利用RNA-seq技术筛选大白猪皮下和肌内脂肪组织差异表达基因

文献类型： 中文期刊

第一作者： 黄万龙

作者： 黄万龙;张秀秀;李嫒;苗向阳

作者机构：

关键词： 肌内脂肪;皮下脂肪;脂质代谢;MAPK信号通路;猪;RNA-seq

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2017 年 06 期

页码： 501-511

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了比较分析大白猪皮下和肌内脂肪组织的全转录组数据,探究调控脂肪沉积的分子机制,本文采用RNA-seq技术和生物信息学方法鉴定大白猪皮下和肌内脂肪组织基因表达谱,对差异表达基因进行GO(Gene Ontology)分析、信号通路富集分析以及蛋白互作网络分析。大白猪皮下和肌内脂肪组织中有180个基因差异表达,上调基因主要参与细胞增殖、脂质激酶活性和磷脂代谢等与脂质代谢相关的生物学过程正调控,下调基因显著富集于脂肪细胞分化中起重要调控作用的MAPK信号转导通路。差异表达基因主要通过参与脂质代谢及通过MAPK信号转导通路调控脂肪细胞成脂分化,进而影响大白猪皮下和肌内脂肪的沉积。

分类号： S828

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