西藏米拉山土壤古菌16SrRNA及amoA基因多样性分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孟祥伟

作者： 孟祥伟;茆振川;陈国华;杨宇红;谢丙炎

作者机构：

关键词： 古菌;16SrRNA基因;amoA基因;系统发育分析

期刊名称： 微生物学报

ISSN：

年卷期： 2009 年 08 期

页码： 994-1002

收录情况： CSCD

摘要： 【目的】本研究旨在了解西藏米拉山高寒草甸土壤中古菌及氨氧化古菌群落结构组成情况。【方法】采用未培养技术直接从土壤中提取微生物总DNA,分别利用通用引物构建古菌16SrRNA基因和氨氧化古菌amoA基因克隆文库。利用DOTUR软件将古菌和氨氧化古菌序列按照相似性97%的标准分成若干个可操作分类单元(OTUs)。【结果】通过构建系统发育树,表明古菌16SrRNA基因克隆文库包括泉古菌门和未分类的古菌两大类,并且所有泉古菌均属于热变形菌纲。氨氧化古菌amoA基因克隆文库中序列均为泉古菌。古菌16SrRNA基因和古菌amoA基因克隆文库分别包括64个OTUs和75个OTUs。【结论】西藏米拉山高寒草甸...

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