细粒棘球蚴TSP1和TSP6基因的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘田莉

作者： 刘田莉;孟庆玲;乔军;陈诚;马玉;胡政香;才学鹏;陈创夫

作者机构：

关键词： 细粒棘球蚴;抗原基因;基因克隆;生物信息学分析

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2015 年 30 卷 02 期

页码： 41-46

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了研究绵羊细粒棘球蚴重要抗原基因Tetraspanin 1-TSP1(TSP1)和Tetraspanin 1-TSP6(TSP6)的功能,对Gen Bank中Eg基因组数据库检索,获得TSP1和TSP6的c DNA序列并设计特异性引物。以Eg头节为总RNA模板,进行RT-PCR,将PCR产物克隆到p MD19-T载体后测序并进行生物信息学分析。TSP1 c DNA全长792个核苷酸,编码263个氨基酸,该多肽含有3个潜在的N端糖基化位点,2个N端酰基化位点,与已登录的标准株TSP1基因序列(EG_11043)同源性为98.99%,其推导的氨基酸序列同源性为98.48%;TSP6 c DNA全长666个核苷酸,编码221个氨基酸,该多肽含有5个N端酰基化位点,1个酪氨酸激酶磷酸化位点,与已登录的标准株TSP6基因序列(EG_00715)同源性为98.18%,其推导的氨基酸序列同源性为85.07%。运用分子生物学软件对Eg TSP1和TSP6基因进行生物信息学分析,预测已知序列的蛋白质抗原的结构和表位,为疫苗的研发奠定了前期基础。

分类号： Q78

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