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小果野蕉microRNAs及其靶基因的生物信息学预测

文献类型： 中文期刊

作者： 叶可勇 1 ; 陈瑶 2 ; 李瑞梅 1 ; 符少萍 1 ; 郭建春 1 ;

作者机构： 1.中国热带农业科学院热带生物技术研究所

2.中国热带农业科学院科技信息研究所

关键词： 小果野蕉;microRNAs(miRNAs);靶基因;生物信息学

期刊名称： 热带生物学报

ISSN： 1674-7054

年卷期： 2012 年 3 卷 03 期

页码： 222-227

摘要： 通过基于表达序列标签(EST)、基因组勘测序列(GSS)和高通量测序基因组序列(HTGS)的同源序列比对搜索,以及一系列的标准筛选,最终预测到属于8个家族的10条小果野蕉miRNAs。在线软件psRNATarget预测到24对miRNAs与靶基因的互作,这些靶基因主要参与小果野蕉的新陈代谢、生长发育以及胁迫响应等过程。

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