Isolation and characterization of Calcineurin B-like gene (PbCBL1) and its promoter in birch-leaf pear (Pyrus betulifolia Bunge)

文献类型： 外文期刊

第一作者： Xu, Y. Y.

作者： Xu, Y. Y.;Li, H.;Lin, J.;Li, X. G.;Chang, Y. H.

作者机构：

关键词： Environmental stress;Expression characteristic;GUS;PbCBL1;Pyrus betulifolia Bunge;Promoter

期刊名称：GENETICS AND MOLECULAR RESEARCH （ 影响因子：0.764； 五年影响因子：0.912 ）

ISSN： 1676-5680

年卷期： 2015 年 14 卷 4 期

页码：

收录情况： SCI

摘要： Calcium plays a critical role in regulating abiotic stress responses in plants. Calcineurin B-like (CBL) proteins are calcium sensors in calcium signaling pathways. However, the molecular mechanisms underlying calcium signaling remain to be elucidated. In this study, the CBL1 gene, which codes for the CBL protein, was isolated from the birch-leaf pear. One 2,969-bp sequence was cloned using PCR, and using the cloned 2,027-bp sequence was isolated from pear genomic DNA via genome walking. Sequencing analysis revealed that the 4,996-bp sequence was a PbCBL1 gene consisting of eight exons and seven introns, and the 2,027-bp sequence was identified as the promoter of the PbCBL1 gene, which contains the basic promoter elements TATA and CAAT boxes. In addition, some other cis-acting elements including heat, cold, drought, and hormone responsive elements were also present. To further investigate the activity of this promoter, the sequence was used to drive a GUS fusion gene into leaf discs of tobacco (Nicotiana benthamiana) with Agrobacterium-mediated transformation method. GUS gene expression could be regulated by the PbCBL1 promoter following induction by GA, ABA, SA, and MeJA. Furthermore, the results of real-time RT-qPCR indicate that the PbCBL1 gene can respond to changes in the intracellular calcium concentration, and that it can be induced by cold, heat, drought, and stress by several hormones including GA, ABA, SA, and MeJA. PbCBL1 gene may be involved in several signal transduction pathways, and play an important role in the condition of adversity stress in pear.

分类号：

  • 相关文献

[1]Isolation of a maize beta-glucosidase gene promoter and characterization of its activity in transgenic tobacco. Gu, Riliang,Zhao, Li,Zhang, Ying,Chen, Xiaoping,Bao, Juan,Zhao, Jinfeng,Wang, Zhangying,Fu, Junjie,Liu, Tingsong,Wang, Jianhua,Wang, Guoying. 2006

[2]The characterization of GmTIP, a root-specific gene from soybean, and the expression analysis of its promoter. Chen, Li,Jiang, Bingjun,Wu, Cunxiang,Sun, Shi,Hou, Wensheng,Han, Tianfu.

[3]A novel constitutive promoter and its downstream 5 ' UTR derived from cotton (Gossypium spp.) drive high-level gene expression in stem and leaf tissues. Sun Bao,Sun Guo-qing,Meng Zhi-gang,Zhang Rui,Guo San-dui. 2016

[4]GmPRP2 promoter drives root-preferential expression in transgenic Arabidopsis and soybean hairy roots. Chen, Li,Jiang, Bingjun,Wu, Cunxiang,Sun, Shi,Hou, Wensheng,Han, Tianfu. 2014

[5]A 796 bp PsPR10 gene promoter fragment increased root-specific expression of the GUS reporter gene under the abiotic stresses and signal molecules in tobacco. Xu, Xiangbin,Guo, Sai,Chen, Kai,Liu, Junjun,Wang, Huizhong,Song, Hongmiao,Liu, Junjun,Guo, Longbiao,Qian, Qian.

[6]Cloning and characterization of PHGPx and its synergistic role with p53 in mediating stress in Penaeus monodon. Li, Fuxiang,Wang, Pengfei,Zhao, Chao,Qiu, Lihua,Li, Fuxiang,Li, Fuxiang,Wang, Pengfei,Zhao, Chao,Qiu, Lihua,Qiu, Lihua,Bao, Weiyang. 2017

[7]Concurrent Effects of Sediment Accretion and Nutrient Availability on the Clonal Growth Strategy of Carex brevicuspis-A Wetland Sedge That Produces Both Spreading and Clumping Ramets. Xie, Yonghong,Li, Feng,Deng, Zhengmiao,Hou, Zhiyong,Wu, Chao,Chen, Xinsheng,Xie, Yonghong,Li, Feng,Deng, Zhengmiao,Hou, Zhiyong,Wu, Chao,Liao, Yulin. 2017

[8]Regulation of plant stress response by dehydration responsive element binding (DREB) transcription factors. Zhou, Mei-Liang,Ma, Jiang-Tao,Pang, Jun-Feng,Tang, Yi-Xiong,Wu, Yan-Min,Ma, Jiang-Tao,Pang, Jun-Feng,Zhang, Zhan-Lu,Zhou, Mei-Liang. 2010

[9]Drought-induced site-specific DNA methylation and its association with drought tolerance in rice (Oryza sativa L.). Wang, Wen-Sheng,Pan, Ya-Jiao,Zhao, Xiu-Qin,Zhu, Ling-Hua,Fu, Bin-Ying,Li, Zhi-Kang,Wang, Wen-Sheng,Dwivedi, D.,Ali, J.,Li, Zhi-Kang.

[10]Promotive effects of 5-aminolevulinic acid on photosynthesis and chlorophyll fluorescence of tomato seedlings under suboptimal low temperature and suboptimal photon flux density stress - Short communication. Guo, Xiaoqing,Li, Yansu,Yu, Xianchang. 2012

[11]Genetic analysis and QTL detection of reproductive period and post-flowering photoperiod responses in soybean. Cheng, Lirui,Wang, Ying,Zhang, Chunbin,Wu, Cunxiang,Xu, Jianlong,Zhu, Huiying,Leng, Jiantian,Bai, Yangnian,Guan, Rongxia,Hou, Wensheng,Han, Tianfu,Cheng, Lirui,Zhang, Lijuan.

[12]The mRNA Expression Profiles of Five Heat Shock Protein Genes from Frankliniella occidentalis at Different Stages and Their Responses to Temperatures and Insecticides. Wang Li-xia,Li Xue,Lei Zhong-ren,Reitz, Stuart R.,Wang Shuai-yu. 2014

[13]Stress relief may promote the evolution of greater phenotypic plasticity in exotic invasive species: a hypothesis. Huang, Qiao Q.,Fan, Zhi W.,Huang, Qiao Q.,Peng, Shao L.,Pan, Xiao Y.. 2015

[14]SpBADH of the halophyte Sesuvium portulacastrum strongly confers drought tolerance through ROS scavenging in transgenic Arabidopsis. Yang, Chenglong,Zhou, Yang,Fan, Jie,Shen, Longbin,Yao, Yuan,Li, Ruimei,Fu, Shaoping,Duan, Ruijun,Guo, Jianchun,Yang, Chenglong,Zhou, Yang,Fan, Jie,Shen, Longbin,Yao, Yuan,Li, Ruimei,Fu, Shaoping,Duan, Ruijun,Guo, Jianchun,Yang, Chenglong,Fu, Yuhua,Zhou, Yang,Fan, Jie,Hu, Xinwen.

[15]Molecular cloning and characterization of phospholipase D from Jatropha curcas. Wang, Wenguo,Gao, Jihai,Chen, Fang,Wang, Shenghua,Xu, Ying,Tang, Lin,Jia, Yongjiong,Yao, Lin.

[16]Expression and Enzyme Activity of Catalase in Chilo suppressalis (Lepidoptera: Crambidae) Is Responsive to Environmental Stresses. Lu, Yanhui,Bai, Qi,Zheng, Xusong,Lu, Zhongxian,Bai, Qi.

[17]The Commelina Yellow Mottle Virus promoter is a strong promoter in vascular tissue of transgenic Gossypium hirsutum plants. Yuan, ZQ,Wu, JH,Wu, B,Li, YE,Chen, ZX,Li, SJ,Tian, YC. 2000

[18]Efficient regeneration and genetic transformation platform applicable to five Musa varieties. Liu, Juhua,Gao, Pengzhao,Zhang, Jing,Jia, Caihong,Zhang, Jianbin,Hu, Wei,Xu, Biyu,Jin, Zhiqiang,Sun, Peiguang,Wang, Jiashui,Jin, Zhiqiang,Sun, Xiuxiu. 2017

[19]Estimating the copy number of transgenes in transformed rice by real-time quantitative PCR. Yang, LT,Ding, JY,Zhang, CM,Jia, JW,Weng, HB,Liu, WX,Zhang, DB. 2005

[20]Activation of three pathogen-inducible promoters in transgenic citrus (Citrus sinensis Osbeck) after Xanthomonas axonopodis pv. citri infection and wounding. Zou, Xiuping,Song, Erling,Peng, Aihong,He, Yongrui,Xu, Lanzhen,Lei, Tiangang,Yao, Lixiao,Chen, Shanchun,Zou, Xiuping,Peng, Aihong,He, Yongrui,Xu, Lanzhen,Lei, Tiangang,Yao, Lixiao,Chen, Shanchun.

作者其他论文 更多>>
  • Mycosphere Notes 521-571: A special edition of fungal biodiversity to celebrate Kevin D. Hyde's 70th birthday and his exceptional contributions to Mycology

    作者：Hongsanan, S.;Khuna, S.;Xie, N.;de Silva, N., I;Tennakoon, D. S.;Manawasinghe, I. S.;Tibpromma, S.;Dai, D. Q.;Han, L. S.;Liu, X. F.;Lu, L.;Lu, W. H.;Wijayawardene, N. N.;Xu, R. F.;Zhang, G. Q.;Zheng, D. G.;Karunarathna, S. C.;Chethana, K. W. T.;Chen, C.;Luangharn, T.;Pem, D.;Xia, G.;Bhunjun, C. S.;Gao, Y.;Han, X. X.;Jayawardena, R. S.;Khyaju, S.;Lei, L.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Liu, X. F.;Lu, L.;Meng, Q. F.;Mi, L. X.;Peng, X. C.;Su, H. L.;Tun, Z. L.;Xiong, Y. R.;Xu, R. F.;Yang, Y. H.;Zhang, X.;Zhao, H. J.;Chethana, K. W. T.;Bhunjun, C. S.;Gao, Y.;Han, X. X.;Jayawardena, R. S.;Khyaju, S.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Liu, X. F.;Lu, L.;Meng, Q. F.;Mi, L. X.;Peng, X. C.;Su, H. L.;Tun, Z. L.;Xu, R. F.;Yang, Y. H.;Zhang, X.;Zhao, H. J.;Bagacay, J. F. E.;Calabon, M. S.;Opina, L. A. D.;Sadaba, R. B.;Lei, L.;Bagacay, J. F. E.;Calabon, M. S.;Opina, L. A. D.;Sadaba, R. B.;Chen, C.;Doilom, M.;Tan, Q.;Xia, G.;Dong, W.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Liu, J. W.;Luo, M.;Xiong, Y. R.;Yang, Y. H.;Zhao, H. J.;Chen, C.;Doilom, M.;Dong, W.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Liu, J. W.;Luo, M.;Yang, Y. H.;Zhao, H. J.;Du, Hy;Gafforov, Y.;Gafforov, Y.;Singh, R.;Yadav, S.;Zhang, X.;Zhang, X.;Zhao, Q.;Lei, L.;Thiyagaraja, V;Cao, B.;Leonardo-Silva, L.;Xavier-Santos, S.;Gui, H.;Khyaju, S.;Kumar, S.;Norphanphoun, C.;Yang, T.;Zeng, Xy;Yarasheva, M.;Zeng, Xy;Zhang, H.

    关键词：41 new species; Ascomycota; Basidiomycota; morphology; phylogeny

  • Effects of Biochar and α-Fe2O3 Nanoparticles on the Growth, Photosynthetic Apparatus and Fruit Quality of Medicinal Plant Muskmelon

    作者：Wang, Y.;Zhou, W.;Yi, L.;Dai, Z.;Qiu, L.;Zhou, Y.;Wang, S.;Li, H.;Li, J.;Wang, Y.;Zhou, W.;Yi, L.;Dai, Z.

    关键词：Cucumis melo; alpha-Fe2O3 nanoparticles; biochar; medicinal ingredients; muskmelon; fruit quality

  • Steinernema tarimense n. sp. (Rhabditida: Steinernematidae), a new entomopathogenic nematode from Tarim Basin, Xinjiang, China

    作者：Zhan, F.;Zhan, F.;Yang, R.;Bao, H.;Zhang, S.;Zhang, X.;Shi, Y.;Tian, C.;Li, H.;Tomalak, M.;Puza, V.;Guo, W.

    关键词：morphological description; phylogenetic systematics; Populus euphratica forest; Steinernema species; Tarim Basin

  • High-throughput proximal ground crop phenotyping systems - A comprehensive review

    作者：Rui, Z.;Zhang, Z.;Zhang, M.;Azizi, A.;Li, H.;Wang, M.;Rui, Z.;Zhang, Z.;Zhang, M.;Azizi, A.;Li, H.;Wang, M.;Igathinathane, C.;Cen, H.;Vougioukas, S.;Zhang, J.;Jiang, Y.;Jiao, X.;Ampatzidis, Y.;Oladele, O. I.;Ghasemi-Varnamkhasti, M.;Radi, Radi

    关键词：High-throughput phenotyping; Phenotyping platform; Sensing technology; Data processing; Precision agriculture

  • The 2024 Outline of Fungi and fungus-like taxa

    作者：Hyde, K. D.;Thiyagaraja, V;Kularathnage, N. D.;Li, Y. C.;Wang, Z. Y.;Zhao, Q.;Hyde, K. D.;Wijesinghe, S. N.;Armand, A.;Chethana, K. W. T.;Perera, R. H.;Phukhamsakda, C.;Wannasawang, N.;Asghari, R.;Aumentado, H. D. R.;Bera, I;Bhunjun, C. S.;Boonmee, S.;Bundhun, D.;Chaharmiri-Dokhaharani, S.;Gajanayake, A. J.;Gomdola, D.;Gunarathne, A.;He, S. C.;Htet, Z. H.;Jayawardena, R. S.;Karimi, O.;Khyaju, S.;Kularathnage, N. D.;Lestari, A. S.;Li, C.;Li, H.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Luangharn, T.;Luo, L.;Madagammana, A. D.;Mapook, A.;Meng, Q. F.;Mukhopadhyay, S.;Pathirana, L. S.;Pem, D.;Phonemany, M.;Phongeun, S.;Shu, Y. X.;Silva, V. S. H.;Su, H.;Sun, Y. R.;Sysouphanthong, P.;Tan, T. H.;Tang, X.;Thakshila, S. A. D.;Walker, A.;Wei, D. P.;Wu, N.;Xiong, Y. R.;Yang, H. D.;Yang, Y. H.;Yang, Y. Y.;Yu, F. M.;Yuan, L. L.;Zeng, M.;Zhang, J. Y.;Zhao, H. J.;Zhu, X. Y.;Hyde, K. D.;Noorabadi, M. T.;Chen, Y. P.;Manawasinghe, I. S.;Xu, B.;Yang, Y. H.;He, M. Q.;Johnston, P. R.;McKenzie, E. H. C.;Biketova, A. Y.;Biketova, A. Y.;Chethana, K. W. T.;Bhunjun, C. S.;Gomdola, D.;Htet, Z. H.;Jayawardena, R. S.;Li, H.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Luo, L.;Madagammana, A. D.;Meng, Q. F.;Rathnayaka, A. R.;Shu, Y. X.;Su, H.;Xiong, Y. R.;Yang, H. D.;Yang, Y. H.;Erdogdu, M.;Ge, Z. W.;Groenewald, J. Z.;Crous, P. W.;Groenewald, M.;Hernandez-Restrepo, M.;Houbraken, J.;Sandoval-Denis, M.;Hongsanan, S.;Khuna, S.;Kusan, I;Matocec, N.;Mesic, A.;Posta, A.;Tkalcec, Z.;Leontyev, D., V;Leontyev, D., V;Li, D. W.;Lin, C. G.;Liu, N. G.;Lu, Y. Z.;Tian, X. G.;Yang, Y.;Maharachchikumbura, S. S. N.;Tian, Q.;Chen, Y. P.;Dissanayake, A. J.;Liu, J. K.;Liu, J. W.;Madhushan, A.;Tian, W. H.;Zhang, S.;May, T. W.;Davoodian, N.;Piatek, M.;Czachura, P.;Darmostuk, V;Flakus, A.;Janik, P.;Ronikier, A.;Stryjak-Bogacka, M.;Worobiec, G.;Samarakoon, M. C.;Cheewankoon, R.;Chen, C.;Haituk, H.;Selcuk, F.;Ulukapi, M.;Senanayake, I. C.;Senanayake, I. C.;Tanney, J. B.;Vizzini, A.;Wanasinghe, D. N.;Dissanayake, A. J.;Wijayawardene, N. N.;Dai, D. Q.;Du, T. Y.;Jayasiri, S. C.;Karunarathna, S. C.;Liu, X. F.;Lu, L.;Tibpromma, S.;Xu, R. F.;Zhao, R. L.;Cao, B.;Chen, Q.;Li, J.;Liu, F.;Liu, S. L.;Wei, X.;Abdel-Wahab, M. A.;Abdollahzadeh, J.;Abeywickrama, P. D.;Abeywickrama, P. D.;Absalan, S.;Afshari, N.;Chaiwan, N.;Samaradiwakara, N. P.;Tennakoon, D. S.;Acharya, K.;Afshan, N. S.;Khalid, A. N.;Muhammad, U.;Najam Ul Sehar, A.;Naseer, A.;Niazi, A. R.;Sarwar, S.;Usman, M.;Afzalinia, S.;Ahmadpour, S. A.;Eisvand, P.;Mehrabi-Koushki, M.;Safi, A.;Akulov, O.;Alizadeh, A.;Alizadeh, M.;Al-Sadi, A. M.;Thamodini, G. K.;Alves, A.;Alves, V. C. S.;Alves-Silva, G.;Drechsler-Santos, E. R.;Antonin, V;Sevcikova, H.;Aouali, S.;Aptroot, A.;Apurillo, C. C. S.;Arias, R. M.;Heredia, G.;Asgari, B.;Zare, R.;Assis, D. M. A.;Barbosa, R. N.;da Silva, G. A.;da Silva, R. M. F.;da Silva Santos, A. C.;Diniz, A. G.;Gibertoni, T. B.;Lima, J. M. S.;Malosso, E.;Meiras-Ottoni, A. de;Mendes-Alvarenga, R. L.;Moura, J. C.;Santiago, A. L. C. M. A.;Souza-Motta, C. M.;Tiago, P., V;Assyov, B.;Denchev, C. M.;Denchev, T. T.;Atienza, V;Garrido-Benavent, I;Avasthi, S.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Bakhshi, M.;Druzhinina, I. S.;Bao, D. F.;Baral, H. O.;Barata, M.;Barata, M.;Barbosa, K. D.;Lima, J. L. R.;Nascimento, E. C. R.;Oliveira, N. V. L.;Queiroz, M. B.;Silva, H. F.;Barbosa, F. R.;Baroncelli, R.;Barreto, G. G.;Gusmao, L. F. P.;Baschien, C.;Schoutteten, N.;Bennett, R. M.;dela Cruz, T. E. E.;Bennett, R. M.;Bezerra, J. D. P.;Carvalho, T. G.;Bianchinotti, M., V;Bianchinotti, M., V;Blaszkowski, J.;Boekhout, T.;Bonito, G. M.;Boonyuen, N.;Luangsa-ard, J. J.;Bortnikov, F. M.;Fedosova, A. G.;Novozhilov, Y. K.;Zmitrovich, I., V;Bregant, C.;Linaldeddu, B. T.;Burgaud, G.;Buyck, B.;Caeiro, M. F.;Cabarroi-Hernandez, M.;Cortes-Perez, A.;Guzman-Davalos, L.;Ramirez-Cruz, V;Feng, Cai M.;Cai, L.;Feng, Cai M.;Calabon, M. S.;Calaca, F. J. S.;Calaca, F. J. S.;Calaca, F. J. S.;Callalli, M.;Callalli, M.;Camara, M. P. S.;Cano-Lira, J.;Garcia-Sanchez, D.;Gene, J.;Carlavilla, J. R.;Carvalho, A.;Carvalho, A.;Castaneda-Ruiz, R. F.;Catania, M. D., V;Salvador-Montoya, C. A.;Cazabonne, J.;Cazabonne, J.;Cedeno-Sanchez, M.;Stadler, M.;Chaiwan, N.;Haituk, H.;Chakraborty, N.;Chen, J.;Chinaglia, S.;Garzoli, L.;Marchese, P.;Coelho-Nascimento, C. C.;Coelho-Nascimento, C. C.;Coelho-Nascimento, C. C.;Menolli Jr, N.;Zabin, D. A.;Coleine, C.;Selbmann, L.;Zucconi, L.;Costa-Rezende, D. H.;Cortes-Perez, A.;Crouch, J. A.;Cruz, R. H. S. F.;Damm, U.;Daroodi, Z.;Mamarabadi, M.;Das, K.;Das, K.;Davydov, E. A.;da Silva, I. R.;Dai, Y. C.;Michiel, de Groot D.;De Lange, R.;Haelewaters, D.;Schoutteten, N.;De Kesel, A.;de Medeiros, E., V;de Souza, C. F. A.;de Souza, F. A.;Decock, C.;Delgado, G.;Denchev, C. M.;Denchev, T. T.;Deng, Y. L.;Dong, J. H.;Gu, Z. R.;Yang, X.;Yuan, Q.;Zhang, X. C.;Zhao, C. L.;Zhou, H. M.;Dentinger, B. T. M.;Dentinger, B. T. M.;Devadatha, B.;Devadatha, B.;Dianese, J. C.;Dima, B.;Doilom, M.;Dong, W.;Dong, Z. Y.;Li, Y.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Luo, M.;Dolatabadi, S.;Dubey, M. K.;Dutta, A. K.;Elliott, T. F.;Elshahed, M. S.;Vinzelj, J. M.;Youssef Noha, H.;Egidi, E.;Fan, L.;Fan, X.;Fan, X. L.;Ferro, L. O.;Fonseca, E. O.;Nascimento, S. S.;Oliveira Junior, I;Prazeres, J. F. S. A.;Fiuza, P. O.;Fryar, S. C.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gannibal, P. B.;Gao, F.;Garcia-Sandoval, R.;Gasca-Pineda, J.;Gautam, A. K.;Ghobad-Nejhad, M.;Ghosh, A.;Giachini, A. J.;Gentekaki, E.;Gmoshinskiy, V., I;Goes-Neto, A.;Gorjon, S. P.;Goto, B. T.;Granados-Montero, M. M.;Granados-Montero, M. M.;Griffith, G. W.;Grossart, H-P;Grossart, H-P;Gueidan, C.;Gunaseelan, S.;Guo, S. L.;Gutierrez, A. C.;Haelewaters, D.;Halling, R. E.;Hosoya, T.;Hoog, S. D.;Horak, E.;Hou, C. L.;Huang, S. K.;Huang, W. J.;Hurdeal, V. G.;Hustad, V. P.;Inacio, C. A.;Jayalal, R. G. U.;Jeewon, R.;Jeronimo, G. H.;Jin, J.;Jones, E. B. G.;Joshi, Y.;Jurjevic, Z.;Justo, A.;Kakishima, M.;Kaliyaperumal, M.;Kang, G. P.;Kang, G. P.;Kang, J. C.;Karpov, S. A.;Karpov, S. A.;Kezo, K.;Khan, M. K.;Kirchmair, M.;Neuhauser, S.;Peintner, U.;Klawonn, I;Kraisitudomsook, N.;Kukwa, M.;Kumar, S.;Lachance, M. A.;Lado, C.;Latha, K. P. D.;Lee, H. B.;Leonardi, M.;Lestari, A. S.;Li, Q.;Lima, N. B.;Lin, L.;Liu, S.;Liu, S.;Liu, X. Y.;Longcore, J. E.;Lumbsch, H. T.;Luo, Z. L.;Ma, J.;Madrid, H.;Magurno, F.;Magyar, D.;Mahadevakumar, S.;Malysh, J. M.;Manfrino, R. G.;Manimohan, P.;Mao, N.;Marasinghe, D. S.;Mardones, M.;Mardones, M.;Marin-Felix, Y.;Marin-Felix, Y.;Masigol, H.;Mehrabi, M.;Melo, R. F. R.;Mendieta, S.;Meng, Q. F.;Menkis, A.;Miksik, M.;Miller, S. L.;Moncada, B.;Moncada, B.;Moncalvo, J. M.;Moncalvo, J. M.;Monteiro, J. S.;Monteiro, J. S.;Monteiro, M.;Mora-Montes, H. M.;Moroz, E. L.;Nagy, G. L.;Najafiniya, M.;Nanayakkara, C. M.;Neves, M. A.;Yong, Nie;Nilsson, R. H.;Nogueira, P. T. S.;Noordeloos, M.;Norphanphoun, C.;Nunez Otano, N.;Zapata, C., V;O'Donnell, R. P.;Oehl, F.;Oliveira, J. A.;Oliveira, P. H. F.;Orihara, T.;Oset, M.;Pang, K. L.;Pang, K. L.;Papp, V;Pereira, O. L.;Perez-Moreno, J.;Perez-Ortega, S.;Peter, G.;Pires-Zottarelli, C. L. A.;Quan, Y.;Quandt, C. A.;Radek, R.;Rahnama, K.;Raj, K. N. A.;Rajeshkumar, K. C.;Soumyadeep, Rajwar;AB, Ralaiveloarisoa;Rama, T.;Rambold, G.;Raza, M.;Ren, G. C.;Rinaldi, A. C.;Rivas-Ferreiro, M.;Robledo, G. L.;Rossi, W.;Rusevska, K.;Ryberg, M.;Salimi, F.;Samant, B.;Sanchez-Castro, I;Santos, A. C. D. S.;Santos, L. A. dos;Sarma, V. V.;Savchenko, A.;Savchenko, A.;Saxena, R. K.;Schoutteten, N.;Schoutteten, N.;Sharma, A.;Shen, H. W.;Shen, Y. M.;Silva-Filho, A. G. S.;Simmons, D. R.;Singh, R.;Sir, E. B.;Sir, E. B.;Sir, E. B.;Sohrabi, M.;de Souza, F. A.;Sri-indrasutdhi, V;Sruthi, O. P.;Stemler, J.;Stemler, J.;Feng, Cai M.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stephenson, S. L.;Stoyneva-Gaertner, M. P.;Strassert, J. F. H.;Su, H.;Svantesson, S.;Takamatsu, S.;Tan, T. H.;Tan, T. H.;Tanaka, K.;Tang, C.;Taylor, J. E.;Taylor, P. W. J.;Thambugala, K. M.;Thilanga, D.;Thines, M.;Thines, M.;Tokarev, Y. S.;Tomsovsky, M.;Torruella, G.;Tsurykau, A.;Udayanga, D.;Untereiner, W. A.;Uzunov, B. A.;Vadthanarat, S.;Valenzuela, R.;Van den Wyngaert, S.;Van Vooren, N.;Velez, P.;Verma, R. K.;Verma, R. K.;Vieira, W. A. S.;Tang, A. M. C.;Walker, A. K.;Wang, Q. M.;Wang, Y.;Wang, X. Y.;Wang, Z. Y.;Wannathes, N.;Wartchow, F.;Weerakoon, G.;White, J. F.;Wijesundara, D. S. A.;Wisitrassameewong, K.;Wu, H. X.;Xiong, Y. R.;Xu, J. P.;Xu, R.;Xu, R. J.;Yadav, S.;Yakovchenko, L. S.;Yoshioka, R.;Yoshioka, R.;Yu, Z. F.;Zamora, J. C.;Zeng, X. Y.;Zhang, J. F.;Zhang, J. F.;Zhao, H.;Zvyagina, E.;Zvyagina, E.

    关键词：classes; classification; families; genera; orders; phyla

  • Low-depth Raw Reads of Nanopore Sequencing Enables Rapid and Accurate Bacterial Identification

    作者：Gao, W.;Hong, W.;Wu, Y.;Liu, Y.;Fan, X.;Wang, H.;Wang, M.;Yang, B.;Wang, T.;Li, H.;Liu, S.;Li, J.

    关键词：assembly; reads; Nanopore sequencing; Illumina sequencing; bacterial identification

  • Global consortium for the classification of fungi and fungus-like taxa

    作者：Hyde, K. D.;Dai, D. Q.;Du, T. Y.;Li, Q.;Liu, X. F.;Tibpromma, S.;Wijayawardene, N. N.;Hyde, K. D.;Absalan, S.;Afshari, N.;Amuhenage, T. B.;Apurillo, C. C. S.;Armand, A.;Asghari, R.;Bera, I;Bhunjun, C. S.;Boonmee, S.;Bundhun, D.;Chaharmiri-Dokhaharani, S.;Chen, C.;Chethana, K. W. T.;Du, T. Y.;Gajanayake, A. J.;Gentekaki, E.;Gomdola, D.;Gomes de Farias, A. R.;Gunarathne, A.;He, S.;Huanraluek, N.;Hurdeal, V. G.;Jayawardena, R. S.;Karimi, O.;Khyaju, S.;Lestari, A. S.;Li, C. J. Y.;Li, H.;Li, L.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Lu, L.;Luangharn, T.;Luo, L.;Ma, J.;Madagammana, A. D.;Mapook, A.;Marasinghe, D. S.;Meng, Q. F.;Mukhopadyay, S.;Noorabadi, M. T.;Norphanphoun, C.;Pem, D.;Perera, R. H.;Phonemany, M.;Phukhamsakda, C.;Phutthacharoen, K.;Rathnayaka, A. R.;Samarakoon, B. C.;Seifollahi, E.;Su, H. L.;Sun, Y. R.;Sysouphanthong, P.;Tan, T. H.;Tang, X.;Tavakol, N. M.;Thiyagaraja, V;Thongklang, N.;Walker, A.;Wannasawang, N.;Wijesinghe, S. N.;Wu, N.;Xiong, Y. R.;Xu, R. F.;Xu, R. J.;Yang, H. D.;Yang, J.;Yang, Y. H.;Yasanthika, E.;Yu, F. M.;Zeng, M.;Zhang, F.;Zhang, J. Y.;Zin, H. H.;Hyde, K. D.;Amuhenage, T. B.;Apurillo, C. C. S.;Armand, A.;Asghari, R.;Bhunjun, C. S.;Boonmee, S.;Bundhun, D.;Chen, C.;Chethana, K. W. T.;Gajanayake, A. J.;Gentekaki, E.;Gomdola, D.;Gunarathne, A.;He, S.;Hurdeal, V. G.;Jayawardena, R. S.;Karimi, O.;Khyaju, S.;Lestari, A. S.;Li, C. J. Y.;Li, H.;Li, L.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Linn, M. M.;Liu, X. F.;Luo, L.;Ma, J.;Madagammana, A. D.;Meng, Q. F.;Mukhopadyay, S.;Pem, D.;Phonemany, M.;Phutthacharoen, K.;Samarakoon, B. C.;Su, H. L.;Sun, Y. R.;Tang, X.;Thongklang, N.;Walker, A.;Wu, N.;Xiong, Y. R.;Xu, R. F.;Xu, R. J.;Yang, H. D.;Yang, Y. H.;Yasanthika, E.;Yu, F. M.;Zeng, M.;Zhang, F.;Zhang, J. Y.;Zin, H. H.;Abdel-Wahab, M. A.;Abdollahzadeh, J.;Abeywickrama, P. D.;Yan, J. Y.;Zhang, W.;Absalan, S.;Afshari, N.;de Silva, N., I;Lumyong, S.;Promputtha, I;Tennakoon, D. S.;Ainsworth, A. M.;Kirk, P. M.;Liimatainen, K.;Akulov, O. Y.;Aleoshin, V. V.;Mikhailov, K., V;Aleoshin, V. V.;Mikhailov, K., V;Al-Sadi, A. M.;Thamodini, G. K.;Alvarado, P.;Alves, A.;Amalfi, M.;De Kesel, A.;Ertz, D.;Haelewaters, D.;Amalfi, M.;Ertz, D.;Amira, Y.;Anderson, J. L.;Antonin, V;Aouali, S.;Aptroot, A.;Apurillo, C. C. S.;Araujo, J. P. M.;Ariyawansa, H. A.;Arumugam, E.;Gunaseelan, S.;Kaliyaperumal, M.;Kezo, K.;Murugadoss, R.;Assis, D. M. A.;Barbosa, R. N.;da Silva, D. K. A.;da Silva, G. A.;da Silva, R. M. F.;da Silva Santos, A. C.;de Oliveira, N. T.;Diniz, A. G.;Gibertoni, T. B.;Machado, A. R.;Malosso, E.;Meiras-Ottoni, A.;Melo, R. F. R.;Mendes-Alvarenga, R. L.;Santiago, A. L. C. M. A.;Souza-Motta, C. M.;Tiago, P., V;Vieira, L. C.;Atienza, V;Garrido-Benavent, I;Avasthi, S.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Azevedo, E.;Caeiro, M. F.;Bahkali, A. H.;Bhat, D. J.;Jones, E. B. G.;Bakhshi, M.;Zare, R.;Banihashemi, Z.;Bao, D. F.;Luo, Z. L.;Shen, H. W.;Baral, H. O.;Barata, M.;Barata, M.;Barbosa, F. R.;Barreto, R. W.;Thines, M.;Thines, M.;Thines, M.;Belamesiatseva, D. B.;Shabashova, T. G.;Bennett Reuel, M.;dela Cruz, T. E. E.;Bennett Reuel, M.;Bezerra, J. D. P.;Bezerra, J. D. P.;Bezerra, J. L.;Bhat, D. J.;Bianchinotti, M., V;Blaszkowski, J.;Boekhout, T.;Tedersoo, L.;Bonito, G.;Boonyuen, N.;Luangsa-ard, J. J.;Bregant, C.;Linaldeddu, B. T.;Buchanan, P.;Johnston, P. R.;McKenzie, E. H. C.;Burgaud, G.;Jany, J. L.;Burgess, T.;Buyck, B.;Cabarroi-Hernandez, M.;Castro-Jauregui, O.;Cortes-Perez, A.;Guzman-Davalos, L.;Ramirez-Cruz, V;Caceres, M. E. S.;Zhang, J. F.;Cai, L.;Raza, M.;Wei, X. L.;Cai, M. F.;Calabon, M. S.;Calaca, F. J. S.;Calaca, F. J. S.;Callalli, M.;Callalli, M.;Callalli, M.;Camara, M. P. S.;Cano-Lira, J. F.;Cantillo, T.;Cao, B.;He, M. Q.;Liu, F.;Liu, S. L.;Wang, K.;Zhao, R. L.;Zhou, L. W.;Carlavilla, J. R.;Carvalho, A.;Castaneda-Ruiz, R. F.;Castlebury, L.;Catania, M. D., V;Cavalcanti, L. H.;Cazabonne, J.;Cazabonne, J.;Cedeno-Sanchez, M. L.;Chaiwan, N.;Chakraborty, N.;Chaverri, P.;Chaverri, P.;Cheewangkoon, R.;Samarakoon, M. C.;Thiyagaraja, V;Chen, C. Y.;Chen, K. H.;Chen, Q.;Chen, W. H.;Chen, Y. P.;Dissanayake, A. J.;Li, W. L.;Liu, J. K.;Maharachchikumbura, S. S. N.;Tian, Q.;Tian, W. H.;Wu, N.;Yu, X. D.;Yu, Y. X.;Zhang, S. N.;Coleine, C.;Li, C. J. Y.;Selbmann, L.;Conde, T. O.;Corazon-Guivin, M. A.;Corazon-Guivin, M. A.;Costa-Rezende, D. H.;Courtecuisse, R.;Crouch, J. A.;Crous, P. W.;Groenewald, J. Z.;Groenewald, M.;Herandez-Restrepo, M.;Houbraken, J.;Sandoval-Denis, M.;Cui, B. K.;Dai, Y. C.;He, S. H.;Li, Y.;Liu, S.;Liu, Z. B.;Song, C. G.;Sun, Y. F.;Wang, C. G.;Xu, T. M.;Yuan, Y.;Zhang, Q. Y.;Zhang, Y.;Zhao, H.;Zhou, M.;Cui, Y. Y.;Ge, Z-W;He, S.;Li, Y. C.;Luo, L.;Su, H. L.;Wang, X. Y.;Worthy, F. R.;Xu, R. F.;Xu, R. J.;Cui, Y. Y.;Li, Y. C.;Wang, X. Y.;Worthy, F. R.;Wu, G.;da Silva, I. R.;Anderson, J. L.;Fernandes, I;Fryar, S. C.;Damm, U.;Darmostuk, V;Flakus, A.;Janik, P.;Rodriguez-Flakus, P.;Ronikier, A.;Zoha, Daroodi;Das, K.;Das, K.;Davoodian, N.;Davydov, E. A.;Dayarathne, M. C.;Decock, C.;Blondelle, A.;de Groot, M. D.;De Lange, R.;Haelewaters, D.;Santamaria, B.;Schoutteten, N.;Sulistyo, B.;Van Caenegem, W.;de Groot, M. D.;Zamora, J. C.;Karakehian, J. M.;Delgado, G.;Denchev, C. M.;Denchev, T. T.;de Silva, N., I;Tennakoon, D. S.;de Souza, F. A.;Dentinger, B.;Devadatha, B.;Devadatha, B.;Dianese, J. C.;Dima, B.;Dissanayake, L. S.;Dogan, H. H.;Chen, C.;Doilom, M.;Dong, W.;Dong, Z. Y.;Li, H.;Li, Y. X.;Liao, C. F.;Luo, M.;Manawasinghe, I. S.;Xiong, Y. R.;Xu, B.;Yang, Y. H.;Zhang, Y. X.;Dolatabadi, S.;Ma, J.;Nanayakkara, C. M.;Dos Santos, L. A.;Alves-Silva, G.;Drechsler-Santos, E. R.;Dubey, M. K.;Dutta, A. K.;Egidi, E.;Elliott, T. F.;Elshahed, M. S.;Youssef, N. H.;Erdogdu, M.;Etayo, J.;Evans, H. C.;Fan, X. L.;Fan, Y. G.;Fedosova, A. G.;Zhurbenko, M. P.;Fell, J.;Fernandes, I;Fernandes, I;Firmino, A. L.;Fiuza, P. O.;Xu, R.;Fragoso de Souza, C. A.;Frisvad, J. C.;Fryar, S. C.;Gabaldon, T.;Torruella, G.;Gabaldon, T.;Torruella, G.;Gabaldon, T.;Gabaldon, T.;Gannibal, P. B.;Gannibal, P. B.;Garcia, D.;Gene, D. J.;Garcia, D.;Gene, D. J.;Garcia-Sandoval, S. R.;Garcia-Sandoval, S. R.;Senanayake, I. C.;Garzoli, L.;Gautam, A. K.;Wu, H. X.;Ghobad-Nejhad, M.;Giachini, A. J.;Goes-Neto, A.;Galindo, L. J.;Gorjon, S. P.;Goto, B. T.;Granados-Montero, M. M.;Granados-Montero, M. M.;Griffith, G. W.;Grossart, H. P.;Grossart, H. P.;Gueidan, C.;Baschien, C.;Yurkov, A.;Gusmao, L. F. P.;Gutierrez, A. C.;Chen, J.;Haelewaters, D.;Haelewaters, D.;Halling, R.;Halling, R.;Han, Y. F.;Hapuarachchi, K. K.;Zhao, C. L.;Harder, C. B.;Harrington, T. C.;Hattori, T.;Wu, W. P.;Healy, R.;Heredia, G.;Hodge, K. T.;Iturriaga, T.;Holgado-Rojas, M.;Holgado-Rojas, M.;Holgado-Rojas, M.;Hongsanan, S.;Hongsanan, S.;Horak, E.;Horak, E.;Hosoya, T.;Takamatsu, S.;Huang, S. K.;Hur, J. S.;Hustad, V. P.;Iotti, M.;Leonardi, M.;Rossi, W.;Jafar, E.;Xu, R.;Jayalal, R. G. U.;Jayasiri, S. C.;Jayawardena, R. S.;Jeewon, R.;Jeewon, R.;Jin, J.;Zafari, D.;Jones, E. B. G.;Zhang, H.;Justo, A.;Kaishian, P.;Kakishima, M.;Piepenbring, M.;Kang, G. P.;Tan, T. H.;Kang, G. P.;Tan, T. H.;Kang, J. C.;Karpov, S. A.;Karunarathna, S. C.;Kaufmann, M.;Kemler, M.;Kirchmair, M.;Neuhauser, S.;Peintner, U.;Zucconi, L.;Kitaura, M. J.;Klawonn, I;Kolarik, M.;Kong, A.;Kuhar, F.;Kukwa, M.;Kumar, S.;Kusan, I;Matocec, N.;Mesic, A.;Posta, A.;Tkalcec, Z.;Lado, C.;Larsson, K. H.;Larsson, K. H.;Latha, K. P. D.;Leontyev, D. L.;Leontyev, D. L.;Lestari, A. S.;Li, D. W.;Li, H. Y.;Li, L.;Lu, Y. Z.;Ma, J.;Zhang, J. Y.;Li, Q. R.;Wurzbacher, C.;Xiao, Y. P.;Lee, H. B.;Wijayawardene, N. N.;Lim, Y. W.;Lim, Y. W.;Lin, C. G.;Linde, C. C.;Liu, N. G.;Liu, N. G.;Liu, X. Y.;Liu, X. Z.;Wisitrassameewong, K.;Lumbsch, H. T.;Lumyong, S.;Lumyong, S.;White, J. F.;Zeng, N. K.;Madrid, H.;Magurno, F.;Magyar, D.;Mahadevan, N.;Mahadevan, N.;Maharachchikumbura, S. S. N.;Maimaiti, Y.;Raza, M.;Manamgoda, D. S.;Udayanga, D.;Wartchow, F.;Mardones, M.;Cedeno-Sanchez, M. L.;Marin-Felix, Y.;Stadler, M.;Cedeno-Sanchez, M. L.;Marin-Felix, Y.;Stadler, M.;Marquez, R.;Masigol, H.;May, T. W.;Yuan, H. S.;Mendieta, S.;Meng, Q. F.;Menkis, A.;Menolli, N., Jr.;Nascimento, C. C.;Silva-Filho, A. G. S.;Meza Calvo, J. G.;Miller, S. L.;Moncada, B.;Moncada, B.;Moncalvo, J. M.;Moncalvo, J. M.;Monteiro, J. S.;Monteiro, J. S.;Monteiro, M.;Mora-Montes, H. M.;Moreau, P. A.;Mueller, G. M.;Nagy, L. G.;Najafiniya, M.;Nascimento, C. C.;Nei, Y.;Neves, M. A.;Niego, A. G. T.;Nilsson, R. H.;Niskanen, T.;Niveiro, N.;Noordeloos, M. E.;Noordeloos, M. E.;Nunez Otano, N. B.;O'Donnell, R. P.;Oehl, F.;Olariaga, I;Orlando, O. P.;Pang, K. L.;Pang, K. L.;Papp, V;Pawlowska, J.;Pereira, O. L.;Perera, R. H.;Perera, R. H.;Perez-Moreno, J.;Perez-Ortega, S.;Peter, G.;Phillips, A. J. L.;Jeronimo, G. H.;Jesus, A. L.;Pires-Zottarelli, C. L. A.;Poinar, G.;Prieto, M.;Quandt, C. A.;Radek, R.;Rahnama, K.;Raj, K. N. A.;Rajeshkumar, K. C.;Sruthi, O. P.;Rama, T.;Rama, T.;Rambold, G.;Rasconi, S.;Ren, G. C.;Ren, G. C.;Robledo, G. L.;Flakus, A.;Rodriguez-Flakus, P.;Ryberg, M.;Ryvarden, L. R.;Salvador-Montoya, C. A.;Samant, B.;Sanchez-Castro, I;Sanchez-Garcia, M.;Sarma, V. V.;Savchenko, A.;Savchenko, K.;Saxena, R. K.;Scholler, M.;Selbmann, L.;Selcuk, F.;Senanayake, I. C.;Shen, Y. M.;Simmons, D. R.;Singh, R.;Sir, E. B.;Yu, Q.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stemler, J.;Stephenson, S. L.;Strassert, J. F. H.;Su, L.;Su, L.;Suetrong, S.;Norphanphoun, C.;Sun, Y. R.;Wang, Y.;Zeng, X. Y.;Svantesson, S.;Svantesson, S.;Takamatsu, S.;Tanaka, K.;Tang, A. M. C.;Tang, X.;Wei, D. P.;Tanney, J. B.;Taylor, J. E.;Taylor, P. W. J.;Tedersoo, L.;Zhang, F.;Zhang, J. F.;Thiyagaraja, V;Wanasinghe, D. N.;Tibell, L.;Tibell, S.;Tomsovsky, M.;Toome-Heller, M.;Yakovchenko, L.;Yang, H. D.;Yang, Z. L.;Yu, F. M.;Zeng, M.;Zhao, Q.;Tsurykau, A.;Tsurykau, A.;Untereiner, W. A.;Uzunov, B. A.;Valle, L. G.;Van den Wyngaert, S.;Van Vooren, N.;Velez, P.;Verma, R. K.;Vieira, W. A. S.;Vizzini, A.;Walker, A. K.;Yapa, N.;Joshi, Y.;Wang, S. X.;Wijesundara, D. S. A.;Xu, L. J.;Yu, Z. F.

    关键词：classification; nomenclature; scientific criticism; taxonomy

微信小程序