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海南橡胶树暹罗刺盘孢菌群体遗传结构分析

文献类型: 中文期刊

作者: 曹学仁 1 ; 车海彦 1 ; 罗大全 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所农业部热带作物有害生物综合治理重点实验室

关键词: 橡胶树炭疽病;暹罗刺盘孢菌;ITS序列;群体遗传结构

期刊名称: 植物保护

ISSN: 0529-1542

年卷期: 2018 年 04 期

页码: 70-73+86

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 暹罗刺盘孢菌Colletotrichum siamense是引起海南橡胶树炭疽病的重要病原之一,为了明确海南橡胶树暹罗刺盘孢菌群体的遗传结构,本研究对海南5个市(县)的橡胶树暹罗刺盘孢菌的ITS序列进行分析。结果表明,58个病菌样品可推导出11种单倍型,其中单倍型H11包含样品数最多且在5个市(县)均有分布,其次为单倍型H4,在4个市(县)有分布。遗传分化指数(Fst)表明保亭种群与其他种群的遗传分化较大。AMOVA分析显示,遗传变异主要发生在种群内,占总变异的93.9%。对所有地理种群病原菌ITS序列的核苷酸不配对进行分析,表明病菌未经历过大规模的种群扩张。系统发育分析表明,来自相同地区的病菌单倍型并没有聚在一起。研究结果表明海南橡胶树暹罗刺盘孢菌种群具有丰富的遗传多样性。

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