Microarray analysis of differentially expressed genes in the liver between Bai'er layers and broilers

文献类型： 外文期刊

第一作者： Wang, Q. -G.

作者： Wang, Q. -G.;Zhang, H. -F.;Wang, S. -Z.;Gao, G. L.;Leng, L.;Na, W.;Li, H.;Wang, Q. -G.;Zhang, H. -F.;Wang, S. -Z.;Gao, G. L.;Leng, L.;Na, W.;Li, H.;Zhang, H. -F.;Wang, S. -Z.;Leng, L.;Na, W.;Li, H.;Wang, Q. -G.;Gao, G. L.

作者机构：

关键词： Chicken;Gene expression profile;Liver

期刊名称：GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH （ 影响因子：0.764； 五年影响因子：0.912 ）

ISSN： 1676-5680

年卷期： 2015 年 14 卷 1 期

页码：

收录情况： SCI

摘要： In this study, we profiled gene expression in chicken liver and screened differentially expressed genes in the Bai'er layers and fat line broilers. Birds were derived from the 14th generation of Northeast Agricultural University fat broiler lines and Bai'er layers. Chicken genome arrays were used to screen differentially expressed genes in liver tissue from the Bai'er layers and fat line broilers. We screened 671 differentially expressed genes between broilers and layers at the ages of 2 and 4 weeks. We observed enrichment of a series of significant pathways, including the mitogen-activated protein kinase signaling pathway, cell cycle, mammalian target of rapamycin signaling pathway, and p53 signaling pathway. At 2 and 4 weeks, 94 shared differentially expressed genes were observed. We speculated that these genes regulate chicken lipid metabolism.

分类号：

  • 相关文献

[1]Differentially expressed genes in the liver of lean and fat chickens. He, Q.,Wang, S. Z.,Leng, L.,Na, W.,Wang, Q. G.,Li, H.,He, Q.,Wang, S. Z.,Leng, L.,Na, W.,Wang, Q. G.,Li, H.,He, Q.,Wang, S. Z.,Leng, L.,Na, W.,Li, H.,Wang, Q. G.. 2014

[2]Analysis on Differentially Expressed Genes of Muscle Tissues in Rugao Chicken at the Ages of 2 and 12 Weeks by Microarray. Luan, De Qin,Bin Chang, Guo,Zhen, Ting,Huang, Zheng Yang,Zhou, Wei,Chen, Guo Hong,Liu, Yan. 2011

[3]Chicken GHR natural antisense transcript regulates GHR mRNA in LMH cells. Zhang, Li,Lin, Shudai,Ma, Jinge,Qiu, Fengfang,Nie, Qinghua,Zhang, Dexiang,Luo, Qingbin,Zhang, Xiquan,Zhang, Li,An, Lilong,Jia, Rumin,Li, Ting,Wang, Zhang. 2016

[4]Differential expression of six chicken genes associated with fatness traits in a divergently selected broiler population. Wu, Xianwen,Zhang, Qi,Xu, Songsong,Jin, Pengcheng,Luan, Peng,Li, Yumao,Cao, Zhiping,Leng, Li,Wang, Yuxiang,Wang, Shouzhi,Wu, Xianwen,Zhang, Qi,Xu, Songsong,Jin, Pengcheng,Luan, Peng,Li, Yumao,Cao, Zhiping,Leng, Li,Wang, Yuxiang,Wang, Shouzhi,Wu, Xianwen,Zhang, Qi,Xu, Songsong,Jin, Pengcheng,Luan, Peng,Li, Yumao,Cao, Zhiping,Leng, Li,Wang, Yuxiang,Wang, Shouzhi.

[5]Gene expression profiling during gland morphogenesis of a mutant and a glandless upland cotton. Sun, Quan,Cai, Yingfan,Xie, Yongfang,Mo, Jianchuan,Li, Shengwei,Jiang, Huaizhong,Pan, Zheng,Gao, Yunling,Chen, Min,He, Xiaohong,Yuan, Youlu,Shi, Yuzhen. 2010

[6]Microarray Analysis on the Differences of Gene Expression in Longissimus Dorsi Muscle Tissue Between 1 and 24 Months Chinese Red Steppes. Qin, Lihong,Zhang, Jiabao,Zhao, Zhihui,Zhang, Guoliang,Cao, Yang,Zhao, Yumin. 2011

[7]Molecular cloning, genomic structure and expression analysis of major histocompatibility complex class I alpha gene of half-smooth tongue sole (Cynoglossus semilaevis). Chen, Song-lin,Xu, Tian-jun. 2011

[8]Differentially expressed genes under cold acclimation in Physcomitrella patens. Sun, Ming-Ming,Li, Lin-Hui,Xie, Hua,Ma, Rong-Cai,He, Yi-Kun. 2007

[9]Gene expression profile analysis of pig muscle in response to cold stress. Zhang Dong-jie,Liu Di,Wang Liang,Wang Wen-tao,He Xin-miao,Yang Guo-wei. 2017

[10]Gastrocnemius transcriptome analysis reveals domestication induced gene expression changes between wild and domestic chickens. Li, Qinghe,Du, Zhuo,Hu, Xiaoxiang,Fei, Jing,Wang, Yuanyuan,Li, Ning,Wang, Nan,Chen, Li.

[11]Aromatic Glucosinolate Biosynthesis Pathway in Barbarea vulgaris and its Response to Plutella xylostella Infestation. Liu, Tongjin,Zhang, Xiaohui,Yang, Haohui,Qiu, Yang,Wang, Haiping,Shen, Di,Song, Jiangping,Li, Xixiang,Agerbirk, Niels,Agerbirk, Niels. 2016

[12]Differential Gene Expression Profiles in Human THP-1 Monocytes Treated with Lactobacillus plantarum or Staphylococcus aureus Lipoteichoic Acid. Zeng, Ri-Zhong,Kim, Han Geun,Kim, Na Ra,Geun, Min,Chung, Dae Kyun,Zeng, Ri-Zhong,Kim, Han Geun,Kim, Na Ra,Geun, Min,Chung, Dae Kyun,Ko, Mi Yeon,Lee, Seung Yeon,Chung, Dae Kyun,Kim, Chul Min,Chung, Dae Kyun,Zeng, Ri-Zhong,Chung, Dae Kyun.

[13]Differential expression analysis of different albescent stages of 'Anji Baicha' (Camellia sinensis (L.) O. Kuntze) using cDNA microarray. Ma, Chun-Lei,Chen, Liang,Wang, Xin-Chao,Jin, Ji-Qiang,Ma, Jian-Qiang,Yao, Ming-Zhe,Wang, Zhi-Lan. 2012

[14]Three Heat Shock Protein Genes from Bactrocera (Tetradacus) minax Enderlein: Gene Cloning, Characterization, and Association with Diapause. Lu, Z. C.,Wang, L. H.,Zhang, G. F.,Wan, F. H.,Guo, J. Y.,Wan, F. H.,Guo, J. Y.,Wang, L. H.,Yu, H.,Wang, J. B.. 2014

[15]Expression profiling reveals functionally redundant multiple-copy genes related to zinc, iron and cadmium responses in Brassica rapa. Li, Jimeng,Liu, Bo,Cheng, Feng,Wang, Xiaowu,Wu, Jian,Li, Jimeng,Aarts, Mark G. M..

[16]Large-scale identification of differentially expressed genes during pupa development reveals solute carrier gene is essential for pupal pigmentation in Chilo suppressalis. Sun, Yang,Guo, Dianhao,Ge, Chang,Xiao, Huamei,Jie, Wencai,Yang, Qiupu,Teng, Xiaolu,Li, Fei,Huang, Shuijin,Wang, Shuping,Li, Fei.

[17]Novel splice variants of the bovine PCK1 gene. Zhang, Z. B.,Zhao, Z. S.,Huang, J. M.,Zhang, Z. B.,Zhang, W.,Li, R. L.,Li, J. B.,Zhong, J. F.. 2013

[18]Dietary supplementation with a high dose of daidzein enhances the antioxidant capacity in swine muscle but experts pro-oxidant function in liver and fat tissues. Chen, Wei,Ma, Xianyong,Lin, Yingcai,Xiong, Yunxia,Zheng, Chuntian,Hu, Youjun,Yu, Deqian,Jiang, Zongyong,Chen, Wei,Ma, Xianyong,Lin, Yingcai,Xiong, Yunxia,Zheng, Chuntian,Hu, Youjun,Yu, Deqian,Jiang, Zongyong,Chen, Wei,Ma, Xianyong,Lin, Yingcai,Xiong, Yunxia,Zheng, Chuntian,Hu, Youjun,Yu, Deqian,Jiang, Zongyong,Chen, Wei,Ma, Xianyong,Lin, Yingcai,Xiong, Yunxia,Zheng, Chuntian,Hu, Youjun,Yu, Deqian,Jiang, Zongyong,Chen, Wei,Ma, Xianyong,Lin, Yingcai,Xiong, Yunxia,Zheng, Chuntian,Hu, Youjun,Yu, Deqian,Jiang, Zongyong. 2016

[19]CIDE gene expression in adipose tissue, liver, and skeletal muscle from obese and lean pigs. Qiu, Yue-qin,Yang, Xue-fen,Ma, Xian-yong,Xiong, Yun-xia,Tian, Zhi-mei,Fan, Qiu-li,Wang, Li,Jiang, Zong-yong. 2017

[20]Integrated analysis of mRNA and miRNA expression profiles in livers of Yimeng black pigs with extreme phenotypes for backfat thickness. Li, Wentong,Yang, Yalan,Zhou, Rong,Li, Kui,Li, Wentong,Liu, Shuai,Li, Xiuxiu,Wang, Yingping,Tang, Hui,Li, Wentong,Yang, Yalan,Liu, Ying,Zhang, Yanmin,Zhou, Rong,Li, Kui,Li, Kui. 2017

作者其他论文 更多>>
  • Mycosphere Notes 521-571: A special edition of fungal biodiversity to celebrate Kevin D. Hyde's 70th birthday and his exceptional contributions to Mycology

    作者：Hongsanan, S.;Khuna, S.;Xie, N.;de Silva, N., I;Tennakoon, D. S.;Manawasinghe, I. S.;Tibpromma, S.;Dai, D. Q.;Han, L. S.;Liu, X. F.;Lu, L.;Lu, W. H.;Wijayawardene, N. N.;Xu, R. F.;Zhang, G. Q.;Zheng, D. G.;Karunarathna, S. C.;Chethana, K. W. T.;Chen, C.;Luangharn, T.;Pem, D.;Xia, G.;Bhunjun, C. S.;Gao, Y.;Han, X. X.;Jayawardena, R. S.;Khyaju, S.;Lei, L.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Liu, X. F.;Lu, L.;Meng, Q. F.;Mi, L. X.;Peng, X. C.;Su, H. L.;Tun, Z. L.;Xiong, Y. R.;Xu, R. F.;Yang, Y. H.;Zhang, X.;Zhao, H. J.;Chethana, K. W. T.;Bhunjun, C. S.;Gao, Y.;Han, X. X.;Jayawardena, R. S.;Khyaju, S.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Liu, X. F.;Lu, L.;Meng, Q. F.;Mi, L. X.;Peng, X. C.;Su, H. L.;Tun, Z. L.;Xu, R. F.;Yang, Y. H.;Zhang, X.;Zhao, H. J.;Bagacay, J. F. E.;Calabon, M. S.;Opina, L. A. D.;Sadaba, R. B.;Lei, L.;Bagacay, J. F. E.;Calabon, M. S.;Opina, L. A. D.;Sadaba, R. B.;Chen, C.;Doilom, M.;Tan, Q.;Xia, G.;Dong, W.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Liu, J. W.;Luo, M.;Xiong, Y. R.;Yang, Y. H.;Zhao, H. J.;Chen, C.;Doilom, M.;Dong, W.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Liu, J. W.;Luo, M.;Yang, Y. H.;Zhao, H. J.;Du, Hy;Gafforov, Y.;Gafforov, Y.;Singh, R.;Yadav, S.;Zhang, X.;Zhang, X.;Zhao, Q.;Lei, L.;Thiyagaraja, V;Cao, B.;Leonardo-Silva, L.;Xavier-Santos, S.;Gui, H.;Khyaju, S.;Kumar, S.;Norphanphoun, C.;Yang, T.;Zeng, Xy;Yarasheva, M.;Zeng, Xy;Zhang, H.

    关键词：41 new species; Ascomycota; Basidiomycota; morphology; phylogeny

  • Effects of Biochar and α-Fe2O3 Nanoparticles on the Growth, Photosynthetic Apparatus and Fruit Quality of Medicinal Plant Muskmelon

    作者：Wang, Y.;Zhou, W.;Yi, L.;Dai, Z.;Qiu, L.;Zhou, Y.;Wang, S.;Li, H.;Li, J.;Wang, Y.;Zhou, W.;Yi, L.;Dai, Z.

    关键词：Cucumis melo; alpha-Fe2O3 nanoparticles; biochar; medicinal ingredients; muskmelon; fruit quality

  • Steinernema tarimense n. sp. (Rhabditida: Steinernematidae), a new entomopathogenic nematode from Tarim Basin, Xinjiang, China

    作者：Zhan, F.;Zhan, F.;Yang, R.;Bao, H.;Zhang, S.;Zhang, X.;Shi, Y.;Tian, C.;Li, H.;Tomalak, M.;Puza, V.;Guo, W.

    关键词：morphological description; phylogenetic systematics; Populus euphratica forest; Steinernema species; Tarim Basin

  • High-throughput proximal ground crop phenotyping systems - A comprehensive review

    作者：Rui, Z.;Zhang, Z.;Zhang, M.;Azizi, A.;Li, H.;Wang, M.;Rui, Z.;Zhang, Z.;Zhang, M.;Azizi, A.;Li, H.;Wang, M.;Igathinathane, C.;Cen, H.;Vougioukas, S.;Zhang, J.;Jiang, Y.;Jiao, X.;Ampatzidis, Y.;Oladele, O. I.;Ghasemi-Varnamkhasti, M.;Radi, Radi

    关键词：High-throughput phenotyping; Phenotyping platform; Sensing technology; Data processing; Precision agriculture

  • The 2024 Outline of Fungi and fungus-like taxa

    作者：Hyde, K. D.;Thiyagaraja, V;Kularathnage, N. D.;Li, Y. C.;Wang, Z. Y.;Zhao, Q.;Hyde, K. D.;Wijesinghe, S. N.;Armand, A.;Chethana, K. W. T.;Perera, R. H.;Phukhamsakda, C.;Wannasawang, N.;Asghari, R.;Aumentado, H. D. R.;Bera, I;Bhunjun, C. S.;Boonmee, S.;Bundhun, D.;Chaharmiri-Dokhaharani, S.;Gajanayake, A. J.;Gomdola, D.;Gunarathne, A.;He, S. C.;Htet, Z. H.;Jayawardena, R. S.;Karimi, O.;Khyaju, S.;Kularathnage, N. D.;Lestari, A. S.;Li, C.;Li, H.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Luangharn, T.;Luo, L.;Madagammana, A. D.;Mapook, A.;Meng, Q. F.;Mukhopadhyay, S.;Pathirana, L. S.;Pem, D.;Phonemany, M.;Phongeun, S.;Shu, Y. X.;Silva, V. S. H.;Su, H.;Sun, Y. R.;Sysouphanthong, P.;Tan, T. H.;Tang, X.;Thakshila, S. A. D.;Walker, A.;Wei, D. P.;Wu, N.;Xiong, Y. R.;Yang, H. D.;Yang, Y. H.;Yang, Y. Y.;Yu, F. M.;Yuan, L. L.;Zeng, M.;Zhang, J. Y.;Zhao, H. J.;Zhu, X. Y.;Hyde, K. D.;Noorabadi, M. T.;Chen, Y. P.;Manawasinghe, I. S.;Xu, B.;Yang, Y. H.;He, M. Q.;Johnston, P. R.;McKenzie, E. H. C.;Biketova, A. Y.;Biketova, A. Y.;Chethana, K. W. T.;Bhunjun, C. S.;Gomdola, D.;Htet, Z. H.;Jayawardena, R. S.;Li, H.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Luo, L.;Madagammana, A. D.;Meng, Q. F.;Rathnayaka, A. R.;Shu, Y. X.;Su, H.;Xiong, Y. R.;Yang, H. D.;Yang, Y. H.;Erdogdu, M.;Ge, Z. W.;Groenewald, J. Z.;Crous, P. W.;Groenewald, M.;Hernandez-Restrepo, M.;Houbraken, J.;Sandoval-Denis, M.;Hongsanan, S.;Khuna, S.;Kusan, I;Matocec, N.;Mesic, A.;Posta, A.;Tkalcec, Z.;Leontyev, D., V;Leontyev, D., V;Li, D. W.;Lin, C. G.;Liu, N. G.;Lu, Y. Z.;Tian, X. G.;Yang, Y.;Maharachchikumbura, S. S. N.;Tian, Q.;Chen, Y. P.;Dissanayake, A. J.;Liu, J. K.;Liu, J. W.;Madhushan, A.;Tian, W. H.;Zhang, S.;May, T. W.;Davoodian, N.;Piatek, M.;Czachura, P.;Darmostuk, V;Flakus, A.;Janik, P.;Ronikier, A.;Stryjak-Bogacka, M.;Worobiec, G.;Samarakoon, M. C.;Cheewankoon, R.;Chen, C.;Haituk, H.;Selcuk, F.;Ulukapi, M.;Senanayake, I. C.;Senanayake, I. C.;Tanney, J. B.;Vizzini, A.;Wanasinghe, D. N.;Dissanayake, A. J.;Wijayawardene, N. N.;Dai, D. Q.;Du, T. Y.;Jayasiri, S. C.;Karunarathna, S. C.;Liu, X. F.;Lu, L.;Tibpromma, S.;Xu, R. F.;Zhao, R. L.;Cao, B.;Chen, Q.;Li, J.;Liu, F.;Liu, S. L.;Wei, X.;Abdel-Wahab, M. A.;Abdollahzadeh, J.;Abeywickrama, P. D.;Abeywickrama, P. D.;Absalan, S.;Afshari, N.;Chaiwan, N.;Samaradiwakara, N. P.;Tennakoon, D. S.;Acharya, K.;Afshan, N. S.;Khalid, A. N.;Muhammad, U.;Najam Ul Sehar, A.;Naseer, A.;Niazi, A. R.;Sarwar, S.;Usman, M.;Afzalinia, S.;Ahmadpour, S. A.;Eisvand, P.;Mehrabi-Koushki, M.;Safi, A.;Akulov, O.;Alizadeh, A.;Alizadeh, M.;Al-Sadi, A. M.;Thamodini, G. K.;Alves, A.;Alves, V. C. S.;Alves-Silva, G.;Drechsler-Santos, E. R.;Antonin, V;Sevcikova, H.;Aouali, S.;Aptroot, A.;Apurillo, C. C. S.;Arias, R. M.;Heredia, G.;Asgari, B.;Zare, R.;Assis, D. M. A.;Barbosa, R. N.;da Silva, G. A.;da Silva, R. M. F.;da Silva Santos, A. C.;Diniz, A. G.;Gibertoni, T. B.;Lima, J. M. S.;Malosso, E.;Meiras-Ottoni, A. de;Mendes-Alvarenga, R. L.;Moura, J. C.;Santiago, A. L. C. M. A.;Souza-Motta, C. M.;Tiago, P., V;Assyov, B.;Denchev, C. M.;Denchev, T. T.;Atienza, V;Garrido-Benavent, I;Avasthi, S.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Bakhshi, M.;Druzhinina, I. S.;Bao, D. F.;Baral, H. O.;Barata, M.;Barata, M.;Barbosa, K. D.;Lima, J. L. R.;Nascimento, E. C. R.;Oliveira, N. V. L.;Queiroz, M. B.;Silva, H. F.;Barbosa, F. R.;Baroncelli, R.;Barreto, G. G.;Gusmao, L. F. P.;Baschien, C.;Schoutteten, N.;Bennett, R. M.;dela Cruz, T. E. E.;Bennett, R. M.;Bezerra, J. D. P.;Carvalho, T. G.;Bianchinotti, M., V;Bianchinotti, M., V;Blaszkowski, J.;Boekhout, T.;Bonito, G. M.;Boonyuen, N.;Luangsa-ard, J. J.;Bortnikov, F. M.;Fedosova, A. G.;Novozhilov, Y. K.;Zmitrovich, I., V;Bregant, C.;Linaldeddu, B. T.;Burgaud, G.;Buyck, B.;Caeiro, M. F.;Cabarroi-Hernandez, M.;Cortes-Perez, A.;Guzman-Davalos, L.;Ramirez-Cruz, V;Feng, Cai M.;Cai, L.;Feng, Cai M.;Calabon, M. S.;Calaca, F. J. S.;Calaca, F. J. S.;Calaca, F. J. S.;Callalli, M.;Callalli, M.;Camara, M. P. S.;Cano-Lira, J.;Garcia-Sanchez, D.;Gene, J.;Carlavilla, J. R.;Carvalho, A.;Carvalho, A.;Castaneda-Ruiz, R. F.;Catania, M. D., V;Salvador-Montoya, C. A.;Cazabonne, J.;Cazabonne, J.;Cedeno-Sanchez, M.;Stadler, M.;Chaiwan, N.;Haituk, H.;Chakraborty, N.;Chen, J.;Chinaglia, S.;Garzoli, L.;Marchese, P.;Coelho-Nascimento, C. C.;Coelho-Nascimento, C. C.;Coelho-Nascimento, C. C.;Menolli Jr, N.;Zabin, D. A.;Coleine, C.;Selbmann, L.;Zucconi, L.;Costa-Rezende, D. H.;Cortes-Perez, A.;Crouch, J. A.;Cruz, R. H. S. F.;Damm, U.;Daroodi, Z.;Mamarabadi, M.;Das, K.;Das, K.;Davydov, E. A.;da Silva, I. R.;Dai, Y. C.;Michiel, de Groot D.;De Lange, R.;Haelewaters, D.;Schoutteten, N.;De Kesel, A.;de Medeiros, E., V;de Souza, C. F. A.;de Souza, F. A.;Decock, C.;Delgado, G.;Denchev, C. M.;Denchev, T. T.;Deng, Y. L.;Dong, J. H.;Gu, Z. R.;Yang, X.;Yuan, Q.;Zhang, X. C.;Zhao, C. L.;Zhou, H. M.;Dentinger, B. T. M.;Dentinger, B. T. M.;Devadatha, B.;Devadatha, B.;Dianese, J. C.;Dima, B.;Doilom, M.;Dong, W.;Dong, Z. Y.;Li, Y.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Luo, M.;Dolatabadi, S.;Dubey, M. K.;Dutta, A. K.;Elliott, T. F.;Elshahed, M. S.;Vinzelj, J. M.;Youssef Noha, H.;Egidi, E.;Fan, L.;Fan, X.;Fan, X. L.;Ferro, L. O.;Fonseca, E. O.;Nascimento, S. S.;Oliveira Junior, I;Prazeres, J. F. S. A.;Fiuza, P. O.;Fryar, S. C.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gannibal, P. B.;Gao, F.;Garcia-Sandoval, R.;Gasca-Pineda, J.;Gautam, A. K.;Ghobad-Nejhad, M.;Ghosh, A.;Giachini, A. J.;Gentekaki, E.;Gmoshinskiy, V., I;Goes-Neto, A.;Gorjon, S. P.;Goto, B. T.;Granados-Montero, M. M.;Granados-Montero, M. M.;Griffith, G. W.;Grossart, H-P;Grossart, H-P;Gueidan, C.;Gunaseelan, S.;Guo, S. L.;Gutierrez, A. C.;Haelewaters, D.;Halling, R. E.;Hosoya, T.;Hoog, S. D.;Horak, E.;Hou, C. L.;Huang, S. K.;Huang, W. J.;Hurdeal, V. G.;Hustad, V. P.;Inacio, C. A.;Jayalal, R. G. U.;Jeewon, R.;Jeronimo, G. H.;Jin, J.;Jones, E. B. G.;Joshi, Y.;Jurjevic, Z.;Justo, A.;Kakishima, M.;Kaliyaperumal, M.;Kang, G. P.;Kang, G. P.;Kang, J. C.;Karpov, S. A.;Karpov, S. A.;Kezo, K.;Khan, M. K.;Kirchmair, M.;Neuhauser, S.;Peintner, U.;Klawonn, I;Kraisitudomsook, N.;Kukwa, M.;Kumar, S.;Lachance, M. A.;Lado, C.;Latha, K. P. D.;Lee, H. B.;Leonardi, M.;Lestari, A. S.;Li, Q.;Lima, N. B.;Lin, L.;Liu, S.;Liu, S.;Liu, X. Y.;Longcore, J. E.;Lumbsch, H. T.;Luo, Z. L.;Ma, J.;Madrid, H.;Magurno, F.;Magyar, D.;Mahadevakumar, S.;Malysh, J. M.;Manfrino, R. G.;Manimohan, P.;Mao, N.;Marasinghe, D. S.;Mardones, M.;Mardones, M.;Marin-Felix, Y.;Marin-Felix, Y.;Masigol, H.;Mehrabi, M.;Melo, R. F. R.;Mendieta, S.;Meng, Q. F.;Menkis, A.;Miksik, M.;Miller, S. L.;Moncada, B.;Moncada, B.;Moncalvo, J. M.;Moncalvo, J. M.;Monteiro, J. S.;Monteiro, J. S.;Monteiro, M.;Mora-Montes, H. M.;Moroz, E. L.;Nagy, G. L.;Najafiniya, M.;Nanayakkara, C. M.;Neves, M. A.;Yong, Nie;Nilsson, R. H.;Nogueira, P. T. S.;Noordeloos, M.;Norphanphoun, C.;Nunez Otano, N.;Zapata, C., V;O'Donnell, R. P.;Oehl, F.;Oliveira, J. A.;Oliveira, P. H. F.;Orihara, T.;Oset, M.;Pang, K. L.;Pang, K. L.;Papp, V;Pereira, O. L.;Perez-Moreno, J.;Perez-Ortega, S.;Peter, G.;Pires-Zottarelli, C. L. A.;Quan, Y.;Quandt, C. A.;Radek, R.;Rahnama, K.;Raj, K. N. A.;Rajeshkumar, K. C.;Soumyadeep, Rajwar;AB, Ralaiveloarisoa;Rama, T.;Rambold, G.;Raza, M.;Ren, G. C.;Rinaldi, A. C.;Rivas-Ferreiro, M.;Robledo, G. L.;Rossi, W.;Rusevska, K.;Ryberg, M.;Salimi, F.;Samant, B.;Sanchez-Castro, I;Santos, A. C. D. S.;Santos, L. A. dos;Sarma, V. V.;Savchenko, A.;Savchenko, A.;Saxena, R. K.;Schoutteten, N.;Schoutteten, N.;Sharma, A.;Shen, H. W.;Shen, Y. M.;Silva-Filho, A. G. S.;Simmons, D. R.;Singh, R.;Sir, E. B.;Sir, E. B.;Sir, E. B.;Sohrabi, M.;de Souza, F. A.;Sri-indrasutdhi, V;Sruthi, O. P.;Stemler, J.;Stemler, J.;Feng, Cai M.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stephenson, S. L.;Stoyneva-Gaertner, M. P.;Strassert, J. F. H.;Su, H.;Svantesson, S.;Takamatsu, S.;Tan, T. H.;Tan, T. H.;Tanaka, K.;Tang, C.;Taylor, J. E.;Taylor, P. W. J.;Thambugala, K. M.;Thilanga, D.;Thines, M.;Thines, M.;Tokarev, Y. S.;Tomsovsky, M.;Torruella, G.;Tsurykau, A.;Udayanga, D.;Untereiner, W. A.;Uzunov, B. A.;Vadthanarat, S.;Valenzuela, R.;Van den Wyngaert, S.;Van Vooren, N.;Velez, P.;Verma, R. K.;Verma, R. K.;Vieira, W. A. S.;Tang, A. M. C.;Walker, A. K.;Wang, Q. M.;Wang, Y.;Wang, X. Y.;Wang, Z. Y.;Wannathes, N.;Wartchow, F.;Weerakoon, G.;White, J. F.;Wijesundara, D. S. A.;Wisitrassameewong, K.;Wu, H. X.;Xiong, Y. R.;Xu, J. P.;Xu, R.;Xu, R. J.;Yadav, S.;Yakovchenko, L. S.;Yoshioka, R.;Yoshioka, R.;Yu, Z. F.;Zamora, J. C.;Zeng, X. Y.;Zhang, J. F.;Zhang, J. F.;Zhao, H.;Zvyagina, E.;Zvyagina, E.

    关键词：classes; classification; families; genera; orders; phyla

  • Low-depth Raw Reads of Nanopore Sequencing Enables Rapid and Accurate Bacterial Identification

    作者：Gao, W.;Hong, W.;Wu, Y.;Liu, Y.;Fan, X.;Wang, H.;Wang, M.;Yang, B.;Wang, T.;Li, H.;Liu, S.;Li, J.

    关键词：assembly; reads; Nanopore sequencing; Illumina sequencing; bacterial identification

  • Global consortium for the classification of fungi and fungus-like taxa

    作者：Hyde, K. D.;Dai, D. Q.;Du, T. Y.;Li, Q.;Liu, X. F.;Tibpromma, S.;Wijayawardene, N. N.;Hyde, K. D.;Absalan, S.;Afshari, N.;Amuhenage, T. B.;Apurillo, C. C. S.;Armand, A.;Asghari, R.;Bera, I;Bhunjun, C. S.;Boonmee, S.;Bundhun, D.;Chaharmiri-Dokhaharani, S.;Chen, C.;Chethana, K. W. T.;Du, T. Y.;Gajanayake, A. J.;Gentekaki, E.;Gomdola, D.;Gomes de Farias, A. R.;Gunarathne, A.;He, S.;Huanraluek, N.;Hurdeal, V. G.;Jayawardena, R. S.;Karimi, O.;Khyaju, S.;Lestari, A. S.;Li, C. J. Y.;Li, H.;Li, L.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Lu, L.;Luangharn, T.;Luo, L.;Ma, J.;Madagammana, A. D.;Mapook, A.;Marasinghe, D. S.;Meng, Q. F.;Mukhopadyay, S.;Noorabadi, M. T.;Norphanphoun, C.;Pem, D.;Perera, R. H.;Phonemany, M.;Phukhamsakda, C.;Phutthacharoen, K.;Rathnayaka, A. R.;Samarakoon, B. C.;Seifollahi, E.;Su, H. L.;Sun, Y. R.;Sysouphanthong, P.;Tan, T. H.;Tang, X.;Tavakol, N. M.;Thiyagaraja, V;Thongklang, N.;Walker, A.;Wannasawang, N.;Wijesinghe, S. N.;Wu, N.;Xiong, Y. R.;Xu, R. F.;Xu, R. J.;Yang, H. D.;Yang, J.;Yang, Y. H.;Yasanthika, E.;Yu, F. M.;Zeng, M.;Zhang, F.;Zhang, J. Y.;Zin, H. H.;Hyde, K. D.;Amuhenage, T. B.;Apurillo, C. C. S.;Armand, A.;Asghari, R.;Bhunjun, C. S.;Boonmee, S.;Bundhun, D.;Chen, C.;Chethana, K. W. T.;Gajanayake, A. J.;Gentekaki, E.;Gomdola, D.;Gunarathne, A.;He, S.;Hurdeal, V. G.;Jayawardena, R. S.;Karimi, O.;Khyaju, S.;Lestari, A. S.;Li, C. J. Y.;Li, H.;Li, L.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Liu, X. F.;Luo, L.;Ma, J.;Madagammana, A. D.;Meng, Q. F.;Mukhopadyay, S.;Pem, D.;Phonemany, M.;Phutthacharoen, K.;Samarakoon, B. C.;Su, H. L.;Sun, Y. R.;Tang, X.;Thongklang, N.;Walker, A.;Wu, N.;Xiong, Y. R.;Xu, R. F.;Xu, R. J.;Yang, H. D.;Yang, Y. H.;Yasanthika, E.;Yu, F. M.;Zeng, M.;Zhang, F.;Zhang, J. Y.;Zin, H. H.;Abdel-Wahab, M. A.;Abdollahzadeh, J.;Abeywickrama, P. D.;Yan, J. Y.;Zhang, W.;Absalan, S.;Afshari, N.;de Silva, N., I;Lumyong, S.;Promputtha, I;Tennakoon, D. S.;Ainsworth, A. M.;Kirk, P. M.;Liimatainen, K.;Akulov, O. Y.;Aleoshin, V. V.;Mikhailov, K., V;Aleoshin, V. V.;Mikhailov, K., V;Al-Sadi, A. M.;Thamodini, G. K.;Alvarado, P.;Alves, A.;Amalfi, M.;De Kesel, A.;Ertz, D.;Haelewaters, D.;Amalfi, M.;Ertz, D.;Amira, Y.;Anderson, J. L.;Antonin, V;Aouali, S.;Aptroot, A.;Apurillo, C. C. S.;Araujo, J. P. M.;Ariyawansa, H. A.;Arumugam, E.;Gunaseelan, S.;Kaliyaperumal, M.;Kezo, K.;Murugadoss, R.;Assis, D. M. A.;Barbosa, R. N.;da Silva, D. K. A.;da Silva, G. A.;da Silva, R. M. F.;da Silva Santos, A. C.;de Oliveira, N. T.;Diniz, A. G.;Gibertoni, T. B.;Machado, A. R.;Malosso, E.;Meiras-Ottoni, A.;Melo, R. F. R.;Mendes-Alvarenga, R. L.;Santiago, A. L. C. M. A.;Souza-Motta, C. M.;Tiago, P., V;Vieira, L. C.;Atienza, V;Garrido-Benavent, I;Avasthi, S.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Bahkali, A. H.;Bhat, D. J.;Jones, E. B. G.;Bakhshi, M.;Zare, R.;Banihashemi, Z.;Bao, D. F.;Luo, Z. L.;Shen, H. W.;Baral, H. O.;Barata, M.;Barata, M.;Barbosa, F. R.;Barreto, R. W.;Thines, M.;Thines, M.;Thines, M.;Belamesiatseva, D. B.;Shabashova, T. G.;Bennett Reuel, M.;dela Cruz, T. E. E.;Bennett Reuel, M.;Bezerra, J. D. P.;Bezerra, J. D. P.;Bezerra, J. L.;Bhat, D. J.;Bianchinotti, M., V;Blaszkowski, J.;Boekhout, T.;Tedersoo, L.;Bonito, G.;Boonyuen, N.;Luangsa-ard, J. J.;Bregant, C.;Linaldeddu, B. T.;Buchanan, P.;Johnston, P. R.;McKenzie, E. H. C.;Burgaud, G.;Jany, J. L.;Burgess, T.;Buyck, B.;Cabarroi-Hernandez, M.;Castro-Jauregui, O.;Cortes-Perez, A.;Guzman-Davalos, L.;Ramirez-Cruz, V;Caceres, M. E. S.;Zhang, J. F.;Cai, L.;Raza, M.;Wei, X. L.;Cai, M. F.;Calabon, M. S.;Calaca, F. J. S.;Calaca, F. J. S.;Callalli, M.;Callalli, M.;Callalli, M.;Camara, M. P. S.;Cano-Lira, J. F.;Cantillo, T.;Cao, B.;He, M. Q.;Liu, F.;Liu, S. L.;Wang, K.;Zhao, R. L.;Zhou, L. W.;Carlavilla, J. R.;Carvalho, A.;Castaneda-Ruiz, R. F.;Castlebury, L.;Catania, M. D., V;Cavalcanti, L. H.;Cazabonne, J.;Cazabonne, J.;Cedeno-Sanchez, M. L.;Chaiwan, N.;Chakraborty, N.;Chaverri, P.;Chaverri, P.;Cheewangkoon, R.;Samarakoon, M. C.;Thiyagaraja, V;Chen, C. Y.;Chen, K. H.;Chen, Q.;Chen, W. H.;Chen, Y. P.;Dissanayake, A. J.;Li, W. L.;Liu, J. K.;Maharachchikumbura, S. S. N.;Tian, Q.;Tian, W. H.;Wu, N.;Yu, X. D.;Yu, Y. X.;Zhang, S. N.;Coleine, C.;Li, C. J. Y.;Selbmann, L.;Conde, T. O.;Corazon-Guivin, M. A.;Corazon-Guivin, M. A.;Costa-Rezende, D. H.;Courtecuisse, R.;Crouch, J. A.;Crous, P. W.;Groenewald, J. Z.;Groenewald, M.;Herandez-Restrepo, M.;Houbraken, J.;Sandoval-Denis, M.;Cui, B. K.;Dai, Y. C.;He, S. H.;Li, Y.;Liu, S.;Liu, Z. B.;Song, C. G.;Sun, Y. F.;Wang, C. G.;Xu, T. M.;Yuan, Y.;Zhang, Q. Y.;Zhang, Y.;Zhao, H.;Zhou, M.;Cui, Y. Y.;Ge, Z-W;He, S.;Li, Y. C.;Luo, L.;Su, H. L.;Wang, X. Y.;Worthy, F. R.;Xu, R. F.;Xu, R. J.;Cui, Y. Y.;Li, Y. C.;Wang, X. Y.;Worthy, F. R.;Wu, G.;da Silva, I. R.;Anderson, J. L.;Fernandes, I;Fryar, S. C.;Damm, U.;Darmostuk, V;Flakus, A.;Janik, P.;Rodriguez-Flakus, P.;Ronikier, A.;Zoha, Daroodi;Das, K.;Das, K.;Davoodian, N.;Davydov, E. A.;Dayarathne, M. C.;Decock, C.;Blondelle, A.;de Groot, M. D.;De Lange, R.;Haelewaters, D.;Santamaria, B.;Schoutteten, N.;Sulistyo, B.;Van Caenegem, W.;de Groot, M. D.;Zamora, J. C.;Karakehian, J. M.;Delgado, G.;Denchev, C. M.;Denchev, T. T.;de Silva, N., I;Tennakoon, D. S.;de Souza, F. A.;Dentinger, B.;Devadatha, B.;Devadatha, B.;Dianese, J. C.;Dima, B.;Dissanayake, L. S.;Dogan, H. H.;Chen, C.;Doilom, M.;Dong, W.;Dong, Z. Y.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Luo, M.;Manawasinghe, I. S.;Xiong, Y. R.;Xu, B.;Yang, Y. H.;Zhang, Y. X.;Dolatabadi, S.;Ma, J.;Nanayakkara, C. M.;Dos Santos, L. A.;Alves-Silva, G.;Drechsler-Santos, E. R.;Dubey, M. K.;Dutta, A. K.;Egidi, E.;Elliott, T. F.;Elshahed, M. S.;Youssef, N. H.;Erdogdu, M.;Etayo, J.;Evans, H. C.;Fan, X. L.;Fan, Y. G.;Fedosova, A. G.;Zhurbenko, M. P.;Fell, J.;Fernandes, I;Fernandes, I;Firmino, A. L.;Fiuza, P. O.;Xu, R.;Fragoso de Souza, C. A.;Frisvad, J. C.;Fryar, S. C.;Gabaldon, T.;Torruella, G.;Gabaldon, T.;Torruella, G.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gannibal, P. B.;Gannibal, P. B.;Garcia, D.;Gene, D. J.;Garcia, D.;Gene, D. J.;Garcia-Sandoval, S. R.;Garcia-Sandoval, S. R.;Senanayake, I. C.;Garzoli, L.;Gautam, A. K.;Wu, H. X.;Ghobad-Nejhad, M.;Giachini, A. J.;Goes-Neto, A.;Galindo, L. J.;Gorjon, S. P.;Goto, B. T.;Granados-Montero, M. M.;Granados-Montero, M. M.;Griffith, G. W.;Grossart, H. P.;Grossart, H. P.;Gueidan, C.;Baschien, C.;Yurkov, A.;Gusmao, L. F. P.;Gutierrez, A. C.;Chen, J.;Haelewaters, D.;Haelewaters, D.;Halling, R.;Halling, R.;Han, Y. F.;Hapuarachchi, K. K.;Zhao, C. L.;Harder, C. B.;Harrington, T. C.;Hattori, T.;Wu, W. P.;Healy, R.;Heredia, G.;Hodge, K. T.;Iturriaga, T.;Holgado-Rojas, M.;Holgado-Rojas, M.;Holgado-Rojas, M.;Hongsanan, S.;Hongsanan, S.;Horak, E.;Horak, E.;Hosoya, T.;Takamatsu, S.;Huang, S. K.;Hur, J. S.;Hustad, V. P.;Iotti, M.;Leonardi, M.;Rossi, W.;Jafar, E.;Xu, R.;Jayalal, R. G. U.;Jayasiri, S. C.;Jayawardena, R. S.;Jeewon, R.;Jeewon, R.;Jin, J.;Zafari, D.;Jones, E. B. G.;Zhang, H.;Justo, A.;Kaishian, P.;Kakishima, M.;Piepenbring, M.;Kang, G. P.;Tan, T. H.;Kang, G. P.;Tan, T. H.;Kang, J. C.;Karpov, S. A.;Karunarathna, S. C.;Kaufmann, M.;Kemler, M.;Kirchmair, M.;Neuhauser, S.;Peintner, U.;Zucconi, L.;Kitaura, M. J.;Klawonn, I;Kolarik, M.;Kong, A.;Kuhar, F.;Kukwa, M.;Kumar, S.;Kusan, I;Matocec, N.;Mesic, A.;Posta, A.;Tkalcec, Z.;Lado, C.;Larsson, K. H.;Larsson, K. H.;Latha, K. P. D.;Leontyev, D. L.;Leontyev, D. L.;Lestari, A. S.;Li, D. W.;Li, H. Y.;Li, L.;Lu, Y. Z.;Ma, J.;Zhang, J. Y.;Li, Q. R.;Wurzbacher, C.;Xiao, Y. P.;Lee, H. B.;Wijayawardene, N. N.;Lim, Y. W.;Lim, Y. W.;Lin, C. G.;Linde, C. C.;Liu, N. G.;Liu, N. G.;Liu, X. Y.;Liu, X. Z.;Wisitrassameewong, K.;Lumbsch, H. T.;Lumyong, S.;Lumyong, S.;White, J. F.;Zeng, N. K.;Madrid, H.;Magurno, F.;Magyar, D.;Mahadevan, N.;Mahadevan, N.;Maharachchikumbura, S. S. N.;Maimaiti, Y.;Raza, M.;Manamgoda, D. S.;Udayanga, D.;Wartchow, F.;Mardones, M.;Cedeno-Sanchez, M. L.;Marin-Felix, Y.;Stadler, M.;Cedeno-Sanchez, M. L.;Marin-Felix, Y.;Stadler, M.;Marquez, R.;Masigol, H.;May, T. W.;Yuan, H. S.;Mendieta, S.;Meng, Q. F.;Menkis, A.;Menolli, N., Jr.;Nascimento, C. C.;Silva-Filho, A. G. S.;Meza Calvo, J. G.;Miller, S. L.;Moncada, B.;Moncada, B.;Moncalvo, J. M.;Moncalvo, J. M.;Monteiro, J. S.;Monteiro, J. S.;Monteiro, M.;Mora-Montes, H. M.;Moreau, P. A.;Mueller, G. M.;Nagy, L. G.;Najafiniya, M.;Nascimento, C. C.;Nei, Y.;Neves, M. A.;Niego, A. G. T.;Nilsson, R. H.;Niskanen, T.;Niveiro, N.;Noordeloos, M. E.;Noordeloos, M. E.;Nunez Otano, N. B.;O'Donnell, R. P.;Oehl, F.;Olariaga, I;Orlando, O. P.;Pang, K. L.;Pang, K. L.;Papp, V;Pawlowska, J.;Pereira, O. L.;Perera, R. H.;Perera, R. H.;Perez-Moreno, J.;Perez-Ortega, S.;Peter, G.;Phillips, A. J. L.;Jeronimo, G. H.;Jesus, A. L.;Pires-Zottarelli, C. L. A.;Poinar, G.;Prieto, M.;Quandt, C. A.;Radek, R.;Rahnama, K.;Raj, K. N. A.;Rajeshkumar, K. C.;Sruthi, O. P.;Rama, T.;Rama, T.;Rambold, G.;Rasconi, S.;Ren, G. C.;Ren, G. C.;Robledo, G. L.;Flakus, A.;Rodriguez-Flakus, P.;Ryberg, M.;Ryvarden, L. R.;Salvador-Montoya, C. A.;Samant, B.;Sanchez-Castro, I;Sanchez-Garcia, M.;Sarma, V. V.;Savchenko, A.;Savchenko, K.;Saxena, R. K.;Scholler, M.;Selbmann, L.;Selcuk, F.;Senanayake, I. C.;Shen, Y. M.;Simmons, D. R.;Singh, R.;Sir, E. B.;Yu, Q.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stephenson, S. L.;Strassert, J. F. H.;Su, L.;Su, L.;Suetrong, S.;Norphanphoun, C.;Sun, Y. R.;Wang, Y.;Zeng, X. Y.;Svantesson, S.;Svantesson, S.;Takamatsu, S.;Tanaka, K.;Tang, A. M. C.;Tang, X.;Wei, D. P.;Tanney, J. B.;Taylor, J. E.;Taylor, P. W. J.;Tedersoo, L.;Zhang, F.;Zhang, J. F.;Thiyagaraja, V;Wanasinghe, D. N.;Tibell, L.;Tibell, S.;Tomsovsky, M.;Toome-Heller, M.;Yakovchenko, L.;Yang, H. D.;Yang, Z. L.;Yu, F. M.;Zeng, M.;Zhao, Q.;Tsurykau, A.;Tsurykau, A.;Untereiner, W. A.;Uzunov, B. A.;Valle, L. G.;Van den Wyngaert, S.;Van Vooren, N.;Velez, P.;Verma, R. K.;Vieira, W. A. S.;Vizzini, A.;Walker, A. K.;Yapa, N.;Joshi, Y.;Wang, S. X.;Wijesundara, D. S. A.;Xu, L. J.;Yu, Z. F.

    关键词：classification; nomenclature; scientific criticism; taxonomy

微信小程序