文献类型： 中文期刊
作者： 盖江涛 1 ; 乔飞 1 ; 罗朝鹏 1 ; 吕勇志 1 ; 王鹏 1 ;
作者机构： 1.中国热带农业科学院热带作物品种资源研究所;中国烟草总公司郑州烟草研究院
关键词： A622;尼古丁;砒啶类生物碱;进化
期刊名称： 分子植物育种
ISSN： 1672-416X
年卷期： 2018 年 23 期
页码： 7650-7655
收录情况： 北大核心 ; CSCD
摘要： A622基因在烟草砒啶类生物碱生物合成中起重要作用,其在茄科植物中的起源和进化还未有报道。本研究鉴定得到该基因含有NmrA-like家族结构域,且该结构域几乎覆盖A622基因全长。通过搜索栽培烟草、番茄、辣椒,以及咖啡和拟南芥基因组,得到了92条NmrA-like家族成员。将A622基因与拟南芥基因单独聚类,发现拟南芥基因大体分为两大枝;与A622聚在一起的枝中,含有已鉴定功能的PR基因。通过CLANS聚类,得到包含已知A622基因和拟南芥PR基因的46条基因。采用最大似然法,将此类基因进行进一步聚类,得到一个包含A622基因的亚家族,该亚家族含有1条拟南芥基因、1条咖啡基因、2条烟草基因以及3条番茄基因。本研究为将来进一步研究A622在茄科植物中的功能提供基础;结合对拟南芥基因(AT4G39230)的功能及关键位点鉴定,将能进一步阐明茄科植物A622基因的起源与进化。
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