烟草苗期立枯病病原菌Rhizoctonia solani AG-1 IB全基因组序列资源（英文）

文献类型： 中文期刊

第一作者： 向立刚

作者： 向立刚;蔡刘体;李文红;余知和;汪汉成;穆青

作者机构：

关键词： 立枯丝核菌;融合群;基因组序列;基因功能;立枯病;烟草

期刊名称： 植物病理学报

ISSN： 0412-0914

年卷期： 2023 年 06 期

页码： 1027-1037

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 立枯丝核菌(Rhizoctonia solani)AG-1 IB融合群是重要的土传病原真菌，可引起烟草苗期立枯病。本研究通过Illumina HiSeq PE 150和Oxford Nanopore PromethION测序平台获得了分离自发病烟草植株的R.solani AG-1 IB LK4菌株的全基因组序列。结果表明，该基因组全长45.9 Mbp,包含112个重叠群。重叠群的N50为0.89 Mbp, GC含量为52.13%。基因组共线性分析结果显示，LK4与其他4个已公开发布基因组序列的R.solani AG-1 IB菌株相比，易位和易位+反转现象更为常见，表明LK4菌株在基因组结构上具有独特性。LK4基因组中共预测到7,978个蛋白编码基因，231个非编码基因以及5,191个重复序列。NR、GO、KEGG、Swiss-Prot、COG、PHI、Signal P、CAZy、DFVF、TCDB和P450数据库被用于蛋白编码基因的分类与注释，其中有7,375个蛋白编码基因至少被上述数据库注释过一次。该基因组的组装和注释对进一步揭示立枯丝核菌的致病机理以及烟草立枯病的防控研究具有重要意义。

分类号： S435.72

  • 相关文献

[1]马铃薯黑痣病立枯丝核菌及其综合防控研究进展. 夏善勇,牛志敏,李庆全,张丽娟,盛万民. 2022

[2]立枯丝核菌不同融合群菌株GPD基因的克隆及序列特征分析. 王艳丽,任衍春,张震,王教瑜,毛雪琴,姜华,邱海萍,柴荣耀,杜新法,孙国昌. 2013

[3]黑龙江省马铃薯黑痣病菌融合群类型分析. 杨帅,郭梅,王文重,魏琪,董学志,毛彦芝,闵凡祥,王玲. 2022

[4]华北地区十字花科芸薹属蔬菜上立枯丝核菌的病原生物学研究. 王朵,谢学文,柴阿丽,石延霞,李宝聚. 2019

[5]新疆6种豆科作物立枯丝核菌菌丝融合群研究. 杨金红,郭庆元,季良. 2005

[6]新疆棉花主栽品种对2种棉花苗期病害抗性分析. 萨吉达木·艾则孜,麦合木提江·米吉提,许泰百,李进,郭庆元. 2018

[7]冬瓜苗期立枯病病原鉴定及防治药剂筛选. 程亮,秦健,黎炎,莫阳朋,李晶莹,吴永官. 2024

[8]美洲商陆抗真菌蛋白转化烟草的研究和抗病性检测. 刘爽,杨爱国,赵琦,赵玉锦,张世煌. 2006

[9]NtPHGPx基因过表达和敲除对烟草苗期耐盐性的影响. 郭鹏诚,杨晓宁,毛辉,王学波,申展,刘旦,杨爱国,王元英. 2021

[10]西南地区玉米纹枯病病菌融合群鉴定和UP-PCR分析. 张小飞,邹成佳,李晓,杨晓蓉,向运佳. 2015

[11]豇豆轻斑驳病毒海南分离物全基因组序列测定及分子特征. 杨晓,张宇,陈莎,李桑桑,龚一诺,张卓,鲁清华,胡荣,刘勇,张德咏. 2019

[12]中国明对虾肝胰腺细小病毒全基因组的克隆及序列分析. 张峥,黄倢,高强,成君军,王明森. 2011

[13]基于全基因序列的中国北方3省(区)马铃薯Y病毒遗传多样性分析. 马俊丰,李小宇,张春雨,周雪平,王永志. 2020

[14]农业生物技术及其产业-中国水稻分子育种的新机遇. 翁建峰,苏宁,万建民. 2009

[15]水貂犬瘟热CDV_3疫苗株基因组序列测定及H基因遗传稳定性分析. 赵建军,柴秀丽,王凤雪,邵西群,陈涛. 2009

[16]甘薯卷叶病毒江苏分离物基因组全长序列测定及其外壳蛋白基因在大肠杆菌中的表达. 乔贞贞,秦艳红,乔奇,张德胜,田雨婷,高洁,张振臣. 2012

[17]巨桉miRNA及其靶基因生物信息学预测. 李崇奇,沈文涛,言普,黎小瑛,周鹏. 2014

[18]黄地老虎颗粒体病毒cDNA文库的构建. 张伟,王玮,艾秀莲,谢玉清,冯怀蓉. 2003

[19]鸡传染性支气管炎病毒ck/CH/LHLJ/090908株的基因组特性研究. 陈玲凤,韩宗玺,邵昱昊,孔宪刚,刘胜旺. 2014

[20]水稻小GTP蛋白基因Osrab5B基因的克隆和鉴定. 林慧贤,刘筱斌,李发强,罗文永,刘良式. 2001

作者其他论文 更多>>

微信小程序