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水稻簇生穗基因OsCl-6的精细定位与候选基因分析

文献类型: 中文期刊

作者: 郑燕梅 1 ; 苏德文 1 ; 蒋家焕 1 ; 朱永生 1 ; 魏毅东 1 ; 陈丽萍 1 ; 连玲 1 ; 王颖姮 1 ; 蔡秋华 1 ; 谢鸿光 1 ; 谢华安 1 ; 张建福 1 ;

作者机构: 1.福建省农业科学院水稻研究所;农业部华南杂交水稻种质创新与分子育种重点实验室/福州(国家)水稻改良分中心/福建省作物分子育种工程实验室/福建省水稻分子育种重点实验室/福建省作物种质创新与分子育种省部共建国家重点实验室培育基地/杂交水稻国家重点实验室华南基地/水稻国家工程实验室

关键词: 水稻;簇生穗;水稻簇生穗基因(OsCl-6);精细定位;克隆;序列分析

期刊名称: 农业生物技术学报

ISSN: 1674-7968

年卷期: 2018 年 07 期

页码: 1116-1123

收录情况: 北大核心 ; CSCD

摘要: 水稻(Oryza sativa)穗部性状的改良对水稻产量提高和品种提升具有重要意义。水稻簇生穗的研究有助于了解水稻的穗发育以及相应基因的调控方式。本研究通过构建籼稻(O.sativa ssp.indica)簇生穗材料内江P164和单粒稻9311的正交和反交群体,确定该性状为单基因不完全显性遗传。通过混合群体分离分析法和隐性群体分析法将该基因定位于第6染色体长臂标记ID441和ID020之间,区间内预测有23个基因。推测LOC_Os06g39650为候选基因,并对候选基因进行克隆,测序表明该基因(命名为:水稻簇生穗基因(O.sativa clustered spikelets gene-6,OsCl-6))CDS的第1 556的碱基发生了突变,由A突变为G,碱基的改变造成氨基酸序列发生突变,第519位的氨基酸由天冬酰胺(N)突变为丝氨酸(S),推测从而形成簇生穗性状,进一步对6个非簇生粳稻品种和7个非簇生籼稻品种进行测序分析,结果表明,OsCl-6基因可能是簇生穗基因短花梗(shortened pedicels)sped1-D的等位基因。本研究为阐明水稻穗簇生形成机理以及选育穗大、着粒密度高的水稻新品种提供了基因资源。

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