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利用改良型cDNA-AFLP技术筛选木薯干旱胁迫相关基因

文献类型： 中文期刊

作者： 王宇阳 1 ; 陈新 2 ; 夏志强 2 ; 陈青 1 ; 王文泉 2 ;

作者机构： 1.海南大学农学院

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词： cDNA-AFLP;抗旱;差异表达

期刊名称： 热带作物学报

ISSN： 1000-2561

年卷期： 2013 年 34 卷 06 期

页码： 1033-1040

收录情况： CSCD

摘要： cDNA-AFLP是一种经济且高通量的筛选和识别非生物胁迫下基因差异表达的实验技术。本研究对传统cDNA-AFLP技术进行改良,并利用改良型技术对木薯KU50和SC124不同程度干旱胁迫RNA样品进行基因差异表达分析。共获得68条差异表达的转录获得片段(transcript derived fragment,TDF),其中带有引入酶切位点的TDF为64条,预示cDNA-AFLP技术的改良初步获得成功。通过对TDF序列进行功能注释,其中31条TDF可找到已知功能的同源基因;20条为功能不明确的预测基因或蛋白;17条无同源序列,可能为新基因。按功能将31条已知功能的TDFs分类,分别为:能量代谢、糖类代谢、脂类代谢、细胞生长与凋亡、信号转导、转移运输、转录调节、遗传信息处理、多肽类合成与代谢。选择8个差异表达的TDF进行荧光定量PCR验证,发现这些TDF的确在干旱胁迫条件下显著上调或下调表达,证明改良型cDNA-AFLP技术体系为筛选差异表达基因的有效方法。

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