基于COⅠ基因序列的长腹剑水蚤系统进化关系
文献类型: 中文期刊
第一作者: 王兴霞
作者: 王兴霞;徐磊;王亮根;陈骁;郑媛媛;王雪辉;杜飞雁
作者机构:
关键词: 系统进化;长腹剑水蚤;COⅠ基因;DNA分类
期刊名称: 海洋学报
ISSN: 0253-4193
年卷期: 2018 年 06 期
页码: 92-103
收录情况: 北大核心 ; CSCD
摘要: 长腹剑水蚤属(Oithona)是广泛分布于海洋近岸和外海海域的中小型桡足类中最为丰富的类群之一,由于个体小且形态差异微小,通过传统的形态学分类法对其进行准确鉴定难度较大。本文对南海分布的长腹剑水蚤属内的5个种,即瘦长腹剑水蚤(O.tenuis)、羽长腹剑水蚤(O.plumifera)、刺长腹剑水蚤(O.setigera)、伪长腹剑水蚤(O.fallax)和长刺长腹剑水蚤(O.longispina)线粒体COⅠ基因序列以及DNA数据库中长腹剑水蚤属其他地区种类COⅠ基因序列进行比较分析,使用ABGD(Automatic Barcode Gap Discovery)和GMYC(Generalized Mixed Yule Coalescent)模型进行物种界定,分析种间种内遗传距离,并构建系统进化关系。结果显示ABGD和GMYC模型均可以很好地对长腹剑水蚤进行种类划分;种内遗传距离为0.0%~1.6%,种间遗传距离为17.7%~44.5%(Kimura 2-parameter双参数模型),表明种间出现较高的分化;贝叶斯系统树和最大似然树进化树结果均表明,简长腹剑水蚤(O.simplex)与其他种类相距较远,羽长腹剑水蚤和拟长腹剑水蚤(O.similis)中存在隐种的分化,分别是我国南海海域和地中海的羽长腹剑水蚤以及朝鲜海峡和北海的拟长腹剑水蚤,种间遗传距离分别为18.6%、22.9%。
分类号: S917.4
- 相关文献
[1]我国部分地方鸡种COⅠ基因多态性及其分子系统进化研究. 屠云洁,高玉时,苏一军,王克华,童海兵. 2011
[2]哈氏仿对虾线粒体16S rRNA和COⅠ基因的序列比较及其与仿对虾属之间的系统进化分析. 毛智超,段亚飞,刘萍,李健,陈萍. 2016
[3]DNA条形码的应用进展及讨论. 武宇鹏,丁亮,李捷,武春生,范仁俊,朱朝东. 2011
[4]南沙群岛海域长腹剑水蚤(Oithona spp.)的种类组成、数量分布及其与环境因子的关系. 杜飞雁,王亮根,王雪辉,宁加佳,谷阳光,李亚芳. 2016
[5]瓦氏雅罗鱼群体基于CO Ⅰ序列的遗传多样性分析. 窦新杰,常玉梅,唐然,孙效文,陶然,王楠,梁利群,张丽霞. 2014
[6]狼山鸡保种群不同世代线粒体COⅠ基因条形码变化规律研究. 屠云洁,束婧婷,章明,苏一军,单艳菊,姬改革,邹剑敏. 2016
[7]中国青凤蝶3个亚种的遗传变异分析. 杨斯琦,王亚楠,王方方,何娅,靳亚丽. 2017
[8]基于COⅠ基因的新入侵害虫番茄潜叶蛾遗传多样性分析. 马琳,李晓维,郭文超,王树明,王田珍,吕要斌. 2021
[9]基于线粒体COⅠ基因的云南野桑蚕进化分析. 张永红,邵榆岚,苏振国,刘敏,廖鹏飞,李平平,白兴荣. 2020
[10]基于COⅠ基因的龟鳖目动物鉴定与分类进化分析. 叶朝阳,李伟,赵建,陈海港,朱新平. 2019
[11]DNA条形码技术在田间常见蓟马种类识别中的应用. 万方浩,张爱兵,闵亮,张桂芬. 2012
[12]苹果蠹蛾线粒体DNA COⅠ基因克隆与序列分析. 冯宏祖,王兰,郭文超,曹玉,杨明禄,刘慧敏,许建军. 2012
[13]基于线粒体COⅠ基因狼山鸡和鹿苑鸡DNA条形编码分析. 薛茂云,高玉时,屠云洁,唐修君,王克华,童海兵. 2009
[14]基于COⅠ基因分析7个罗非鱼群体的遗传变异. 姜冰洁,傅建军,朱文彬,王兰梅,方敏,董在杰. 2019
[15]银鲳3个野生群体线粒体COⅠ基因的序列差异分析. 彭士明,施兆鸿,侯俊利,张浩,赵峰. 2009
[16]利用PCR技术鉴别畜禽肉中鸭源性成分研究. 张晶鑫,高玉时,樊艳凤,唐修君,贾晓旭,顾荣,陆俊贤. 2015
[17]魁蚶(Scapharca broughtonii)不同地理群体的遗传多样性及种群结构. 刘寒苗,吴彪,刘志鸿,杨爱国,周丽青,孙秀俊. 2017
[18]基于线粒体DNACOⅠ基因鉴别畜禽肉中鸡源性成分. 唐修君,樊艳凤,葛庆联,贾晓旭,张静,刘茵茵,张小燕,王珏,高玉时. 2017
[19]不同地理种群的亚洲小车蝗mtDNA COⅠ基因序列及其相互关系. 高书晶,李东伟,刘爱萍,闫志坚,徐林波. 2011
[20]绥芬河三块鱼属"银滩头"洄游群体的分子鉴定. 赵雪飞,梁利群,黄晶,孙博,张立民,常玉梅. 2021
作者其他论文 更多>>
-
可降解地膜分类与研发应用现状
作者:张明明;周迎鑫;陈敬文;徐军;徐静;孙池涛;翁云宣;谭志坚;徐磊;米庆华;郭宝华
关键词:地膜;降解材料;生物降解;应用进展
-
湖南攸县杂交水稻全程机械化制种关键技术示范与效果
作者:谭亮华;庞嘉;莫勇;黎妙;徐磊;凌钊;张青;陈洲利;刘爱民
关键词:杂交水稻;制种;全程机械化;技术示范
-
乡村振兴战略视域下农业科技发展思考
作者:刘春;徐磊
关键词:乡村振兴战略;农业科技;发展;现状
-
安徽新安江水牛mtDNA D-Loop区遗传多样性与系统进化研究
作者:赵拴平;金海;刘峻;李永胜;金磊;李倩;徐磊;贾玉堂
关键词:水牛;线粒体DNA;遗传多样性;单倍型
-
基于顶空气相色谱-离子迁移谱的不同品种香稻米快速鉴别方法
作者:卞景阳;孙兴荣;刘琳帅;邵凯;冯鹏;车野;胡禧熙;顾鑫;徐磊;李杰
关键词:指纹图谱;气相色谱-离子迁移谱;特征风味;香稻米;挥发性成分
-
割手密抗旱相关基因SsREMO-1a的表达与功能分析
作者:洪亚楠;刘洋;姚艳丽;胡小文;徐磊
关键词:割手密;REMO基因;干旱胁迫;定量表达;功能分析
-
平凉红牛生长性能、胴体及肉质性状分析
作者:王秀娟;高翰;李海鹏;高雪;孙宝忠;程强;徐磊;张亚朋;雷元华;魏萌;李三禄;胡俊伟;张长庆;高会江;李俊雅;张路培;陈燕
关键词:平凉红牛;生长性能测定;肉用性能;肉质性状