高粱SBP-box基因家族全基因组鉴定及表达分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 常建忠

作者： 常建忠;闫凤霞;乔麟轶;郑军;张福耀;柳青山

作者机构：

关键词： 高粱;SBP-box基因家族;系统进化分析;表达分析

期刊名称： 遗传

ISSN： 0253-9772

年卷期： 2016 年 38 卷 06 期

页码： 569-580

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： SQUAMOSA PROMOTER BINDING PROTEIN box(SBP-box)基因家族编码一类绿色植物特有的转录因子,其功能涉及作物遗传改良的许多方面,如产量、株型、抗逆性等,具有重要的实际应用价值。本研究通过生物信息学方法从高粱(Sorghum bicolor L.)全基因组中鉴定出18个SBP-box基因,分布于9条染色体上,其中8个基因位于基因组重复区域。系统发育分析表明高粱SBP-box基因家族可分为6个亚家族,其中Sb SBP12、Sb SBP3和Sb SBP15分别与玉米Zm LG1、Zm TGA1和Zm UB2/3直系同源。基于RNA-seq数据的表达分析发现高粱SBP-box基因在花序原基中表达量最高,Sb SBP9和Sb SBP17为花序原基特异表达基因,Sb SBP5、Sb SBP8和Sb SBP18等基因受外源ABA和PEG胁迫上调表达,表明SBP-box基因可能参与高粱对非生物逆境的响应。本研究为高粱SBP-box家族重要基因的克隆提供了参考,相关基因可作为高粱遗传改良的候选基因。

分类号： Q943.2`S514

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