Large-scale identification of microsatellites for a major invasive weed, Ageratina adenophora, using the Illumina sequencing technology

文献类型: 外文期刊

第一作者: Liu, P. X.

作者: Liu, P. X.;Deng, P. C.;Lu, Y. Z.;Biradar, S. S.;Du, X. H.;Weining, S.;Nie, X. J.;Liu, P. X.;Deng, P. C.;Lu, Y. Z.;Biradar, S. S.;Du, X. H.;Weining, S.;Wu, A. P.;Wan, F. H.

作者机构:

关键词: crofton weed;invasive weed;molecular marker;microsatellites;next-generation sequencing;Illumina sequencing

期刊名称:WEED RESEARCH ( 影响因子:2.424; 五年影响因子:2.533 )

ISSN:

年卷期:

页码:

收录情况: SCI

摘要: Microsatellites were identified and characterised for a worldwide invasive weed, Ageratina adenophora, based on the Illumina sequencing technology. Using the assembled genomic sequences obtained from the Illumina GAII sequencing platform, a total of 3012 microsatellites were identified, of which mono-, di-, tri-, tetra-, penta-, and hexa-nucleotide repeats were 181 (6.0%), 1379 (45.8%), 1064 (35.3%), 220 (7.3%), 73 (2.4%) and 95 (3.2%) respectively. The AC/GT and GAT/ATC motifs were the most frequent motif types of di-nucleotide and tri-nucleotide repeats respectively. To validate the newly identified simple sequence repeat markers, 15 primer pairs were randomly selected to test in 24 individuals of A.adenophora, and all of these primer sets could amplify PCR products of expected size. Of them, eight loci displayed polymorphism with the number of alleles per locus ranging from two to four and values for observed and expected heterozygosities ranging from 0.042 to 1 and from 0.082 to 0.551, with the averages of 0.578 and 0.371 respectively. These novel microsatellites should be useful for investigation of the genetic structure and genetic diversity between the invasive and native populations of this species.

分类号: S4

  • 相关文献

[1]Transcriptomic Identification of Drought-Related Genes and SSR Markers in Sudan Grass Based on RNA-Seq. Wang, Xia,Huang, Linkai,Zhang, Xinquan,Li, Zhou,Yan, Haidong,Zhu, Yongqun,Lin, Chaowen,Xu, Wenzhi,Luo, Fuxiang,Wang, Xie,Yao, Li,Peng, Dandan,Peng, Jianhua. 2017

[2]De novo assembly and transcriptome analysis of two contrary tillering mutants to learn the mechanisms of tillers outgrowth in switchgrass (Panicum virgatum L.). Kaijie Xu,Fengli Sun,Guaiqiang Chai,Yongfeng Wang,Lili Shi,Shudong Liu,Yajun Xi. 2015

[3]Using Next-Generation Sequencing to Detect Differential Expression Genes in Bradysia odoriphaga after Exposure to Insecticides. Chen, Haoliang,Lin, Lulu,Ali, Farman,Xie, Minghui,Zhang, Guangling,Su, Weihua,Ali, Farman. 2017

[4]The complete chloroplast genome of Arabidopsis lyrata. Wu, Zhiqiang,Gu, Cuihua,Tembrock, Luke R.,Sun, Cheng. 2016

[5]De novo assembly and characterization of the transcriptome of the pancreatic fluke Eurytrema pancreaticum (trematoda: Dicrocoeliidae) using Illumina paired-end sequencing. Liu, Guo-Hua,Xu, Min-Jun,Song, Hui-Qun,Zhu, Xing-Quan,Wang, Chun-Ren,Zhu, Xing-Quan. 2016

[6]Complete mitochondrial genome of the kawakawa tuna Euthynnus affinis. Li, Mingming,Guo, Liang,Yang, Sen,Chen, Xinghan,Meng, Zining,Lin, Haoran,Zhang, Heng. 2016

[7]High-throughput development of simple sequence repeat markers for genetic diversity research in Crambe abyssinica. Qi, Weicong,Lin, Feng,Zhao, Han,Liu, Yuhe,Huang, Bangquan,Cheng, Jihua,Zhang, Wei. 2016

[8]Next-Generation Sequencing from Bulked-Segregant Analysis Accelerates the Simultaneous Identification of Two Qualitative Genes in Soybean. Guo, Yong,Qiu, Li-Juan. 2017

[9]Next-generation sequencing of the mitochondrial genome of Dolichovespula panda (Hymenoptera: Vespidae) with a phylogenetic analysis of Vespidae. Fan, Xu-Lei,Tan, Qing-Qing,Tan, Jiang-Li,Fan, Xu-Lei,Gong, Ya-Jun,Chen, Peng-Yan,Wei, Shu-Jun. 2017

[10]Apple necrotic mosaic virus, a novel ilarvirus from mosaic-diseased apple trees in Japan and China. Yamagishi, Noriko,Yoshikawa, Nobuyuki,Yaegashi, Hajime,Ito, Tsutae,Xing, Fei,Li, Shifang,Xie, Jipeng,Zhou, Tao,Xie, Jipeng,Zhou, Tao.

[11]Comprehensive molecular characterization of a transgenic pig expressing hCD46 gene. Wang, Qin,Liu, Xiaofei,Fu, Wei,Lin, Xiangmei,Shi, Ningning,Pan, Dengke,Shi, Ningning,Shang, Ying,Shang, Ying,Xu, Wentao,Zhao, Yiqiang.

[12]SNP discovery and genotyping using restriction-site-associated DNA sequencing in chickens. Zhai, Zhengxiao,Zhao, Wenjing,He, Chuan,Liu, Shuyun,Meng, He,He, Chuan,Yang, Kaixuan,Tang, Linlin,Huang, Qizhong,Zhang, Yan.

[13]Effects of fumigation with metam-sodium on soil microbial biomass, respiration, nitrogen transformation, bacterial community diversity and genes encoding key enzymes involved in nitrogen cycling. Huang, Bin,Wang, Qiuxia,Li, Yuan,Fang, Wensheng,Han, Dawei,Yan, Dongdong,Guo, Meixia,Cao, Aocheng,Wang, Qiuxia,Li, Yuan,Yan, Dongdong,Guo, Meixia,Cao, Aocheng.

[14]Identification of novel microRNAs in Hevea brasiliensis and computational prediction of their targets. Gebelin, Virginie,Argout, Xavier,Engchuan, Worrawat,Pitollat, Bertrand,Duan, Cuifang,Montoro, Pascal,Leclercq, Julie,Engchuan, Worrawat,Duan, Cuifang. 2012

[15]De novo transcriptome sequencing and analysis of the juvenile and adult stages of Fasciola gigantica. Zhang, Xiao-Xuan,Ma, Jian-Gang,Zhao, Quan,Zhang, Xiao-Xuan,Cong, Wei,Ma, Jian-Gang,Zhu, Xing-Quan,Cong, Wei,Elsheikha, Hany M.,Liu, Guo-Hua,Huang, Wei-Yi,Zhu, Xing-Quan.

[16]Development and Characterization of Novel Microsatellite Markers for the Peach Fruit Moth Carposina sasakii (Lepidoptera: Carposinidae) Using Next-Generation Sequencing. Wang, You-Zhu,Cao, Li-Jun,Wei, Shu-Jun,Wang, You-Zhu,Zhu, Jia-Ying,Cao, Li-Jun. 2016

[17]The development of specific SNP markers for chromosome 14 in cotton using next-generation sequencing. WEI CHEN,JINBO YAO,LI CHU,YAN LI,XIANGMO GUO,YONGSHAN ZHANG. 2014

[18]A case report of pulmonary tritrichomonosis in a pig. Shi, Yuanyuan,Jiang, Wei,Ma, Zhiyong,Qiu, Yafeng. 2017

[19]De novo transcriptomic analysis of the female and male adults of the blood fluke Schistosoma turkestanicum. Chang, Qiao-Cheng,Wang, Chun-Ren,Liu, Guo-Hua,Xu, Min-Jun,Zhu, Xing-Quan,Xu, Min-Jun,Gao, Jun-Feng,Zhu, Xing-Quan. 2016

[20]The small RNA profile in latex from Hevea brasiliensis trees is affected by tapping panel dryness. Gebelin, Virginie,Leclercq, Julie,Argout, Xavier,Sarah, Gautier,Montoro, Pascal,Kuswanhadi,Chaidamsari, Tetty,Hu, Songnian,Yang, Meng,Tang, Chaorong. 2013

作者其他论文 更多>>
  • Global consortium for the classification of fungi and fungus-like taxa

    作者:Hyde, K. D.;Dai, D. Q.;Du, T. Y.;Li, Q.;Liu, X. F.;Tibpromma, S.;Wijayawardene, N. N.;Hyde, K. D.;Absalan, S.;Afshari, N.;Amuhenage, T. B.;Apurillo, C. C. S.;Armand, A.;Asghari, R.;Bera, I;Bhunjun, C. S.;Boonmee, S.;Bundhun, D.;Chaharmiri-Dokhaharani, S.;Chen, C.;Chethana, K. W. T.;Du, T. Y.;Gajanayake, A. J.;Gentekaki, E.;Gomdola, D.;Gomes de Farias, A. R.;Gunarathne, A.;He, S.;Huanraluek, N.;Hurdeal, V. G.;Jayawardena, R. S.;Karimi, O.;Khyaju, S.;Lestari, A. S.;Li, C. J. Y.;Li, H.;Li, L.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Lu, L.;Luangharn, T.;Luo, L.;Ma, J.;Madagammana, A. D.;Mapook, A.;Marasinghe, D. S.;Meng, Q. F.;Mukhopadyay, S.;Noorabadi, M. T.;Norphanphoun, C.;Pem, D.;Perera, R. H.;Phonemany, M.;Phukhamsakda, C.;Phutthacharoen, K.;Rathnayaka, A. R.;Samarakoon, B. C.;Seifollahi, E.;Su, H. L.;Sun, Y. R.;Sysouphanthong, P.;Tan, T. H.;Tang, X.;Tavakol, N. M.;Thiyagaraja, V;Thongklang, N.;Walker, A.;Wannasawang, N.;Wijesinghe, S. N.;Wu, N.;Xiong, Y. R.;Xu, R. F.;Xu, R. J.;Yang, H. D.;Yang, J.;Yang, Y. H.;Yasanthika, E.;Yu, F. M.;Zeng, M.;Zhang, F.;Zhang, J. Y.;Zin, H. H.;Hyde, K. D.;Amuhenage, T. B.;Apurillo, C. C. S.;Armand, A.;Asghari, R.;Bhunjun, C. S.;Boonmee, S.;Bundhun, D.;Chen, C.;Chethana, K. W. T.;Gajanayake, A. J.;Gentekaki, E.;Gomdola, D.;Gunarathne, A.;He, S.;Hurdeal, V. G.;Jayawardena, R. S.;Karimi, O.;Khyaju, S.;Lestari, A. S.;Li, C. J. Y.;Li, H.;Li, L.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Liu, X. F.;Luo, L.;Ma, J.;Madagammana, A. D.;Meng, Q. F.;Mukhopadyay, S.;Pem, D.;Phonemany, M.;Phutthacharoen, K.;Samarakoon, B. C.;Su, H. L.;Sun, Y. R.;Tang, X.;Thongklang, N.;Walker, A.;Wu, N.;Xiong, Y. R.;Xu, R. F.;Xu, R. J.;Yang, H. D.;Yang, Y. H.;Yasanthika, E.;Yu, F. M.;Zeng, M.;Zhang, F.;Zhang, J. Y.;Zin, H. H.;Abdel-Wahab, M. A.;Abdollahzadeh, J.;Abeywickrama, P. D.;Yan, J. Y.;Zhang, W.;Absalan, S.;Afshari, N.;de Silva, N., I;Lumyong, S.;Promputtha, I;Tennakoon, D. S.;Ainsworth, A. M.;Kirk, P. M.;Liimatainen, K.;Akulov, O. Y.;Aleoshin, V. V.;Mikhailov, K., V;Aleoshin, V. V.;Mikhailov, K., V;Al-Sadi, A. M.;Thamodini, G. K.;Alvarado, P.;Alves, A.;Amalfi, M.;De Kesel, A.;Ertz, D.;Haelewaters, D.;Amalfi, M.;Ertz, D.;Amira, Y.;Anderson, J. L.;Antonin, V;Aouali, S.;Aptroot, A.;Apurillo, C. C. S.;Araujo, J. P. M.;Ariyawansa, H. A.;Arumugam, E.;Gunaseelan, S.;Kaliyaperumal, M.;Kezo, K.;Murugadoss, R.;Assis, D. M. A.;Barbosa, R. N.;da Silva, D. K. A.;da Silva, G. A.;da Silva, R. M. F.;da Silva Santos, A. C.;de Oliveira, N. T.;Diniz, A. G.;Gibertoni, T. B.;Machado, A. R.;Malosso, E.;Meiras-Ottoni, A.;Melo, R. F. R.;Mendes-Alvarenga, R. L.;Santiago, A. L. C. M. A.;Souza-Motta, C. M.;Tiago, P., V;Vieira, L. C.;Atienza, V;Garrido-Benavent, I;Avasthi, S.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Bahkali, A. H.;Bhat, D. J.;Jones, E. B. G.;Bakhshi, M.;Zare, R.;Banihashemi, Z.;Bao, D. F.;Luo, Z. L.;Shen, H. W.;Baral, H. O.;Barata, M.;Barata, M.;Barbosa, F. R.;Barreto, R. W.;Thines, M.;Thines, M.;Thines, M.;Belamesiatseva, D. B.;Shabashova, T. G.;Bennett Reuel, M.;dela Cruz, T. E. E.;Bennett Reuel, M.;Bezerra, J. D. P.;Bezerra, J. D. P.;Bezerra, J. L.;Bhat, D. J.;Bianchinotti, M., V;Blaszkowski, J.;Boekhout, T.;Tedersoo, L.;Bonito, G.;Boonyuen, N.;Luangsa-ard, J. J.;Bregant, C.;Linaldeddu, B. T.;Buchanan, P.;Johnston, P. R.;McKenzie, E. H. C.;Burgaud, G.;Jany, J. L.;Burgess, T.;Buyck, B.;Cabarroi-Hernandez, M.;Castro-Jauregui, O.;Cortes-Perez, A.;Guzman-Davalos, L.;Ramirez-Cruz, V;Caceres, M. E. S.;Zhang, J. F.;Cai, L.;Raza, M.;Wei, X. L.;Cai, M. F.;Calabon, M. S.;Calaca, F. J. S.;Calaca, F. J. S.;Callalli, M.;Callalli, M.;Callalli, M.;Camara, M. P. S.;Cano-Lira, J. F.;Cantillo, T.;Cao, B.;He, M. Q.;Liu, F.;Liu, S. L.;Wang, K.;Zhao, R. L.;Zhou, L. W.;Carlavilla, J. R.;Carvalho, A.;Castaneda-Ruiz, R. F.;Castlebury, L.;Catania, M. D., V;Cavalcanti, L. H.;Cazabonne, J.;Cazabonne, J.;Cedeno-Sanchez, M. L.;Chaiwan, N.;Chakraborty, N.;Chaverri, P.;Chaverri, P.;Cheewangkoon, R.;Samarakoon, M. C.;Thiyagaraja, V;Chen, C. Y.;Chen, K. H.;Chen, Q.;Chen, W. H.;Chen, Y. P.;Dissanayake, A. J.;Li, W. L.;Liu, J. K.;Maharachchikumbura, S. S. N.;Tian, Q.;Tian, W. H.;Wu, N.;Yu, X. D.;Yu, Y. X.;Zhang, S. N.;Coleine, C.;Li, C. J. Y.;Selbmann, L.;Conde, T. O.;Corazon-Guivin, M. A.;Corazon-Guivin, M. A.;Costa-Rezende, D. H.;Courtecuisse, R.;Crouch, J. A.;Crous, P. W.;Groenewald, J. Z.;Groenewald, M.;Herandez-Restrepo, M.;Houbraken, J.;Sandoval-Denis, M.;Cui, B. K.;Dai, Y. C.;He, S. H.;Li, Y.;Liu, S.;Liu, Z. B.;Song, C. G.;Sun, Y. F.;Wang, C. G.;Xu, T. M.;Yuan, Y.;Zhang, Q. Y.;Zhang, Y.;Zhao, H.;Zhou, M.;Cui, Y. Y.;Ge, Z-W;He, S.;Li, Y. C.;Luo, L.;Su, H. L.;Wang, X. Y.;Worthy, F. R.;Xu, R. F.;Xu, R. J.;Cui, Y. Y.;Li, Y. C.;Wang, X. Y.;Worthy, F. R.;Wu, G.;da Silva, I. R.;Anderson, J. L.;Fernandes, I;Fryar, S. C.;Damm, U.;Darmostuk, V;Flakus, A.;Janik, P.;Rodriguez-Flakus, P.;Ronikier, A.;Zoha, Daroodi;Das, K.;Das, K.;Davoodian, N.;Davydov, E. A.;Dayarathne, M. C.;Decock, C.;Blondelle, A.;de Groot, M. D.;De Lange, R.;Haelewaters, D.;Santamaria, B.;Schoutteten, N.;Sulistyo, B.;Van Caenegem, W.;de Groot, M. D.;Zamora, J. C.;Karakehian, J. M.;Delgado, G.;Denchev, C. M.;Denchev, T. T.;de Silva, N., I;Tennakoon, D. S.;de Souza, F. A.;Dentinger, B.;Devadatha, B.;Devadatha, B.;Dianese, J. C.;Dima, B.;Dissanayake, L. S.;Dogan, H. H.;Chen, C.;Doilom, M.;Dong, W.;Dong, Z. Y.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Luo, M.;Manawasinghe, I. S.;Xiong, Y. R.;Xu, B.;Yang, Y. H.;Zhang, Y. X.;Dolatabadi, S.;Ma, J.;Nanayakkara, C. M.;Dos Santos, L. A.;Alves-Silva, G.;Drechsler-Santos, E. R.;Dubey, M. K.;Dutta, A. K.;Egidi, E.;Elliott, T. F.;Elshahed, M. S.;Youssef, N. H.;Erdogdu, M.;Etayo, J.;Evans, H. C.;Fan, X. L.;Fan, Y. G.;Fedosova, A. G.;Zhurbenko, M. P.;Fell, J.;Fernandes, I;Fernandes, I;Firmino, A. L.;Fiuza, P. O.;Xu, R.;Fragoso de Souza, C. A.;Frisvad, J. C.;Fryar, S. C.;Gabaldon, T.;Torruella, G.;Gabaldon, T.;Torruella, G.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gannibal, P. B.;Gannibal, P. B.;Garcia, D.;Gene, D. J.;Garcia, D.;Gene, D. J.;Garcia-Sandoval, S. R.;Garcia-Sandoval, S. R.;Senanayake, I. C.;Garzoli, L.;Gautam, A. K.;Wu, H. X.;Ghobad-Nejhad, M.;Giachini, A. J.;Goes-Neto, A.;Galindo, L. J.;Gorjon, S. P.;Goto, B. T.;Granados-Montero, M. M.;Granados-Montero, M. M.;Griffith, G. W.;Grossart, H. P.;Grossart, H. P.;Gueidan, C.;Baschien, C.;Yurkov, A.;Gusmao, L. F. P.;Gutierrez, A. C.;Chen, J.;Haelewaters, D.;Haelewaters, D.;Halling, R.;Halling, R.;Han, Y. F.;Hapuarachchi, K. K.;Zhao, C. L.;Harder, C. B.;Harrington, T. C.;Hattori, T.;Wu, W. P.;Healy, R.;Heredia, G.;Hodge, K. T.;Iturriaga, T.;Holgado-Rojas, M.;Holgado-Rojas, M.;Holgado-Rojas, M.;Hongsanan, S.;Hongsanan, S.;Horak, E.;Horak, E.;Hosoya, T.;Takamatsu, S.;Huang, S. K.;Hur, J. S.;Hustad, V. P.;Iotti, M.;Leonardi, M.;Rossi, W.;Jafar, E.;Xu, R.;Jayalal, R. G. U.;Jayasiri, S. C.;Jayawardena, R. S.;Jeewon, R.;Jeewon, R.;Jin, J.;Zafari, D.;Jones, E. B. G.;Zhang, H.;Justo, A.;Kaishian, P.;Kakishima, M.;Piepenbring, M.;Kang, G. P.;Tan, T. H.;Kang, G. P.;Tan, T. H.;Kang, J. C.;Karpov, S. A.;Karunarathna, S. C.;Kaufmann, M.;Kemler, M.;Kirchmair, M.;Neuhauser, S.;Peintner, U.;Zucconi, L.;Kitaura, M. J.;Klawonn, I;Kolarik, M.;Kong, A.;Kuhar, F.;Kukwa, M.;Kumar, S.;Kusan, I;Matocec, N.;Mesic, A.;Posta, A.;Tkalcec, Z.;Lado, C.;Larsson, K. H.;Larsson, K. H.;Latha, K. P. D.;Leontyev, D. L.;Leontyev, D. L.;Lestari, A. S.;Li, D. W.;Li, H. Y.;Li, L.;Lu, Y. Z.;Ma, J.;Zhang, J. Y.;Li, Q. R.;Wurzbacher, C.;Xiao, Y. P.;Lee, H. B.;Wijayawardene, N. N.;Lim, Y. W.;Lim, Y. W.;Lin, C. G.;Linde, C. C.;Liu, N. G.;Liu, N. G.;Liu, X. Y.;Liu, X. Z.;Wisitrassameewong, K.;Lumbsch, H. T.;Lumyong, S.;Lumyong, S.;White, J. F.;Zeng, N. K.;Madrid, H.;Magurno, F.;Magyar, D.;Mahadevan, N.;Mahadevan, N.;Maharachchikumbura, S. S. N.;Maimaiti, Y.;Raza, M.;Manamgoda, D. S.;Udayanga, D.;Wartchow, F.;Mardones, M.;Cedeno-Sanchez, M. L.;Marin-Felix, Y.;Stadler, M.;Cedeno-Sanchez, M. L.;Marin-Felix, Y.;Stadler, M.;Marquez, R.;Masigol, H.;May, T. W.;Yuan, H. S.;Mendieta, S.;Meng, Q. F.;Menkis, A.;Menolli, N., Jr.;Nascimento, C. C.;Silva-Filho, A. G. S.;Meza Calvo, J. G.;Miller, S. L.;Moncada, B.;Moncada, B.;Moncalvo, J. M.;Moncalvo, J. M.;Monteiro, J. S.;Monteiro, J. S.;Monteiro, M.;Mora-Montes, H. M.;Moreau, P. A.;Mueller, G. M.;Nagy, L. G.;Najafiniya, M.;Nascimento, C. C.;Nei, Y.;Neves, M. A.;Niego, A. G. T.;Nilsson, R. H.;Niskanen, T.;Niveiro, N.;Noordeloos, M. E.;Noordeloos, M. E.;Nunez Otano, N. B.;O'Donnell, R. P.;Oehl, F.;Olariaga, I;Orlando, O. P.;Pang, K. L.;Pang, K. L.;Papp, V;Pawlowska, J.;Pereira, O. L.;Perera, R. H.;Perera, R. H.;Perez-Moreno, J.;Perez-Ortega, S.;Peter, G.;Phillips, A. J. L.;Jeronimo, G. H.;Jesus, A. L.;Pires-Zottarelli, C. L. A.;Poinar, G.;Prieto, M.;Quandt, C. A.;Radek, R.;Rahnama, K.;Raj, K. N. A.;Rajeshkumar, K. C.;Sruthi, O. P.;Rama, T.;Rama, T.;Rambold, G.;Rasconi, S.;Ren, G. C.;Ren, G. C.;Robledo, G. L.;Flakus, A.;Rodriguez-Flakus, P.;Ryberg, M.;Ryvarden, L. R.;Salvador-Montoya, C. A.;Samant, B.;Sanchez-Castro, I;Sanchez-Garcia, M.;Sarma, V. V.;Savchenko, A.;Savchenko, K.;Saxena, R. K.;Scholler, M.;Selbmann, L.;Selcuk, F.;Senanayake, I. C.;Shen, Y. M.;Simmons, D. R.;Singh, R.;Sir, E. B.;Yu, Q.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stephenson, S. L.;Strassert, J. F. H.;Su, L.;Su, L.;Suetrong, S.;Norphanphoun, C.;Sun, Y. R.;Wang, Y.;Zeng, X. Y.;Svantesson, S.;Svantesson, S.;Takamatsu, S.;Tanaka, K.;Tang, A. M. C.;Tang, X.;Wei, D. P.;Tanney, J. B.;Taylor, J. E.;Taylor, P. W. J.;Tedersoo, L.;Zhang, F.;Zhang, J. F.;Thiyagaraja, V;Wanasinghe, D. N.;Tibell, L.;Tibell, S.;Tomsovsky, M.;Toome-Heller, M.;Yakovchenko, L.;Yang, H. D.;Yang, Z. L.;Yu, F. M.;Zeng, M.;Zhao, Q.;Tsurykau, A.;Tsurykau, A.;Untereiner, W. A.;Uzunov, B. A.;Valle, L. G.;Van den Wyngaert, S.;Van Vooren, N.;Velez, P.;Verma, R. K.;Vieira, W. A. S.;Vizzini, A.;Walker, A. K.;Yapa, N.;Joshi, Y.;Wang, S. X.;Wijesundara, D. S. A.;Xu, L. J.;Yu, Z. F.

    关键词:classification; nomenclature; scientific criticism; taxonomy

  • Refined families of Dothideomycetes: Dothideomycetidae and Pleosporomycetidae

    作者:Hongsanan, S.;Zheng, J. S.;Liu, G. L.;Xie, N.;Hongsanan, S.;Hyde, K. D.;Phookamsak, R.;Boonmee, S.;Liu, N. G.;Tennakoon, D. S.;Pem, D. S.;Karunarathna, A.;Manawasinghe, I. S.;Jayasiri, S. C.;Sandamali, D. S.;Jayawardena, R. S.;Ekanayaka, A. H.;Zeng, X. Y.;Tian, Q.;Phukhamsakda, C.;Chethana, K. W. T.;Samarakoon, M. C.;Bao, D. F.;Senwanna, C.;Wijesinghe, S. N.;Konta, S.;Zhang, S. N.;Jiang, H. B.;Zhang, J. F.;Norphanphoun, C.;Thiyagaraja, V;Harishchandra, D.;Aluthmuhandiram, J. V. S.;Abeywickrama, P. D.;Bundhun, D.;Mapook, A.;Monkai, J.;Chaiwan, N.;Yang, J.;Rathnayaka, A. R.;Bhunjun, C. S.;Hyde, K. D.;Phookamsak, R.;Wanasinghe, D. N.;Karunarathna, A.;Tibpromma, S.;Doilom, M.;Jiang, H. B.;de Silva, N., I;Thiyagaraja, V;Chaiwan, N.;Xu, J. C.;Phookamsak, R.;Wanasinghe, D. N.;Karunarathna, A.;Tibpromma, S.;Doilom, M.;Jiang, H. B.;Thiyagaraja, V;Xu, J. C.;Phookamsak, R.;Wanasinghe, D. N.;Tibpromma, S.;Doilom, M.;Xu, J. C.;Hongsanan, S.;Karunarathna, A.;Bao, D. F.;Senwanna, C.;Zhang, S. N.;de Silva, N., I;Thiyagaraja, V;Bundhun, D.;Hyde, K. D.;Manawasinghe, I. S.;Phookamsak, R.;McKenzie, E. H. C.;Sarma, V. V.;Niranjan, M.;Boonmee, S.;Tennakoon, D. S.;Pem, D. S.;Sandamali, D. S.;Jayawardena, R. S.;Chethana, K. W. T.;Wijesinghe, S. N.;Konta, S.;Jiang, H. B.;Harishchandra, D.;Aluthmuhandiram, J. V. S.;Abeywickrama, P. D.;Chomnunti, P.;Rathnayaka, A. R.;Bhunjun, C. S.;Luecking, R.;Bhat, D. J.;Liu, N. G.;Liu, N. G.;Yang, J.;Dissanayake, A. J.;Liu, J. K.;Jiang, S. H.;Jones, E. B. G.;Jiang, S. H.;Jones, E. B. G.;Phillips, A. J. L.;Manawasinghe, I. S.;Harishchandra, D.;Aluthmuhandiram, J. V. S.;Abeywickrama, P. D.;Wijayawardene, N. N.;Dai, D. Q.;Jeewon, R.;Lu, Y. Z.;Zeng, X. Y.;Zeng, X. Y.;Luo, Z. L.;Bao, D. F.;Thambugala, K. M.;Ertz, D.;Ertz, D.;Perez-Ortega, S.;Suija, A.;Zeng, X. Y.;Wijesinghe, S. N.;Dayarathne, M. C.;Ariyawansa, H. A.;Phookamsak, R.;Wanasinghe, D. N.;Tibpromma, S.;Doilom, M.;Xu, J. C.;Niranjan, M.;Zhang, J. F.;Zhang, H.;Bezerra, J. D. P.;Miranda-Gonzalez, R.;Aptroot, A.;Kashiwadani, H.;Serusiaux, E.;Wu, H. X.;Moon, K. H.;Gueidan, C.;Schumm, F.;Samarakoon, M. C.;Suetrong, S.;Suetrong, S.;Karunarathna, A.;Sandamali, D. S.;Rathnayaka, A. R.;Feng, Y.

    关键词:6 new taxa; Capnodiales; Dothideales; Gloniales; Hysteriales; Myriangiales; Mytilinidiales; new family; new genera; new species; Pleosporales; Phylogeny; Taxonomy

  • Outline of Fungi and fungus-like taxa

    作者:Wijayawardene, N. N.;Dai, D. Q.;Tang, L. Z.;Hyde, K. D.;Phookamsak, R.;Tian, Q.;Boonmee, S.;Gentekaki, E.;Ekanayaka, A. H.;Al-Ani, L. K. T.;Al-Ani, L. K. T.;Tedersoo, L.;Haelewaters, D.;Haelewaters, D.;Haelewaters, D.;Haelewaters, D.;Rajeshkumar, K. C.;Rajeshkumar, K. C.;Sharma, B.;Khare, R.;Gaikwad, S.;Zhao, R. L.;He, M. Q.;Raza, M.;Zhao, R. L.;He, M. Q.;Aptroot, A.;Leontyev, D., V;Saxena, R. K.;Tokarev, Y. S.;Issi, I., V;Letcher, P. M.;Stephenson, S. L.;Ertz, D.;Ertz, D.;Lumbsch, H. T.;Kukwa, M.;Madrid, H.;Phillips, A. J. L.;Selbmann, L.;Selbmann, L.;Pfliegler, W. P.;Horvath, E.;Bensch, K.;Bensch, K.;Kirk, P. M.;Kolarikova, K.;Raja, H. A.;Radek, R.;Papp, V;Dima, B.;Ma, J.;Malosso, E.;Takamatsu, S.;Takamatsu, S.;Rambold, G.;Gannibal, P. B.;Triebel, D.;Gautam, A. K.;Avasthi, S.;Suetrong, S.;Suetrong, S.;Somrithipol, S.;Timdal, E.;Fryar, S. C.;Delgado, G.;Reblova, M.;Doilom, M.;Dolatabadi, S.;Pawlowska, J. Z.;Humber, R. A.;Kodsueb, R.;Sanchez-Castro, I;Goto, B. T.;Jobim, K.;Silva, D. K. A.;de Souza, F. A.;Oehl, F. R.;da Silva, G. A.;Silva, I. R.;Maia, L. C.;Blaszkowski, J.;Barbosa, F. R.;Fiuza, P. O.;Divakar, P. K.;Shenoy, B. D.;Castaneda-Ruiz, R. F.;Lateef, A. A.;Doilom, M.;Karunarathna, S. C.;Tibpromma, S.;Mortimer, P. E.;Wanasinghe, D. N.;Phookamsak, R.;Xu, J.;Doilom, M.;Karunarathna, S. C.;Tibpromma, S.;Mortimer, P. E.;Wanasinghe, D. N.;Phookamsak, R.;Xu, J.;Doilom, M.;Karunarathna, S. C.;Tibpromma, S.;Mortimer, P. E.;Wanasinghe, D. N.;Phookamsak, R.;Xu, J.;Phookamsak, R.;Xu, J.;Wang, Y.;Tian, F.;Dayarathne, M. C.;Alvarado, P.;Li, D. W.;Kusan, I;Matocec, N.;Mesic, A.;Tkalcec, Z.;Maharachchikumbura, S. S. N.;Dissanayake, A. J.;Liu, J. K.;Papizadeh, M.;Heredia, G.;Wartchow, F.;Bakhshi, M.;Boehm, E.;Youssef, N.;Hustad, V. P.;Lawrey, J. D.;Santiago, A. L. C. M. A.;Bezerra, J. D. P.;Souza-Motta, C. M.;Firmino, A. L.;Houbraken, J.;Hongsanan, S.;Tanaka, K.;Monteiro, J. S.;Grossart, H. P.;Grossart, H. P.;Suija, A.;Weerakoon, G.;Etayo, J.;Tsurykau, A.;Tsurykau, A.;Vazquez, V.;Vazquez, V.;Mungai, P.;Damm, U.;Li, Q. R.;Zhang, H.;Lu, Y. Z.;Lu, Y. Z.;Becerra, A. G.;Kendrick, B.;Brearley, F. Q.;Motiejunaite, J.;Wijesundara, D. S. A.;Flakus, A.;Rodriguez-Flakus, P.;Zhurbenko, M. P.;McKenzie, E. H. C.;Stadler, M.;Stadler, M.;Bhat, D. J.;Jeewon, R.;Nassonova, E. S.;Prieto, M.;Jayalal, R. G. U.;Erdogdu, M.;Yurkov, A.;Schnittler, M.;Shchepin, O. N.;Novozhilov, Y. K.;Silva-Filho, A. G. S.;Liu, P.;Cavender, J. C.;Kang, Y.;Kang, Y.;Mohammad, S.;Zhang, L. F.;Xu, R. F.;Li, Y. M.;Wen, T. C.;Wen, T. C.;Dissanayake, L. S.;Deng, C. Y.;Pereira, O. L.;Navathe, S.;Hawksworth, D. L.;Hawksworth, D. L.;Hawksworth, D. L.;Fan, X. L.;Kuhnert, E.;Kuhnert, E.;Thines, M.;Thines, M.

    关键词:Four new taxa; Ascomycota; Amblyosporida ord. nov.; Basal clades; Basidiomycota; Classification; Emendation; Microsporidia; Neopereziida ord. nov.; Ovavesiculida ord. nov.; Protosporangiaceae fam. nov.; Redonographaceae stat nov.

  • Mycosphere notes 169-224

    作者:Hyde, K. D.;Dayarathne, M. C.;de Silva, N., I;Huang, S. K.;Jayasiri, S. C.;Jiang, H. B.;Karunarathna, A.;Tennakoon, D. S.;Wanasinghe, D. N.;Hyde, K. D.;Chaiwan, N.;Norphanphoun, C.;Boonmee, S.;Chethana, K. W. T.;Dayarathne, M. C.;de Silva, N., I;Dissanayake, A. J.;Ekanayaka, A. H.;Hongsanan, S.;Huang, S. K.;Jayasiri, S. C.;Jayawardena, R. S.;Jiang, H. B.;Karunarathna, A.;Lin, C. G.;Liu, N. G.;Lu, Y. Z.;Luo, Z. L.;Manawasinghe, I. S.;Pem, D.;Perera, R. H.;Phukhamsakda, C.;Samarakoon, M. C.;Senwanna, C.;Shang, Q. J.;Tennakoon, D. S.;Thambugala, K. M.;Tibpromma, S.;Wanasinghe, D. N.;Xiao, Y. P.;Yang, J.;Zeng, X. Y.;Zhang, J. F.;Zhang, S. N.;Zhao, Q.;Camporesi, E.;Camporesi, E.;Norphanphoun, C.;Huang, S. K.;Lu, Y. Z.;Xiao, Y. P.;Zeng, X. Y.;Kang, J. C.;Wen, T. C.;Karunarathna, A.;Liu, J. K.;Senwanna, C.;Zhang, S. N.;Cheewangkoon, R.;de Silva, N., I;Samarakoon, M. C.;Lumyong, S.;Lumyong, S.;McKenzie, E. H. C.;Luo, Z. L.;Chethana, K. W. T.;Manawasinghe, I. S.;Yan, J. Y.;Maharachchimbura, S. S. N.;Liu, N. G.;Zhang, J. F.;Liu, J. K.;Liu, N. G.;Perera, R. H.;Yang, J.;Zhang, S. N.;Liu, Z. Y.;Tennakoon, D. S.;Goh, T. K.;Kuo, C. H.;Bulgakov, T. S.;Jeewon, R.;Bhat, D. J.;Jones, E. B. G.

    关键词:42 new taxa; Ascomycota; Description of type species of genus; Dothideomycetes; Lecanoromycetes; Leotiomycetes; Molecular phylogeny; New combinations; New family; New records; New species; Pezizomycetes; Phylogenetic; Reference specimens; Sordariomycetes; Taxonomy

  • Phylogeny and morphology of Helicotubeufia gen. nov., with three new species in Tubeufiaceae from aquatic habitats

    作者:Liu, J. K.;Cheewangkoon, R.;To-Anun, C.;Liu, J. K.;Lu, Y. Z.;Lu, Y. Z.

    关键词:4 new taxa; asexual morph; Dothideomycetes; freshwater; Taxonomy

  • Phylogenetic investigations on freshwater fungi in Tubeufiaceae (Tubeufiales) reveals the new genus Dictyospora and new species Chlamydotubeufia aquatica and Helicosporium flavum

    作者:Brahmanage, R. S.;Lu, Y. Z.;Wanasinghe, D. N.;Hyde, K. D.;Boonmee, S.;Brahmanage, R. S.;Yan, J. Y.;Lu, Y. Z.;Lu, Y. Z.;Bhat, D. J.

    关键词:Chlamydotubeufia;Dictyospora;Helicosporium;lignicolous fungi;phylogeny;taxonomy

  • Brunneodinemasporium jonesii and Tainosphaeria jonesii spp. nov (Chaetosphaeriaceae, Chaetosphaeriales) from southern China

    作者:Lu, Y. Z.;Xiao, Y. P.;Wen, T. C.;Kang, J. C.;Lu, Y. Z.;Hyde, K. D.;Xiao, Y. P.;Tian, Q.;Boonmee, S.;Lu, Y. Z.;Liu, K. J.;Bhat, D. J.;Bhat, D. J.

    关键词:New species;phylogeny;Sordariomycetes;taxonomy;woody fungi