朱顶红实时荧光定量PCR中不同组织器官内参基因的筛选

文献类型： 中文期刊

第一作者： 刘晓婷

作者： 刘晓婷;王顺利;薛璟祺;薛玉前;吕英民;张秀新

作者机构：

关键词： 朱顶红;实时荧光定量PCR;内参基因;EF-1α;GAPDH2

期刊名称： 园艺学报

ISSN： 0513-353X

年卷期： 2018 年 05 期

页码： 919-930

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 以朱顶红(Hippeastrum vittatum)不同组织器官为试验材料,通过实时荧光定量PCR技术检测肌动蛋白基因(ACT)、亲环蛋白基因(CYP)、转录延伸因子基因(EF-1α)、甘油醛–3–磷酸脱氢酶基因(GAPDH、GAPDH2)、α微管蛋白基因(TUA)和β微管蛋白基因(TUB)这7个常用的看家基因的表达水平,并利用ge Norm、Norm Finder和Best Keeper综合评价其表达稳定性。结果表明,EF-1α和GAPDH2的表达水平较高,而且相对稳定;其次为TUB、TUA和GAPDH。ge Norm和Norm Finder软件分析结果显示,在不同组织器官中CYP和GAPDH2的表达稳定性最高,其次是EF-1α;进一步分析表明,CYP的表达稳定性虽然较高,但是其表达丰度较低,故不适合作为内参基因。Best Keeper分析表明,EF-1α和GAPDH2在不同组织器官中的表达稳定性较好。综合分析表明,EF-1α和GAPDH2在所有样品中表达量较高,稳定性较好。以筛选出来的EF-1α、GAPDH2以及EF-1α+GAPDH2作为内参基因检测朱顶红花器官调控基因PI的表达水平,结果表明,以上述两个基因及其组合为内参基因得到的PI表达模式相同,而且在花器官中的表达高于茎盘和根,基本符合PI调控花模型的机理。因此,EF-1α、GAPDH2或EF-1α+GAPDH2可作为朱顶红的内参基因进行相关基因的表达调控研究。

分类号： S682.25

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