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红麻干旱响应基因EST-SSR标记

文献类型： 中文期刊

作者： 金关荣 1 ; 安霞 1 ; 骆霞虹 1 ; 陈常理 1 ; 李文略 1 ; 李苹芳 1 ; 田丹青 1 ; 王斌 1 ; 吴文嫱 1 ; 朱关林 1 ;

作者机构： 1.浙江省萧山棉麻研究所浙江省农业科学院花卉研究开发中心;中国热带农业科学院;海南大学

关键词： 红麻;干旱;基因;分子标记

期刊名称： 分子植物育种

ISSN： 1672-416X

年卷期： 2018 年 14 期

页码： 4735-4742

收录情况： 北大核心 ; CSCD

摘要： 本研究以前期高通量测序结果为基础,利用MISA软件分析了所获得的转录组数据的SSR位点,发掘了11个EST-SSR标记。这11个EST-SSR标记了红麻响应干旱胁迫的关键基因外显子区的简单重复序列多态性,并且在遗传变异来源广泛的红麻品种中具有多态性,可以区分44个红麻品种。通过5个红麻品种的初步筛选和44个红麻品种的验证,这11个多态性标记可稳定检测,可以直接将本研究所开发的标记应用于更多红麻品种的检测,进行种质资源分子遗传多样性评价、亲缘关系鉴定和关键抗旱基因的特定外显子区简单重复序列多态性分析,为红麻分子标记辅助育种提供良好的标记储备,也为红麻自然变异中筛选关键基因的功能等位变异提供一种检测的候选分子标记。

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