Development and characterization of SSR markers in Chinese cherry (Prunus pseudocerasus Lindl.)
文献类型: 外文期刊
第一作者: Ai, C. X.
作者: Ai, C. X.;Liu, Q. Z.;Yu, X. M.;Dahlenburg, A.;Zhao, H. J.;Zhao, Y.
作者机构:
关键词: dinucleotide;chemiluminescence detection;DNA-typing;polymorphism;cultivar characterization
期刊名称:EUROPEAN JOURNAL OF HORTICULTURAL SCIENCE ( 影响因子:1.482; 五年影响因子:1.503 )
ISSN: 1611-4426
年卷期: 2008 年 73 卷 3 期
页码:
收录情况: SCI
摘要: 24 simple sequence repeat (SSR) markers were isolated and characterized in P. pseudocerasus LindI. from the cultivar 'Laiyang Short cherry. To amplify SSR loci primers were developed to flank each repeat region. and they were initially tested on 6 cherry samples using chemiluminescence detection. 18 loci where shown to be polymorphic and the number of alleles detected per locus varied from 2 to 6. 12 loci were chosen for the analysis of 26 cultivars grown in North China using the semi-automatic system ABI PRISM 377. These 12 markers showed a high level of genetic polymorphism with a total of 75 alleles; the number of alleles ranged from 4 to 10 per locus, with an average level of 6.3. The mean expected and observed heterozygosity was 0.743 (range: 0.680-0.845) and 0.829 (range: 0.730-0.930) respectively. The estimated frequency of null alleles showed a positive value for 3 loci, but except for 1 locus, the values were very low. The total value for the probability of identity was 7.01x10(-13). Paternity exclusion probability was very high (0.999), sufficiently high to study pollen flow.
分类号:
- 相关文献
作者其他论文 更多>>
-
Mycosphere Notes 521-571: A special edition of fungal biodiversity to celebrate Kevin D. Hyde's 70th birthday and his exceptional contributions to Mycology
作者:Hongsanan, S.;Khuna, S.;Xie, N.;de Silva, N., I;Tennakoon, D. S.;Manawasinghe, I. S.;Tibpromma, S.;Dai, D. Q.;Han, L. S.;Liu, X. F.;Lu, L.;Lu, W. H.;Wijayawardene, N. N.;Xu, R. F.;Zhang, G. Q.;Zheng, D. G.;Karunarathna, S. C.;Chethana, K. W. T.;Chen, C.;Luangharn, T.;Pem, D.;Xia, G.;Bhunjun, C. S.;Gao, Y.;Han, X. X.;Jayawardena, R. S.;Khyaju, S.;Lei, L.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Liu, X. F.;Lu, L.;Meng, Q. F.;Mi, L. X.;Peng, X. C.;Su, H. L.;Tun, Z. L.;Xiong, Y. R.;Xu, R. F.;Yang, Y. H.;Zhang, X.;Zhao, H. J.;Chethana, K. W. T.;Bhunjun, C. S.;Gao, Y.;Han, X. X.;Jayawardena, R. S.;Khyaju, S.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Liu, X. F.;Lu, L.;Meng, Q. F.;Mi, L. X.;Peng, X. C.;Su, H. L.;Tun, Z. L.;Xu, R. F.;Yang, Y. H.;Zhang, X.;Zhao, H. J.;Bagacay, J. F. E.;Calabon, M. S.;Opina, L. A. D.;Sadaba, R. B.;Lei, L.;Bagacay, J. F. E.;Calabon, M. S.;Opina, L. A. D.;Sadaba, R. B.;Chen, C.;Doilom, M.;Tan, Q.;Xia, G.;Dong, W.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Liu, J. W.;Luo, M.;Xiong, Y. R.;Yang, Y. H.;Zhao, H. J.;Chen, C.;Doilom, M.;Dong, W.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Liu, J. W.;Luo, M.;Yang, Y. H.;Zhao, H. J.;Du, Hy;Gafforov, Y.;Gafforov, Y.;Singh, R.;Yadav, S.;Zhang, X.;Zhang, X.;Zhao, Q.;Lei, L.;Thiyagaraja, V;Cao, B.;Leonardo-Silva, L.;Xavier-Santos, S.;Gui, H.;Khyaju, S.;Kumar, S.;Norphanphoun, C.;Yang, T.;Zeng, Xy;Yarasheva, M.;Zeng, Xy;Zhang, H.
关键词:41 new species; Ascomycota; Basidiomycota; morphology; phylogeny
-
The 2024 Outline of Fungi and fungus-like taxa
作者:Hyde, K. D.;Thiyagaraja, V;Kularathnage, N. D.;Li, Y. C.;Wang, Z. Y.;Zhao, Q.;Hyde, K. D.;Wijesinghe, S. N.;Armand, A.;Chethana, K. W. T.;Perera, R. H.;Phukhamsakda, C.;Wannasawang, N.;Asghari, R.;Aumentado, H. D. R.;Bera, I;Bhunjun, C. S.;Boonmee, S.;Bundhun, D.;Chaharmiri-Dokhaharani, S.;Gajanayake, A. J.;Gomdola, D.;Gunarathne, A.;He, S. C.;Htet, Z. H.;Jayawardena, R. S.;Karimi, O.;Khyaju, S.;Kularathnage, N. D.;Lestari, A. S.;Li, C.;Li, H.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Luangharn, T.;Luo, L.;Madagammana, A. D.;Mapook, A.;Meng, Q. F.;Mukhopadhyay, S.;Pathirana, L. S.;Pem, D.;Phonemany, M.;Phongeun, S.;Shu, Y. X.;Silva, V. S. H.;Su, H.;Sun, Y. R.;Sysouphanthong, P.;Tan, T. H.;Tang, X.;Thakshila, S. A. D.;Walker, A.;Wei, D. P.;Wu, N.;Xiong, Y. R.;Yang, H. D.;Yang, Y. H.;Yang, Y. Y.;Yu, F. M.;Yuan, L. L.;Zeng, M.;Zhang, J. Y.;Zhao, H. J.;Zhu, X. Y.;Hyde, K. D.;Noorabadi, M. T.;Chen, Y. P.;Manawasinghe, I. S.;Xu, B.;Yang, Y. H.;He, M. Q.;Johnston, P. R.;McKenzie, E. H. C.;Biketova, A. Y.;Biketova, A. Y.;Chethana, K. W. T.;Bhunjun, C. S.;Gomdola, D.;Htet, Z. H.;Jayawardena, R. S.;Li, H.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Luo, L.;Madagammana, A. D.;Meng, Q. F.;Rathnayaka, A. R.;Shu, Y. X.;Su, H.;Xiong, Y. R.;Yang, H. D.;Yang, Y. H.;Erdogdu, M.;Ge, Z. W.;Groenewald, J. Z.;Crous, P. W.;Groenewald, M.;Hernandez-Restrepo, M.;Houbraken, J.;Sandoval-Denis, M.;Hongsanan, S.;Khuna, S.;Kusan, I;Matocec, N.;Mesic, A.;Posta, A.;Tkalcec, Z.;Leontyev, D., V;Leontyev, D., V;Li, D. W.;Lin, C. G.;Liu, N. G.;Lu, Y. Z.;Tian, X. G.;Yang, Y.;Maharachchikumbura, S. S. N.;Tian, Q.;Chen, Y. P.;Dissanayake, A. J.;Liu, J. K.;Liu, J. W.;Madhushan, A.;Tian, W. H.;Zhang, S.;May, T. W.;Davoodian, N.;Piatek, M.;Czachura, P.;Darmostuk, V;Flakus, A.;Janik, P.;Ronikier, A.;Stryjak-Bogacka, M.;Worobiec, G.;Samarakoon, M. C.;Cheewankoon, R.;Chen, C.;Haituk, H.;Selcuk, F.;Ulukapi, M.;Senanayake, I. C.;Senanayake, I. C.;Tanney, J. B.;Vizzini, A.;Wanasinghe, D. N.;Dissanayake, A. J.;Wijayawardene, N. N.;Dai, D. Q.;Du, T. Y.;Jayasiri, S. C.;Karunarathna, S. C.;Liu, X. F.;Lu, L.;Tibpromma, S.;Xu, R. F.;Zhao, R. L.;Cao, B.;Chen, Q.;Li, J.;Liu, F.;Liu, S. L.;Wei, X.;Abdel-Wahab, M. A.;Abdollahzadeh, J.;Abeywickrama, P. D.;Abeywickrama, P. D.;Absalan, S.;Afshari, N.;Chaiwan, N.;Samaradiwakara, N. P.;Tennakoon, D. S.;Acharya, K.;Afshan, N. S.;Khalid, A. N.;Muhammad, U.;Najam Ul Sehar, A.;Naseer, A.;Niazi, A. R.;Sarwar, S.;Usman, M.;Afzalinia, S.;Ahmadpour, S. A.;Eisvand, P.;Mehrabi-Koushki, M.;Safi, A.;Akulov, O.;Alizadeh, A.;Alizadeh, M.;Al-Sadi, A. M.;Thamodini, G. K.;Alves, A.;Alves, V. C. S.;Alves-Silva, G.;Drechsler-Santos, E. R.;Antonin, V;Sevcikova, H.;Aouali, S.;Aptroot, A.;Apurillo, C. C. S.;Arias, R. M.;Heredia, G.;Asgari, B.;Zare, R.;Assis, D. M. A.;Barbosa, R. N.;da Silva, G. A.;da Silva, R. M. F.;da Silva Santos, A. C.;Diniz, A. G.;Gibertoni, T. B.;Lima, J. M. S.;Malosso, E.;Meiras-Ottoni, A. de;Mendes-Alvarenga, R. L.;Moura, J. C.;Santiago, A. L. C. M. A.;Souza-Motta, C. M.;Tiago, P., V;Assyov, B.;Denchev, C. M.;Denchev, T. T.;Atienza, V;Garrido-Benavent, I;Avasthi, S.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Bakhshi, M.;Druzhinina, I. S.;Bao, D. F.;Baral, H. O.;Barata, M.;Barata, M.;Barbosa, K. D.;Lima, J. L. R.;Nascimento, E. C. R.;Oliveira, N. V. L.;Queiroz, M. B.;Silva, H. F.;Barbosa, F. R.;Baroncelli, R.;Barreto, G. G.;Gusmao, L. F. P.;Baschien, C.;Schoutteten, N.;Bennett, R. M.;dela Cruz, T. E. E.;Bennett, R. M.;Bezerra, J. D. P.;Carvalho, T. G.;Bianchinotti, M., V;Bianchinotti, M., V;Blaszkowski, J.;Boekhout, T.;Bonito, G. M.;Boonyuen, N.;Luangsa-ard, J. J.;Bortnikov, F. M.;Fedosova, A. G.;Novozhilov, Y. K.;Zmitrovich, I., V;Bregant, C.;Linaldeddu, B. T.;Burgaud, G.;Buyck, B.;Caeiro, M. F.;Cabarroi-Hernandez, M.;Cortes-Perez, A.;Guzman-Davalos, L.;Ramirez-Cruz, V;Feng, Cai M.;Cai, L.;Feng, Cai M.;Calabon, M. S.;Calaca, F. J. S.;Calaca, F. J. S.;Calaca, F. J. S.;Callalli, M.;Callalli, M.;Camara, M. P. S.;Cano-Lira, J.;Garcia-Sanchez, D.;Gene, J.;Carlavilla, J. R.;Carvalho, A.;Carvalho, A.;Castaneda-Ruiz, R. F.;Catania, M. D., V;Salvador-Montoya, C. A.;Cazabonne, J.;Cazabonne, J.;Cedeno-Sanchez, M.;Stadler, M.;Chaiwan, N.;Haituk, H.;Chakraborty, N.;Chen, J.;Chinaglia, S.;Garzoli, L.;Marchese, P.;Coelho-Nascimento, C. C.;Coelho-Nascimento, C. C.;Coelho-Nascimento, C. C.;Menolli Jr, N.;Zabin, D. A.;Coleine, C.;Selbmann, L.;Zucconi, L.;Costa-Rezende, D. H.;Cortes-Perez, A.;Crouch, J. A.;Cruz, R. H. S. F.;Damm, U.;Daroodi, Z.;Mamarabadi, M.;Das, K.;Das, K.;Davydov, E. A.;da Silva, I. R.;Dai, Y. C.;Michiel, de Groot D.;De Lange, R.;Haelewaters, D.;Schoutteten, N.;De Kesel, A.;de Medeiros, E., V;de Souza, C. F. A.;de Souza, F. A.;Decock, C.;Delgado, G.;Denchev, C. M.;Denchev, T. T.;Deng, Y. L.;Dong, J. H.;Gu, Z. R.;Yang, X.;Yuan, Q.;Zhang, X. C.;Zhao, C. L.;Zhou, H. M.;Dentinger, B. T. M.;Dentinger, B. T. M.;Devadatha, B.;Devadatha, B.;Dianese, J. C.;Dima, B.;Doilom, M.;Dong, W.;Dong, Z. Y.;Li, Y.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Luo, M.;Dolatabadi, S.;Dubey, M. K.;Dutta, A. K.;Elliott, T. F.;Elshahed, M. S.;Vinzelj, J. M.;Youssef Noha, H.;Egidi, E.;Fan, L.;Fan, X.;Fan, X. L.;Ferro, L. O.;Fonseca, E. O.;Nascimento, S. S.;Oliveira Junior, I;Prazeres, J. F. S. A.;Fiuza, P. O.;Fryar, S. C.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gannibal, P. B.;Gao, F.;Garcia-Sandoval, R.;Gasca-Pineda, J.;Gautam, A. K.;Ghobad-Nejhad, M.;Ghosh, A.;Giachini, A. J.;Gentekaki, E.;Gmoshinskiy, V., I;Goes-Neto, A.;Gorjon, S. P.;Goto, B. T.;Granados-Montero, M. M.;Granados-Montero, M. M.;Griffith, G. W.;Grossart, H-P;Grossart, H-P;Gueidan, C.;Gunaseelan, S.;Guo, S. L.;Gutierrez, A. C.;Haelewaters, D.;Halling, R. E.;Hosoya, T.;Hoog, S. D.;Horak, E.;Hou, C. L.;Huang, S. K.;Huang, W. J.;Hurdeal, V. G.;Hustad, V. P.;Inacio, C. A.;Jayalal, R. G. U.;Jeewon, R.;Jeronimo, G. H.;Jin, J.;Jones, E. B. G.;Joshi, Y.;Jurjevic, Z.;Justo, A.;Kakishima, M.;Kaliyaperumal, M.;Kang, G. P.;Kang, G. P.;Kang, J. C.;Karpov, S. A.;Karpov, S. A.;Kezo, K.;Khan, M. K.;Kirchmair, M.;Neuhauser, S.;Peintner, U.;Klawonn, I;Kraisitudomsook, N.;Kukwa, M.;Kumar, S.;Lachance, M. A.;Lado, C.;Latha, K. P. D.;Lee, H. B.;Leonardi, M.;Lestari, A. S.;Li, Q.;Lima, N. B.;Lin, L.;Liu, S.;Liu, S.;Liu, X. Y.;Longcore, J. E.;Lumbsch, H. T.;Luo, Z. L.;Ma, J.;Madrid, H.;Magurno, F.;Magyar, D.;Mahadevakumar, S.;Malysh, J. M.;Manfrino, R. G.;Manimohan, P.;Mao, N.;Marasinghe, D. S.;Mardones, M.;Mardones, M.;Marin-Felix, Y.;Marin-Felix, Y.;Masigol, H.;Mehrabi, M.;Melo, R. F. R.;Mendieta, S.;Meng, Q. F.;Menkis, A.;Miksik, M.;Miller, S. L.;Moncada, B.;Moncada, B.;Moncalvo, J. M.;Moncalvo, J. M.;Monteiro, J. S.;Monteiro, J. S.;Monteiro, M.;Mora-Montes, H. M.;Moroz, E. L.;Nagy, G. L.;Najafiniya, M.;Nanayakkara, C. M.;Neves, M. A.;Yong, Nie;Nilsson, R. H.;Nogueira, P. T. S.;Noordeloos, M.;Norphanphoun, C.;Nunez Otano, N.;Zapata, C., V;O'Donnell, R. P.;Oehl, F.;Oliveira, J. A.;Oliveira, P. H. F.;Orihara, T.;Oset, M.;Pang, K. L.;Pang, K. L.;Papp, V;Pereira, O. L.;Perez-Moreno, J.;Perez-Ortega, S.;Peter, G.;Pires-Zottarelli, C. L. A.;Quan, Y.;Quandt, C. A.;Radek, R.;Rahnama, K.;Raj, K. N. A.;Rajeshkumar, K. C.;Soumyadeep, Rajwar;AB, Ralaiveloarisoa;Rama, T.;Rambold, G.;Raza, M.;Ren, G. C.;Rinaldi, A. C.;Rivas-Ferreiro, M.;Robledo, G. L.;Rossi, W.;Rusevska, K.;Ryberg, M.;Salimi, F.;Samant, B.;Sanchez-Castro, I;Santos, A. C. D. S.;Santos, L. A. dos;Sarma, V. V.;Savchenko, A.;Savchenko, A.;Saxena, R. K.;Schoutteten, N.;Schoutteten, N.;Sharma, A.;Shen, H. W.;Shen, Y. M.;Silva-Filho, A. G. S.;Simmons, D. R.;Singh, R.;Sir, E. B.;Sir, E. B.;Sir, E. B.;Sohrabi, M.;de Souza, F. A.;Sri-indrasutdhi, V;Sruthi, O. P.;Stemler, J.;Stemler, J.;Feng, Cai M.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stephenson, S. L.;Stoyneva-Gaertner, M. P.;Strassert, J. F. H.;Su, H.;Svantesson, S.;Takamatsu, S.;Tan, T. H.;Tan, T. H.;Tanaka, K.;Tang, C.;Taylor, J. E.;Taylor, P. W. J.;Thambugala, K. M.;Thilanga, D.;Thines, M.;Thines, M.;Tokarev, Y. S.;Tomsovsky, M.;Torruella, G.;Tsurykau, A.;Udayanga, D.;Untereiner, W. A.;Uzunov, B. A.;Vadthanarat, S.;Valenzuela, R.;Van den Wyngaert, S.;Van Vooren, N.;Velez, P.;Verma, R. K.;Verma, R. K.;Vieira, W. A. S.;Tang, A. M. C.;Walker, A. K.;Wang, Q. M.;Wang, Y.;Wang, X. Y.;Wang, Z. Y.;Wannathes, N.;Wartchow, F.;Weerakoon, G.;White, J. F.;Wijesundara, D. S. A.;Wisitrassameewong, K.;Wu, H. X.;Xiong, Y. R.;Xu, J. P.;Xu, R.;Xu, R. J.;Yadav, S.;Yakovchenko, L. S.;Yoshioka, R.;Yoshioka, R.;Yu, Z. F.;Zamora, J. C.;Zeng, X. Y.;Zhang, J. F.;Zhang, J. F.;Zhao, H.;Zvyagina, E.;Zvyagina, E.
关键词:classes; classification; families; genera; orders; phyla
-
Carbohydrate Changes during Seasonal Cold Acclimation and Deacclimation in Phloem and Xylem of Vitis Species with Different Cold Hardiness Levels
作者:Zhao, Y.;Qin, H. Y.;Yang, Y. M.;Wang, Y. L.;Zhang, B. X.;Wang, Y.;Lu, W. P.;Zhao, Y.
关键词:Vitis amurensis; Vitis riparia; Vitislabrusca; grape; cold hardiness; carbohydrate; cold acclimation; deacclimation
-
Mycosphere notes 345-386
作者:Manawasinghe, I. S.;Zhang, Y. X.;Liao, C. F.;Xiong, Y. R.;Kularathnage, N. D.;Luo, M.;Chen, J. W.;Mai, Z. L.;Yang, Y. H.;Zhao, H. J.;Doilom, M.;Liu, J. W.;Senanayake, I. C.;You, L. Q.;Hyde, K. D.;Calabon, M. S.;Liao, C. F.;Xiong, Y. R.;Chaiwan, N.;Kularathnage, N. D.;Liu, N. G.;Tang, S. M.;Sysouphanthong, P.;Du, T. Y.;Pasouvang, P.;Pem, D.;Phonemany, M.;Rathnayaka, A. R.;Tennakoon, D. S.;Wijesinghe, S. N.;Yang, Y. H.;Zhao, H. J.;Thongklang, N.;Hyde, K. D.;Calabon, M. S.;Liao, C. F.;Xiong, Y. R.;Kularathnage, N. D.;Liu, N. G.;Tang, S. M.;Sysouphanthong, P.;Du, T. Y.;Pasouvang, P.;Pem, D.;Phonemany, M.;Rathnayaka, A. R.;Wijesinghe, S. N.;Yang, Y. H.;Zhao, H. J.;Thongklang, N.;Senanayake, I. C.;Jones, E. B. G.;Tang, S. M.;Sysouphanthong, P.;Du, T. Y.;Karunarathna, S. C.;Tibpromma, S.;Du, T. Y.;Pasouvang, P.;Ishaq, M.;Fiaz, M.;Rathnayaka, A. R.;Samarakoon, M. C.;Samarakoon, M. C.;Dutta, A. K.;Khalid, A. N.;Camporesi, E.;Gafforov, Y. S.;Tennakoon, D. S.;Hyde, K. D.;Tennakoon, D. S.;Hyde, K. D.
关键词:9 new taxa; 27 new records; 5 new combinations; Agaricomycetes; Ascomycota; Basidiomycota; Dothideomycetes; Molecular phylogeny; New hosts; New species; Sordariomycetes; Taxonomy
-
EFFECTS OF LONG-TERM CROPPING OF TIBETAN BARLEY (KUNLUN 14) ON SOIL MICROBIAL DIVERSITY, ENZYMATIC ACTIVITIES, AND CROP PHENOTYPIC QUALITY
作者:ZHAO, Y.;YAO, Y. H.;YAO, X. H.;WU, K. L.;ZHAO, Y.;YAO, Y. H.;YAO, X. H.;WU, K. L.;YAO, Y. H.;YAO, X. H.;WU, K. L.;YAO, Y. H.;YAO, X. H.;WU, K. L.
关键词:continuous cropping; crop quality; microbial community; nutrient deficiency; soil microbiology
-
Both uniconazole and 5-aminolevulinic acid increase maize (Zea mays L.) yield by changing its ear morphology and increasing photosynthetic efficiency and antioxidants in saline-alkali land
作者:Xu, L.;Liang, X. L.;Zhao, H. H.;Wang, S. Y.;Xu, L.;Feng, N. J.;Zheng, D. F.;Jiang, Y.;Zhao, Y.
关键词:leaf senescence; photosynthesis; plant growth regulator; Zea mays L.
-
Morphological and physiological characteristics of abnormal berry development in Vitis amurensis
作者:Xu, P. L.;Han, X. Y.;Ai, J.;Yang, Y. M.;Qin, H. Y.;Li, C. Y.;Liu, Y. X.;Zhao, Y.;Zhang, B. X.;Fan, S. T.;Ai, J.
关键词:Vitis amurensis; morphology; physiology; berry development