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数字化表达谱差异分析方法-DGE-P

文献类型： 中文期刊

作者： 孟凡超 1 ; 夏志强 2 ; 曾长英 2 ; 王文泉 2 ;

作者机构： 1.海南大学中国热带农业科学院热带生物技术研究所

2.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

关键词： tag-seq;数字化基因表达谱;差异显著性;标准化;软件

期刊名称： 现代生物医学进展

ISSN： 1673-6273

年卷期： 2013 年 02 期

页码： 340-343+359

摘要： 目的:目前,关于数字化表达谱差异分析的方法及软件极少,且需懂得R语言等,操作繁琐,这给数字表达谱分析带来了不少困难,DGE-P软件针对数字化表达谱开发的差异分析软件。方法:DGE-P软件,利用倍数分析及数字化基因表达谱差异基因检测方法,对通过本软件标准化后的数据进行差异显著性分析。结果:DGE-P软件包含了丰度统计、数据标准化、求倍数分析和p-value值三个模块。可得出倍数分析与数字化基因表达谱差异基因检测方法(p-value)两个值。结论:DGE-P较以前的差异分析软件相比是一款针对数字化表达谱分析的软件,克服了其他软件在无重复实验数据时无法避免误差的缺陷。并且DGE-P较其他的软件相比使用方便,可在windows系统下运行,操作简单。

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