文献类型： 中文期刊

作者： 郝子义 ¹ ; 刘天鹏 ² ; 何继红 ² ; 董孔军 ² ; 任瑞玉 ² ; 张磊 ² ; 韦恒 ¹ ; 李亚伟 ² ; 杨天育 ¹ ;

作者机构： 1.甘肃农业大学生命科学技术学院

2.甘肃省农业科学院作物研究所

关键词： 糜子;SBP基因家族;转录因子;生物信息学分析;表达特征

期刊名称： 甘肃农业大学学报

ISSN： 1003-4315

年卷期： 2025 年 60 卷 004 期

页码： 65-77

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： [目的]了解糜子SBP基因家族及在其籽粒稃壳色形成中的表达特征.[方法]采用生物信息学方法,全基因组鉴定了含有SBP结构域的SBP基因家族成员,并进一步分析了其染色体分布、蛋白理化性质、系统进化关系、基因结构、保守结构域、启动子区域的顺式作用元件及在糜子白、黄、褐籽粒稃壳色形成中的表达特征.[结果]糜子含有38个SBP基因,不均匀的分布在18条染色体上,PmSBP蛋白的氨基酸序列长度为122-1 109 aa,等电点为5.49-10.32,家族成员含有1-11个外显子,亚细胞定位于细胞核、叶绿体中.糜子38个SBP基因的蛋白聚类分析显示,该蛋白家族可分为Ⅰ、Ⅱ、Ⅲ、Ⅳ和Ⅴ 5个亚家族,亚家族Ⅲ成员具有相对复杂的结构.顺式作用元件分析显示,在糜子SBP家族基因存在共同的顺式作用元件,如光响应、激素响应、分生组织表达和调控种子特异性等.白、黄、褐色籽粒品种晋黍8号、陇糜12号和张778稃壳色形成期转录组及qRT-PCR分析显示,糜子SBP基因家族成员中 PmSBP33、PmSBP8、PmSBP17、PmSBP37、PmSBP12、PmSBP14、PmSBP1、PmSBP7、PmSBP23 和PmSBP16在3个品种籽粒中的表达量较高,且品种间表达量差异显著.通过与谷子、拟南芥和水稻同源基因比对,推测PmSBP1和PmSBP7与糜子籽粒发育相关.[结论]鉴定出38个糜子SBP基因家族成员,在糜子籽粒稃壳中的表达量差异明显,且PmSBP1和PmSBP7与糜子籽粒形态建成密切相关.