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麻竹miR172a靶基因DlAP2的克隆及其表达

文献类型: 中文期刊

作者: 高志民 1 ; 娄永峰 1 ; 王丽丽 1 ; 杨丽 1 ; 赵韩生 1 ; 陈东亮 1 ;

作者机构: 1.国际竹藤中心

关键词: 麻竹;AP2基因;miR172a;基因表达

期刊名称: 热带亚热带植物学报

ISSN: 1005-3395

年卷期: 2015 年 23 卷 03 期

页码: 245-251

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 为了解开花麻竹(Dendrocalamus latiflorus)的Dl AP2基因功能,采用RT-PCR和RACE技术克隆了mi R172a靶基因AP2同源序列c DNA全长,命名为Dl AP2。结果表明,Dl AP2基因c DNA全长为1729 bp,包含5′端非编码区81 bp、开放阅读框1464 bp、3′端非编码区160 bp和24个碱基的Poly A尾巴,在编码框靠近3′端130 bp处有1个高度匹配mi R172a的结合位点(CTGCAGCATCATCAGGATTCT)。Dl AP2编码487个氨基酸的蛋白,具有两个AP2结构域,属于AP2/ERF家族AP2亚家族的AP2组,与来自其它单子叶植物的AP2蛋白均有较高同源性。RLM-5′RACE分析表明,mi R172a主要在靶序列的第11~12个碱基之间剪切靶基因Dl AP2的mi RNA。q RT-PCR结果表明,麻竹花芽中Dl AP2基因的表达规律与mi R172a表达变化正好相反,证明mi R172a对Dl AP2基因的表达具有调控作用。

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