勋,李欣志,潘映红. 2009
[3]基于RNA-Seq技术的盐胁迫向日葵转录组信息分析. 孙瑞芬,张艳芳,郭树春,于海峰,李素萍,聂惠,乔慧蕾,安玉麟. 2015
[4]旱柳转录组测序及生物学分析. 李敏,郭聪,李玉娟,冯新民,王莹,张健,谈峰. 2019
[5]玉米矮秆突变体A2的表型鉴定及转录组分析. 董春林,翟广谦,张正,杨睿,张明义,张彦琴,杨丽莉,常建忠. 2019
[6]基于转录组挖掘蕉城苦茶苦茶碱合成相关基因. 陈潇敏,王鹏杰,王淑燕,杨如兴,孙君,郭永春,陈雪津,赵峰,叶乃兴. 2021
[7]基于转录组测序的金柑类黄酮糖基转移酶基因的初步分析. 谭嫣,马小迪,王久照,刘小刚,曾明. 2019
[8]'枸头'橙针刺和枝的转录组分析. 孙立方,柯甫志,聂振朋,王平,孙建华,黄秀,徐建国. 2020
[9]肇实转录组测序及生物信息学分析 被引量:1. 王继华,黎俊荣,蔡时可,邓沛飞,钟春燕,刘晓津. 2019
[10]肇实转录组测序及生物信息学分析. 王继华,黎俊荣,蔡时可,邓沛飞,钟春燕,刘晓津. 2019
[11]脊尾白虾对低盐胁迫响应的转录组学分析. 沈晔,王兴强,曹梅,郑年昊,陈百尧,秦传新. 2020
[12]脊尾白虾对低氧响应的转录组学分析. 曹梅,王兴强,秦传新,沈晔,张子杨,钱诗悦. 2021
[13]暹罗芽孢杆菌挥发性物质拮抗下烟草赤星病菌转录组分析. 李艺池,梁金昌,韦承建,王东坤,王卫民,陈勇华,宋光龙,胡希好,程德杰,任广伟,王晓强. 2023
[14]功能雄性不育茄子差异基因及代谢途径分析. 王志敏,袁超,丁泽琴,胡若琳,牛义,汤青林,魏大勇,宋明,王永清,田时炳. 2021
[15]睡莲叶片胎生发育转录组分析. 苏群,田敏,李春牛,李先民,卢家仕,黄展文,李杰梅,卜朝阳,王虹妍. 2021
[16]椰心叶甲啮小蜂转录组分析及基因功能注释. 刘华伟,李朝绪,李芬,吕朝军,吴少英,覃伟权. 2021
[17]水稻幼苗条纹突变体yss1的转录组分析. 周坤能,夏加发,王元垒,马廷臣,李泽福. 2018
[18]荷兰鸢尾‘玉妃’花色变异关键结构基因分析. 林兵,陈艺荃,钟淮钦,叶秀仙,樊荣辉. 2021
[19]第二代测序技术用于水稻和稻瘟菌互作早期转录组的分析. 柏斌,吴俊,邓启云,周波. 2012
[20]水稻叶片响应细菌性条斑病侵染的转录组分析. 施力军,罗登杰,刘芳,李容柏,岑贞陆. 2019
作者其他论文 更多>>
-
miR-376c-5p靶向PIK3CA对前体脂肪细胞脂肪沉积的影响
作者:宋湘怡;曹行;刘武军;蒋琳
关键词:miR-376c-5p;PIK3CA;脂肪沉积
-
我国畜禽种质资源保护现状与展望
作者:李业芳;苏艳芳;王晶;魏新华;赵文轩;余大为;孙研研;贾亚雄;马月辉;侯水生;蒋琳
关键词:畜禽种质资源;资源价值;品种多样性;濒危状况;原位活体保护;异位离体保护
-
宜昌白山羊成年母羊体尺与体重相关性回归分析
作者:王真勍;熊琪;苏鹏;龚颖;李业芳;任千姿;李俊;蒋琳
关键词:宜昌白山羊;回归分析;相关性;体型
-
基于转录组测序分析METTL14对绵羊骨骼肌卫星细胞成肌分化的影响
作者:何思琦;陈倩;蒋琳;马月辉;周胜花;赵倩君
关键词:METTL14;转录组测序;骨骼肌卫星细胞;绵羊;细胞分化
-
基于全基因组重测序对武雪山羊的遗传进化分析
作者:任千姿;张佰忠;王真勍;王向林;龚颖;胡仁科;浦亚斌;苏鹏;李业芳;马月辉;李昊帮;蒋琳
关键词:全基因组重测序;遗传多样性;群体进化;武雪山羊;群体结构
-
绵羊布鲁氏菌病抗病育种研究进展
作者:武上杰;栾园园;王明坤;张贺春;于波;马月辉;蒋琳;何晓红
关键词:布鲁氏菌;免疫逃避;抗病基因;抗病育种
-
基于16S rRNA测序分析敲除基因ZBED6后巴马猪肠道微生物菌群的变化
作者:徐成;田文杰;马月辉;王圣楠;蒋琳;王丹丹
关键词:巴马猪;ZBED6;肠道微生物;SMB53
