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杂交兰实时荧光定量PCR内参基因的筛选

文献类型: 中文期刊

作者: 林榕燕 1 ; 钟淮钦 2 ; 黄敏玲 2 ; 樊荣辉 2 ; 吴建设 3 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院作物研究所;福建省农业科学院花卉研究中心;福建省特色花卉工程技术研究中心

2.;福建省农业科学院作物研究所;福建省农业科学院花卉研究中心;福建省特色花卉工程技术研究中心

3.;福建省农业科学院作物研究所;福建省农业科学院花卉研究中心;福建省特色花卉工程技术研究中心;

关键词: 杂交兰;实时荧光定量PCR;内参基因;表达稳定性

期刊名称: 中国细胞生物学学报

ISSN: 1674-7666

年卷期: 2018 年 03 期

页码: 381-389

收录情况: CSCD

摘要: 为了给杂交兰的基因功能表达和调控研究提供内参基因,本研究采取同源克隆方法和RT-PCR技术,以杂交兰‘黄金小神童’叶片为材料,分离杂交兰Ch18S r RNA、Ch28S r RNA、Ch ACT、Ch TUA、Ch TUB、Ch UBQ、Ch EF-1α和Chrpo B基因的片段,以10个不同品种杂交兰叶片及‘黄金小神童’花器官不同部位为材料,利用实时荧光定量PCR(Real-time quantitative PCR,q PCR)检测分析各引物的扩增效率和相对表达量,采用ge Norm、Norm Finder和Best Keeper软件对各个候选内参基因的表达稳定性进行分析,并通过研究杂交兰花器官不同部位Ch PDS基因的表达模式来验证筛选得到的内参基因的可靠性。结果显示,各引物扩增的片段长度分别为171 bp、148 bp、183 bp、146 bp、130 bp、147 bp、203 bp、139 bp,扩增效率分别为1.94、2.19、1.88、1.99、2.12、2.20、2.11、1.98。综合3个软件的评价结果发现,杂交兰不同品种叶片中最佳内参基因为Ch ACT,不同花器官部位中最稳定内参基因为Ch ACT、Ch TUB、Ch UBQ和Ch EF-1α;而对于实验中所有样品来说,内参基因稳定性最高的为Ch TUB;说明不同的实验条件下,所需的内参基因不同。Ch PDS基因相对表达水平分析结果证实了所筛选内参基因的可靠性,以Ch UBQ、Ch EF-1α、Ch TUB、Ch ACT及Ch UBQ和Ch EF-1α基因组合进行校正的Ch PDS基因的相对表达量均为花瓣>唇瓣>蕊柱。

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