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毛果杨CBF/DREB1基因家族生物信息学分析

文献类型: 中文期刊

作者: 丁咚 1 ; 陈亚娟 2 ; 崔进荣 2 ; 魏建华 2 ; 张玉红 2 ; 张杰伟 3 ;

作者机构: 1.东北林业大学森林植物生态学教育部重点实验室;北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心农业基因资源与生物技术北京市重点实验室

2.;东北林业大学森林植物生态学教育部重点实验室;北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心农业基因资源与生物技术北京市重点实验室

3.;东北林业大学森林植物生态学教育部重点实验室;北京市农林科学院北京农业生物技术研究中心农业基因资源与生物技术北京市重点实验室;

关键词: 杨树;CBF/DREB1;基因家族;进化分析

期刊名称: 西南农业学报

ISSN: 1001-4829

年卷期: 2018 年 03 期

页码: 457-461

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】为了对毛果杨CBF基因家族进行系统分析,利用毛果杨基因组数据库,通过生物信息学的方法,鉴定毛果杨CBF基因家族的染色体定位、编码蛋白和磷酸化位点预测。【方法】通过序列比对进行进化和分类分析。【结果】毛果杨含有6个CBF基因,均不含内显子,分布于毛果杨的5条染色体上。【结论】MEME保守基序分析显示,杨树CBF蛋白均含有2个保守的基序,他们共同构成AP2结构域。磷酸化位点预测分析表明毛果杨CBF蛋白均含有大量的磷酸化位点。以上结果将为今后揭示毛果杨CBF蛋白的功能提供重要的线索。

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