油菜抗病相关ESTs和抗病机制的初步分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘胜毅

作者： 刘胜毅;毛晗;苏震;董彩华;徐文英;冀瑞琴;郭学兰

作者机构：

关键词： 抗病机制;ESTs;公共数据库;蛋白数据库;除污染;同源性比对;诱导处理;病毒病害;系统抗性;smart

期刊名称： 2005植物分子育种国际学术研讨会论文集

ISSN：

年卷期： 2005 年

页码： 1

收录情况： CSCD

摘要： 为了分析油菜的抗病性分子机制,我们构建了经4种不同化学药剂及菌核病诱导处理的油菜幼叶smartcDNA文库。经过循环冗余差减去除冗余cDNA序列后,对整个文库进行测序分析,将长度大于350bp的EST序列经过载体,核糖体RNA,线粒体屏蔽去除污染后对其进行拼接,共得到Unigene(或U-niqueEST)8955条。将这组数据与公共数据库中的拟南芥蛋白序列库,油菜EST序列,以及植物cDNA库进行同源性比对分析。结果表明,7769条Unigene序列与拟南芥序列同源,7942条序列与植物cDNA序列同源,5983条序列与GenBank中已有的油菜EST序列同源...

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