芒果LAR基因的克隆及其表达分析
文献类型: 中文期刊
第一作者: 赵志常
作者: 赵志常;高爱平;黄建峰;罗睿雄;刘宽亮
作者机构:
关键词: 芒果;LAR基因;克隆;表达分析;生物信息学;果实原花色素合成;果皮色泽;作用机制
期刊名称: 江苏农业科学
ISSN: 1002-1302
年卷期: 2018 年 10 期
页码: 31-34
收录情况: 北大核心
摘要: 无色花青素还原酶(leucoanthocyantin reductase,简称LAR)基因是植物原花色素的一个关键基因。本研究根据已经报道的LAR基因的序列设计兼并引物,采用3'RACE和5'RACE方法,从芒果(Mangifera indica)果实中克隆得到1个LAR基因,其全长c DNA序列为1 221 bp。该基因开放阅读框为1 059 bp,编码352个氨基酸,等电点为5.78,分子质量为38.38 ku。利用生物信息学在线分析软件对该蛋白组成成分、疏水性/亲水性、二级结构、功能结构域以及三级结构进行预测和分析。通过系统发育分析发现,该基因编码的蛋白与棉花、葡萄、蓝莓、柿等具有较近的亲缘关系;对不同芒果品种的LAR基因的表达进行分析发现,绿色的桂七品种中表达量较高,而黄色的金煌品种中表达量较低。
分类号: S667.7
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