籼稻种子抗老化关键模块及候选基因的鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 葛蓉

作者： 葛蓉;罗永坚;李清;贾俊婷;刘军;王建龙

作者机构：

关键词： 籼稻;剪接体;胚胎发育;核糖体;种子寿命;活性氧

期刊名称： 种子

ISSN： 1001-4705

年卷期： 2024 年 43 卷 010 期

页码： 1-12

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 种子自成熟起便要经历老化过程，导致其活力不可逆下降甚至完全丧失，给农业生产造成重大损失。籼稻比粳稻具有更强的耐贮藏性，虽然已经克隆出一些抗老化基因，但参与籼稻种子抗老化过程的关键基因及其调控机制尚不清楚。本研究对Kasalath基因型水稻种子(籼稻)在8个老化阶段(0、4、8、10、12、15、22、28 d)进行了转录组学分析。结果表明，随着老化时间的延长，基因表达水平逐渐下降，总体FPKM差异不显著。鉴定出6 517个差异表达基因，KEGG富集分析显示，差异表达基因在剪接体、DNA复制、碱基切除修复、核糖体、内质网蛋白质加工和泛素介导的蛋白质水解等代谢通路显著富集。加权基因共表达网络分析共生成24个模块，其中绿松石色、蓝色、灰色和棕色模块与种子老化阶段显著相关。这些模块与核酸、蛋白质损伤修复系统和可溶性糖的调节有关。此外，还鉴定出75个中心基因，包括OsLTPL67、OsERF-1、OsLEA4、OsSMP、OsGRX2、OsDOG1L-3和OsGRX14,在水稻种子老化网络中发挥重要作用。这些发现为研究种子老化的调控机制提供了更广阔的视角，并为水稻育种提供了丰富的潜在靶基因。

分类号： S511.21

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