西瓜TPS家族基因的鉴定、分类与分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 孙梦利

作者： 孙梦利;徐子健;王世豪;江雪飞;孙化鹏;乔飞

作者机构：

关键词： 西瓜;TPS家族基因;全基因组鉴定;表达分析

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 09 期

页码： 2778-2785

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 海藻糖-6-磷酸合成酶(TPS)是海藻糖合成过程的关键酶,与植物抗逆性密切相关。本研究利用西瓜基因组数据库,通过生物信息学对西瓜TPS家族基因进行鉴定分类,基因结构,染色体位置,蛋白结构域、系统进化、基因表达进行分析。研究结果表明:西瓜中TPS家族基因共有7个成员;7个TPS基因分为ClassⅠ和ClassⅡ两类,ClassⅠ包含有2个基因(ClTPS2,ClTPS7),其余为ClassⅡ;染色体定位分析发现,西瓜TPS家族基因成员均单个分布在7条染色体上;蛋白结构域分析显示,西瓜中TPS家族基因具有典型的TPS结构域和TPP结构域;系统进化显示,TPS家族蛋白分为四个类群,西瓜TPS蛋白在三个类群中都有分布,暗示了西瓜TPS蛋白家族成员起源的多样性;表达分析显示,西瓜TPS家族基因对渗透胁迫有不同程度的应答模式。这些研究结果为进一步解析西瓜TPS家族基因的生物学功能以及利用基因工程提高西瓜抗逆性提供了理论指导。

分类号： S651

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