黄芪属物种叶绿体基因组蛋白编码基因密码子偏好性分析

文献类型: 中文期刊

第一作者: 李事超

作者: 李事超;赵诚贵;姜永成;武自念;田春育;马晖玲

作者机构:

关键词: 黄芪属;叶绿体基因组;密码子使用偏好性;选择影响;进化发育;最优密码子;系统发育分析

期刊名称: 草业科学

ISSN: 1001-0629

年卷期: 2025 年 42 卷 006 期

页码: 1449-1460

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为阐明黄芪属(Astragalus)物种叶绿体基因组密码子特征及其进化压力,本研究以黄芪属36个物种叶绿体基因组CDS序列为研究对象,对其碱基组成、密码子适应指数、密码子使用偏好性、密码子偏性指数、最优密码子使用频率、有效密码子数及其之间的相关性进行了一系列分析,并利用平均值及标准差的方式对53个蛋白编码基因的遗传多样性进行了评价。结果表明,黄芪属物种叶绿体基因组密码子倾向使用以A/U结尾的密码子,且自然选择为影响密码子使用的主要因素,突变压力也会对其产生影响。研究结果可为黄芪属物种的进化和系统发育提供参考。

分类号: Q943

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