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甘肃黄芪资源的遗传多样性和聚类分析

文献类型： 中文期刊

作者： 厚毅清 1 ; 张艳萍 1 ; 石有太 1 ; 刘新星 1 ; 陈玉梁 1 ;

作者机构： 1.甘肃省农业科学院生物技术研究所

关键词： SSR;遗传多样性;黄芪;聚类分析

期刊名称： 中药材

ISSN： 1001-4454

年卷期： 2016 年 39 卷 06 期

页码： 1241-1246

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 目的:对甘肃省药用黄芪资源的遗传现状展开调查。方法:采集甘肃主栽地区的黄芪资源,利用SSR分子标记技术进行遗传多样性分析和聚类分析。结果:9对SSR引物对甘肃6处主栽地区的57份样本进行PCR扩增,PCR产物分子量在100~500 bp之间,多态性位点82个,多态性比率为97.56%,平均每条引物的多态信息含量为0.438。在物种水平上,等位变异数为1.976,有效等位基因数为1.459,Nei's基因多样性指数为0.279,Shannon信息指数为0.431,居群内遗传多样度为0.248,居群间遗传分化系数为0.117,基因流系数为3.775,不同居群间遗传一致度为0.896~0.977。结论:甘肃主栽地区的黄芪资源种质较为纯正,具有丰富的遗传多样性,其遗传变异主要来自居群内部,居群间基因交流频繁,居群间亲缘关系的远近与它们的地理距离大致相同。此外,聚类分析结果显示,参试SSR引物在相似度0.46处可辨别岩黄芪属与黄芪属,黄芪属中的蒙古黄芪、膜荚黄芪及东俄洛黄芪不能区分。

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