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圭亚那柱花草新EST-SSR标记验证及其在柱花草属上的转移

文献类型: 中文期刊

作者: 丁西朋 1 ; 罗小燕 1 ; 贾庆麟 1 ; 白昌军 1 ;

作者机构: 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所

关键词: 柱花草;EST-SSR;标记开发;遗传多样性分析

期刊名称: 热带作物学报

ISSN: 1000-2561

年卷期: 2015 年 36 卷 10 期

页码: 1759-1768

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 柱花草(Stylosanthes spp.)是我国南方热带地区优良豆科牧草。为获得高效的柱花草分子标记,本课题组利用热研5号圭亚那柱花草(Stylosanthes guianensis)转录组测序数据开发了2008个EST-SSR标记。为验证新EST-SSR标记的有效性及在柱花草属中的通用性,本研究从中随机挑选117个EST-SSR标记并分析了其在圭亚那柱花草中的有效性及其在其他8种柱花草中的可转移性。结果表明,有98个EST-SSR标记可获得有效扩增,其中96个在不同柱花草种质间有多态性,每个标记检测出的等位基因2~11个,共检测到等位基因456个。98个EST-SSR标记在其他8种柱花草间的可转移率为82.2%~100%,其中69个标记在8种柱花草间都能有效扩增。

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