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胡麻SUC基因家族的鉴定与生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 齐燕妮 1 ; 李闻娟 1 ; 王利民 1 ; 赵玮 1 ; 党照 1 ; 谢亚萍 1 ; 张建平 1 ;

作者机构： 1.甘肃省农业科学院作物研究所

关键词： 胡麻;SUC基因家族;基因结构分析;系统进化分析

期刊名称： 甘肃农业科技

ISSN： 1001-1463

年卷期： 2019 年 08 期

页码： 35-40

摘要： 利用多个物种的SUC基因蛋白序列在胡麻基因组内进行BlastP分析,通过Pfam确认结构域,获得胡麻SUC基因家族成员,并进行基因结构分析;对蛋白分子量、等电点、信号肽、跨膜结构域、糖基化修饰位点、亚细胞定位、Motif及二级结构进行预测。结果鉴定得到12个胡麻SUC基因家族成员,大部分成员含有4个以上的外显子,10个以上跨膜结构域,并获4个特征性Motif。进化树分析显示,胡麻SUC分别属于SUT1、SUT2和SUT4家族。

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