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小麦抗旱相关基因TaCRT-D单核苷酸多态性分析

文献类型: 中文期刊

作者: 王计平 1 ; 毛新国 2 ; 景蕊莲 3 ; 李润植 4 ; 昌小平 3 ;

作者机构: 1.中国农业科学院作物科学研究所农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程/农业部作物种质资源利用重点开放实验室北京山西农业大学农学院

2.中国农业科学院作物科学研究所农作物基因资源与基因改良国家重大科学工程农业部作物种质资源与生物技术重点开放实验室

3.中国农业科学院作物品种资源研究所

4.国家谷子改良中心/河北省农林科学院谷子研究所

关键词: 小麦;TaCRT-D基因;单核苷酸多态性;单倍型;抗旱性

期刊名称: 中国农业科学

ISSN: 0578-1752

年卷期: 2008 年 41 卷 12 期

页码: 3983-3990

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 【目的】钙网蛋白(CRT)是细胞内质网膜上的钙结合蛋白,参与多种细胞功能的调节。研究小麦钙网蛋白基因TaCRT-D单核苷酸多态性,并分析其与抗旱性的关系。【方法】以苗期抗旱性不同的37份六倍体普通小麦和3份普通小麦D基因组供体种粗山羊草为材料,通过直接测序分析TaCRT-D基因的单核苷酸多态性(SNP)及其与抗旱性的关系。【结果】TaCRT-D基因DNA长度为4 001 bp,在长达160 040 bp的核苷酸序列中共检测到105个单核苷酸变异位点,包括84个SNP和21个InDel,二者出现的频率分别为1/1 905和1/7 621,编码区的核苷酸多样性值(π)小于非编码区,说明编码区所承受的选择压力较大,遗传变异小于非编码区。单倍型分析表明,40份供试材料分为8种单倍型,其中单倍型H1中11份材料包括4份中等抗旱材料和7份干旱敏感材料;单倍型H3、H4和H7既有抗旱性强的材料也有干旱敏感材料;单倍型H5只包括3份小麦D基因组供体种材料。【结论】普通小麦TaCRT-D基因中SNP频率较低,TaCRT-D基因单核苷酸多态性与小麦苗期抗旱性之间没有明显的对应关系。

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