鹿科与牛科动物IGF-1基因序列比较及分子进化分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 宋兴超

作者： 宋兴超;徐超;王雷;巴恒星;王桂武;杨福合

作者机构：

关键词： 鹿科;牛科;胰岛素样生长因子-1基因;序列比较;密码子

期刊名称： 家畜生态学报

ISSN： 1673-1182

年卷期： 2014 年 35 卷 03 期

页码： 20-24

摘要： 以GenBank中已登录的梅花鹿(Cervus nippon)、马鹿(Cervus elaphus)、普通牛(Bos taurus)、水牛(Bubalus bubalis)、山羊(Capra hircus)和绵羊(Ovis aries)胰岛素样生长因子-1(IGF-1)基因mRNA序列为研究材料,通过DNAStar 7.0等生物信息学软件对6个物种的IGF-1基因进行序列比较及分子进化分析。结果表明:鹿科与牛科动物IGF-1基因编码区均为465bp,并且碱基组成表现为G>C>A>T,且G+C含量高于A+T;6个物种IGF-1基因密码子第1位富含A,密码子第2位4种碱基的分布相对均匀,密码子的第3位碱基C含量较高;编码区碱基序列中共检测到20个变异位点,包括10个单一变异和10个简约变异,鹿科和牛科动物IGF-1基因核苷酸和氨基酸序列的相似性均较高;(4)NJ和UPGMA两种方法构建的分子进化树均把6个物种聚为2个大类:鹿科和牛科,其中牛科又分支出牛亚科和羊亚科两类。

分类号： S825`S823

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