基于RNA-seq技术的甘蓝型油菜新转录本的鉴定

文献类型： 中文期刊

第一作者： 徐文

作者： 徐文;安素妨;王艳;贾琳琳;鲁丹丹;张莹莹;刘建丰;李保全

作者机构：

关键词： 甘蓝型油菜;转录组测序;新转录本;RNA-seq

期刊名称： 河南农业科学

ISSN： 1004-3268

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 38-42

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 为了鉴定甘蓝型油菜基因组中新的未知转录本,以甘蓝型油菜叶片为材料提取总RNA,构建c DNA文库并使用Illumina双端测序Hiseq 2500平台进行测序。用生物信息学的方法分析高质量的测序reads来鉴定新的未知转录本。结果表明,在甘蓝型油菜基因组已知基因的间隔区共鉴定到7 720个候选新转录本,通过RT-PCR和克隆测序验证了15个新鉴定的转录本。

分类号： S565.4

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