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多主棒孢菌调控致病性相关基因CCK1的克隆及生物信息学分析

文献类型： 中文期刊

作者： 刘晓妹 1 ; 蒲金基 2 ; 张欣 2 ; 漆艳香 2 ; 谢艺贤 2 ; 张贺 2 ; 郑服丛 1 ;

作者机构： 1.海南大学环境与植物保护学院

2.中国热带农业科学院环境与植物保护研究所

关键词： 多主棒孢菌;蛋白激酶;克隆;生物学信息

期刊名称： 生物技术通报

ISSN： 1002-5464

年卷期： 2012 年 0 卷 10 期

页码： 168-172

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 采用同源克隆、SEFA-PCR和RT-PCR技术克隆获得了多主棒孢菌(Corynespora cassiicola)CCK1基因的DNA和cDNA。生物信息学分析表明,该基因DNA和cDNA全长分别为2 710 bp和1 065 bp,编码区含4个内含子(长53、54、50和56bp),推测编码354个氨基酸,其分子量约40.98 kD,等电点(pI)6.43。从GenBank搜索相似蛋白和构建进化树发现,CCK1与多个丝状真菌调控致病性相关的PMK1类MAPK蛋白聚为一类,且含1个参与双重磷酸化作用的MAPK蛋白激活域TEY和1个Ser/Thr蛋白激酶保守结构域。推测CCK1基因可能参与调控C.cassiicola菌丝生长、产孢和致病性等。

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