江苏水稻黑条矮缩病病毒的RT-PCR分析和快速检测

文献类型： 中文期刊

第一作者： 杨杰

作者： 杨杰;王军;周彤;陈志德;仲维功

作者机构：

关键词： 水稻黑条矮缩病;RT-PCR;病毒检测

期刊名称： 华北农学报

ISSN： 1000-7091

年卷期： 2008 年 23 卷 06 期

页码： 91-96

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了明确江苏新发生的矮缩病害为水稻黑条矮缩病,采用RT-PCR和序列测定方法对其病原进行了精确鉴定。根据水稻黑条矮缩病病毒基因组序列的信息,设计扩增RNA聚合酶基因、外壳蛋白基因和RNA沉默抑制子基因以及核心蛋白基因部分编码区的4对引物,提取感染水稻黑条矮缩病病毒的水稻植株总RNA并进行RT-PCR扩增,可以在感病植株中分别扩增出水稻黑条矮缩病病毒基因组特有的4个条带,测序结果表明,来源于江苏南京的分离物的4个基因部分编码片段与已登录的对应基因片段核苷酸序列同源性达99%以上,共发现7个碱基的突变。经生物信息学分析发现7个单碱基突变都是同义突变,氨基酸序列没有改变。根据以上结果确认该病病原为水稻黑条矮缩病病毒。利用该方法可以对水稻和其他寄主进行早期病毒检测。

分类号： S435.111.4

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