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擎天凤梨GAPDH基因的克隆及序列分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘建新 1 ; 张智 1 ; 丁华侨 1 ; 葛亚英 1 ; 王炜勇 1 ;

作者机构： 1.浙江省农业科学院花卉研究开发中心

关键词： 擎天凤梨;GAPDH;克隆

期刊名称： 浙江农业学报

ISSN： 1004-1524

年卷期： 2010 年 22 卷 06 期

页码： 722-726

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 管家基因GAPDH(glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase)常被用作定量、半定量PCR试验的内参,以确定目标基因的相对表达量。基于前期从全长cDNA文库中获得GAPDH基因的EST单克隆,进行PrimerWalking测序,获得一个GAPDH的全长cDNA序列,序列长1 790 bp,编码421个蛋白氨基酸,命名为GoGAP-DH1。采用Blast,ExPASy,ProtParam,SPOMA,Find Conserved Domains(NCBI),ClustalX,MEGA等生物信息学软件对cDNA序列、氨基酸序列、保守区、亲缘关系等特征进行分析。结果表明,GoGAPDH1与玉米的细胞质GAPDH基因源性最高,为82%。初步推断GoGAPDH1可能是一个胞质型GAPDH。

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