贵州辣椒脉斑驳病毒的检测及株系分化研究

文献类型： 中文期刊

第一作者： 王莉爽

作者： 王莉爽;陈小均;何海永;谭清群;陈文;黄露;杨学辉

作者机构：

关键词： 辣椒;辣椒脉斑驳病毒;株系分化;贵州

期刊名称： 南方农业学报

ISSN： 2095-1191

年卷期： 2017 年 07 期

页码： 1220-1224

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 【目的】明确贵州辣椒脉斑驳病毒(Chilli veinal mottle virus,Chi VMV)的分布和遗传进化情况,为该病毒的基因功能及其与宿主植物互作关系研究提供科学依据。【方法】采用反转录PCR(RT-PCR)对采自贵州贵阳、遵义、黔西和大方的疑似Chi VMV辣椒样品进行扩增并测序;运用DNAMAN和MEGA对Chi VMV CP基因和和3'-UTR进行序列拼接及分析,并构建系统发育进化树。【结果】从39份疑似Chi VMV辣椒样品中检测出7份阳性样品,检出率为17.95%。将贵州Chi VMV株系的部分CP基因和3'-UTR序列在NCBI中进行核苷酸序列比对,发现其与来源于四川辣椒上的Chi VMV株系的同源性最高,为99%,与我国其他省份Chi VMV株系同源性大于90%;构建的系统发育进化树表明贵州株系与四川和云南株系亲缘关系最近。【结论】贵州Chi VMV株系存在明显的株系分化现象。

分类号： S436.418

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