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茄科植物木糖转移酶家族基因挖掘与进化分析

文献类型： 中文期刊

作者： 王鹏 1 ; 李慧 2 ; 简熠 2 ; 吕勇志 2 ; 盖江涛 3 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室

2.;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室

3.;中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所农业部华南作物基因资源与种质创制重点实验室;

关键词： 茄科;木糖转移酶;基因家族;结构域

期刊名称： 基因组学与应用生物学

ISSN： 1674-568X

年卷期： 2018 年 01 期

页码： 332-338

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 木糖转移酶在植物多糖合成以及蛋白糖链修饰中起重要作用。本研究试图从全基因组水平上系统鉴定植物木糖转移酶基因保守结构域,并挖掘茄科植物中木糖转移酶家族基因新成员。研究中选取了5种茄科植物,分析鉴定了茄科植物中的木糖转移酶基因及其保守结构域,并构建得到了系统发育树。系统鉴定获得了54条木糖转移酶家族基因。其中,矮牵牛基因组中含有6条家族成员,而在本氏烟中含有11条成员。本家族成员可分为5个亚家族,其中的两个亚家族各自能进一步分为两个显著的独立枝。在鉴定得到的基因中,仅有2条拟南芥基因功能得到了鉴定,分别参与蛋白糖基化和种皮多糖合成。拟南芥每条木糖转移酶基因仅含有1个保守结构域,而此结构域覆盖各基因大片区域。各基因编码蛋白分子量较大,且表现较强的疏水性。本研究为今后针对茄科植物木糖转移酶的深入研究提供了基因靶标。

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