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基于SSR标记的苔草种质遗传多样性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 刘凌云 1 ; 范希峰 2 ; 滕珂 2 ; 韩朝 2 ; 温海峰 2 ; 张辉 2 ; 滕文军 2 ; 常智慧 1 ; 武菊英 2 ;

作者机构: 1.北京林业大学草业与草原学院

2.北京草业与环境研究发展中心

关键词: 苔草属;SSR分子标记;遗传多样性;聚类分析;DNA指纹图谱

期刊名称: 分子植物育种

ISSN:

年卷期: 2021 年 004 期

页码: 1250-1259

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 苔草属(Carex L.)植物为莎草科多年生草本,在园林绿化、畜牧业生产、生态修复等方面发挥着越来越重要的作用。为了了解新西兰苔草品种间的遗传多样性及与国内苔草的地域差异,对其进行分子标记分析。本研究利用筛选得到的10对SSR引物对12份苔草材料(包括10份新西兰引进品种)进行遗传多样性分析,结合聚类分析等揭示苔草材料之间的遗传多样性。结果显示,10对SSR引物最终扩增出91条多态性条带,据此建立的指纹图谱显示Ctcp016引物可以一次性鉴别12份苔草样品;多态性比率为97.8%,平均每条引物扩增出8.27条,多态性信息含量(PIC)在0.140~0.260之间,平均多态性信息含量为0.220,平均遗传距离值为0.428;12份参试苔草资源的观测等位基因数(Na)、有效等位基因数(Ne)、基因多样性指数(H)以及Shannon信息指数(I)平均值分别为1.976、1.350、0.226、0.368,表明各苔草样品之间的遗传多样性处于较高水平;非加权组平均(UPGMA)聚类系统发生树在遗传距离为0.428时可将12份苔草分为3类,地域对苔草遗传信息无明显影响。本研究表明利用SSR标记可以有效地对苔草遗传多样性及群体结构进行分析,并可构建苔草遗传图谱,为以后的研究提供丰富的标记来源,有助于推动苔草分子标记辅助育种工作,为进一步开发利用苔草资源提供帮助。

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