二倍体西瓜及其同源四倍体叶片sRNA表达谱分析

文献类型： 中文期刊

第一作者： 龙娅丽

作者： 龙娅丽;江雪飞;周鹏;徐子健;孙梦利

作者机构：

关键词： miRNA;西瓜;多倍体;抗逆性

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2018 年 04 期

页码： 661-668

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 植物多倍化后的基因表达平衡重建受到sRNA调节,miRNA是植物多倍化中基因表达进行反式调控的主要小分子成员。本研究利用新一代高通量测序对西瓜二倍体(2n)及其同源四倍体(4n)叶片的sRNA进行表达谱测序分析。结果表明:(1)2n中sRNA以21 nt为主,4n中则以24 nt为主。(2)在2n和4n鉴定出已知miRNA分别为110个和172个,新miRNA分别为246和829个,其中差异表达的已知miRNA 205个,新miRNA 815个。(3)GO功能显著性富集分析表明差异表达的miRNA在细胞组成、代谢过程及催化活性上显著富集。(4)KEGG代谢分析表明,差异表达的已知miRNA主要富集在初级代谢和次级代谢途径上,新miRNA则主要富集在植物激素信号转导途径、RNA转运途径和ABC转座子途径上。(5)差异表达的miRNA中与植物抗逆胁迫相关的已知miRNA 25个,新miRNA 62个,且80.46%抗逆miRNA在西瓜二倍体中上调表达,是四倍体中的4倍以上。根据miRNA的负向调控原理推测这些上调表达的miRNA在西瓜二倍体中可能会抑制部分抗逆基因的表达,影响二倍体的抗逆性。本研究在转录后调控调控水平上为西瓜多倍体较二倍体拥有更强抗逆性提供了理论依据,同时对西瓜多倍体及二倍体之间的基因表达谱分析做了补充。

分类号： S651

  • 相关文献

[1]植物多倍化过程中小分子RNA调控基因表达机制研究进展. 赵旭博,李爱丽,毛龙. 2013

[2]甜樱桃矮化砧木矮杰的选育及扦插繁育技术. 朱东姿,王甲威,洪坡,张力思,刘庆忠. 2020

[3]果树多倍化育种研究进展. 王利虎,卢彦琦,苏行,张琼,赵志军,陈敬谊,丁保朋. 2022

[4]不同倍性西瓜原生质体制备与低温耐受性分析. 王静,乔飞,江雪飞,党选民,詹园凤. 2015

[5]冷锻炼对不同倍性西瓜幼苗SOD、POD活性及MDA含量的影响. 刘文革,王鸣,阎志红,赵红. 2004

[6]四倍体与二倍体西瓜苗期接种枯萎病菌生理小种1的抗性差异. 姬万丽,朱红菊,赵胜杰,路绪强,何楠,刘文革. 2018

[7]二倍体和四倍体西瓜的转录组初步分析. 许哲,张晨光,张思远,王先裕,高建昌. 2020

[8]西瓜多倍体育种研究进展. 袁建民,党选民,詹园凤. 2009

[9]不同倍性西瓜组织培养特性比较研究. 阎志红,刘文革,赵胜杰,何楠. 2009

[10]夏秋栽培耐热优质西瓜品种筛选试验. 于利,徐刚,孙艳军,李德翠. 2007

[11]嫁接对西瓜生长及抗逆性影响的研究进展. 赵卫星,徐小利,常高正,李晓慧,杨帆,梁慎. 2011

[12]秋水仙素诱导黑喉石斛多倍体研究. 王爱华,吴青青,杨澜,许红娟,陈之林. 2017

[13]秋水仙素对草莓离体叶片再生和多倍体诱导的影响. 张计育,李国平,乔玉山,王萌,李金凤,章镇. 2009

[14]多倍体大白菜育种研究进展. 刘晓东,曹彩霞,牟金贵,王明秋,刘学岷,王玉海,陈凤敏. 2008

[15]3个甜菜测交组合试验结果分析. 卞桂杰,张景楼,郑毅,黄淑兰. 2007

[16]甜菜丰产型多倍体杂交种吉洮303的选育. 李文,刘迎春,刘革军,张维东,刘建军,郗登宝,王秀飞. 2004

[17]甜菜雄不育多倍体杂交新品种吉甜302的选育. 孙晖,吴淑艳,项国福,韩克飞,风桐,郭世享. 1995

[18]植物多倍体化效应及甘薯多倍体的研究进展. 蒋姣姣,胡健中,孙健英,曹清河,马代夫,韩永华,李宗芸. 2016

[19]甜菜新品种吉甜303的选育. 卞桂杰,王清发,张景楼,郑毅,凤桐,黄淑兰. 2005

[20]金线莲多倍体诱导的初步研究. 蔡文燕,吴水金,潘一山. 2010

作者其他论文 更多>>

微信小程序